Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Olfr920-201ENSMUST00000074740 5711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.76
Ccl20O89093 Dnah7c-204ENSMUST00000189749 12207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.76
Ccl20O89093 Olfr1176-202ENSMUST00000213778 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
Ccl20O89093 Vav3-202ENSMUST00000106576 3123 ntTSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
Ccl20O89093 A730046J19Rik-201ENSMUST00000135687 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
Ccl20O89093 Trav6n-6-201ENSMUST00000103613 287 ntAPPRIS P1 BASIC4.08□□□□□ -1.76
Ccl20O89093 4930404H24Rik-201ENSMUST00000109783 331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
Ccl20O89093 Serpinb6c-201ENSMUST00000110273 1325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
Ccl20O89093 Olfr1292-ps1-201ENSMUST00000118137 939 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
Ccl20O89093 Gm11822-201ENSMUST00000119177 415 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
Ccl20O89093 Gm15288-201ENSMUST00000126640 653 ntTSL 3 BASIC4.08□□□□□ -1.76
Ccl20O89093 2210408F21Rik-203ENSMUST00000133510 429 ntTSL 3 BASIC4.08□□□□□ -1.76
Ccl20O89093 Gm23673-201ENSMUST00000157474 298 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
Ccl20O89093 Gm26211-201ENSMUST00000158578 129 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
Ccl20O89093 Plch1-209ENSMUST00000161052 1472 ntTSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
Ccl20O89093 Glcci1-203ENSMUST00000161494 3248 ntTSL 2 BASIC4.08□□□□□ -1.76
Ccl20O89093 Agtr1b-202ENSMUST00000163776 1633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
Ccl20O89093 Gm17711-201ENSMUST00000172028 237 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
Ccl20O89093 Gm28889-201ENSMUST00000185350 959 ntTSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
Ccl20O89093 Gm29426-202ENSMUST00000186564 536 ntTSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
Ccl20O89093 Olfr1215-201ENSMUST00000188399 943 ntAPPRIS P1 BASIC4.08□□□□□ -1.76
Ccl20O89093 Gm29000-207ENSMUST00000190152 1160 ntTSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
Ccl20O89093 Gm43668-201ENSMUST00000197014 5342 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
Ccl20O89093 Gm5284-201ENSMUST00000199053 903 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
Ccl20O89093 Gm42520-201ENSMUST00000199642 1502 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
Ccl20O89093 Gm43136-201ENSMUST00000200403 636 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
Ccl20O89093 B130024G19Rik-205ENSMUST00000207952 485 ntTSL 3 BASIC4.08□□□□□ -1.76
Ccl20O89093 Gm4541-201ENSMUST00000208901 1848 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
Ccl20O89093 Gm6145-201ENSMUST00000209522 710 ntTSL 3 BASIC4.08□□□□□ -1.76
Ccl20O89093 Olfr616-202ENSMUST00000214806 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
Ccl20O89093 Olfr1097-202ENSMUST00000217403 4430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
Ccl20O89093 Gm19073-201ENSMUST00000219978 555 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
Ccl20O89093 AC166358.9-201ENSMUST00000220653 375 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
Ccl20O89093 1700129C05Rik-201ENSMUST00000022548 1067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
Ccl20O89093 AC192088.3-201ENSMUST00000227858 831 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
Ccl20O89093 AC146601.1-201ENSMUST00000227910 905 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
Ccl20O89093 AC154484.2-201ENSMUST00000228359 818 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
Ccl20O89093 4930583I09Rik-201ENSMUST00000024896 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
Ccl20O89093 Fcer1a-201ENSMUST00000049706 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
Ccl20O89093 Olfr1325-201ENSMUST00000054541 948 ntAPPRIS P2 BASIC4.08□□□□□ -1.76
Ccl20O89093 Olfr510-201ENSMUST00000076289 945 ntAPPRIS P1 BASIC4.08□□□□□ -1.76
Ccl20O89093 Gmfg-201ENSMUST00000078845 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
Ccl20O89093 Fus-202ENSMUST00000079045 2623 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
Ccl20O89093 Gm6065-201ENSMUST00000081336 492 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
Ccl20O89093 Gm25140-201ENSMUST00000083254 140 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
Ccl20O89093 Olfr1471-201ENSMUST00000096203 945 ntAPPRIS P1 BASIC4.08□□□□□ -1.76
Ccl20O89093 Olfr199-201ENSMUST00000099657 931 ntAPPRIS P1 BASIC4.08□□□□□ -1.76
Ccl20O89093 Pak3-204ENSMUST00000112865 8484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
Ccl20O89093 Mga-203ENSMUST00000110773 13577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
Ccl20O89093 Olfr91-203ENSMUST00000217372 3809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
Ccl20O89093 Gm2824-202ENSMUST00000180955 3522 ntTSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
Ccl20O89093 Gm38125-201ENSMUST00000194136 3438 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
Ccl20O89093 Akr1c14-202ENSMUST00000118717 3183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
Ccl20O89093 AC144772.3-201ENSMUST00000228829 3126 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
Ccl20O89093 Nlrp9a-203ENSMUST00000117252 2796 ntTSL 2 BASIC4.08□□□□□ -1.76
Ccl20O89093 Kynu-202ENSMUST00000050511 2778 ntTSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
Ccl20O89093 Adam25-201ENSMUST00000096663 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
Ccl20O89093 Mcmdc2-205ENSMUST00000171802 2553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
Ccl20O89093 Vmn1r39-203ENSMUST00000227285 2245 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.07□□□□□ -1.76
Ccl20O89093 Prkdc-201ENSMUST00000023352 12647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
Ccl20O89093 Neat1-201ENSMUST00000173672 20771 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
Ccl20O89093 Ckap5-204ENSMUST00000111338 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
Ccl20O89093 Gm37356-201ENSMUST00000193362 1613 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
Ccl20O89093 Gm4166-201ENSMUST00000220893 2996 ntTSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
Ccl20O89093 Ctsj-202ENSMUST00000224224 1421 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.07□□□□□ -1.76
Ccl20O89093 Spp1-202ENSMUST00000086833 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
Ccl20O89093 Kif20b-201ENSMUST00000087341 5564 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
Ccl20O89093 Akap6-201ENSMUST00000095737 14847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
Ccl20O89093 Gm24541-201ENSMUST00000103871 96 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
Ccl20O89093 Gm12062-201ENSMUST00000117533 259 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
Ccl20O89093 Gm6305-201ENSMUST00000121027 1012 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
Ccl20O89093 Olfr1118-201ENSMUST00000121296 996 ntAPPRIS P2 BASIC4.07□□□□□ -1.76
Ccl20O89093 Gm14784-201ENSMUST00000121604 663 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
Ccl20O89093 Gm22106-201ENSMUST00000122544 127 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
Ccl20O89093 Gm12114-201ENSMUST00000147896 656 ntTSL 3 BASIC4.07□□□□□ -1.76
Ccl20O89093 Gm12707-201ENSMUST00000155789 489 ntTSL 3 BASIC4.07□□□□□ -1.76
Ccl20O89093 Mog-202ENSMUST00000167275 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
Ccl20O89093 Mir6973b-201ENSMUST00000184185 80 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
Ccl20O89093 Gm3145-201ENSMUST00000188584 220 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
Ccl20O89093 Gm28769-201ENSMUST00000190176 615 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
Ccl20O89093 Gm37095-201ENSMUST00000195421 205 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
Ccl20O89093 AC133189.1-201ENSMUST00000198820 140 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
Ccl20O89093 1110060G06Rik-201ENSMUST00000200372 499 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
Ccl20O89093 Gm45660-201ENSMUST00000210267 151 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
Ccl20O89093 AC159238.1-201ENSMUST00000220699 343 ntTSL 3 BASIC4.07□□□□□ -1.76
Ccl20O89093 Zfp429-203ENSMUST00000224684 524 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
Ccl20O89093 Clec2j-201ENSMUST00000032517 515 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
Ccl20O89093 Mlip-201ENSMUST00000034910 1227 ntTSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
Ccl20O89093 Olfr1153-201ENSMUST00000052300 957 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
Ccl20O89093 Gm22155-201ENSMUST00000083836 162 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
Ccl20O89093 Olfr143-201ENSMUST00000093865 942 ntAPPRIS P2 BASIC4.07□□□□□ -1.76
Ccl20O89093 Olfr633-201ENSMUST00000098188 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.07□□□□□ -1.76
Ccl20O89093 Olfr201-201ENSMUST00000099656 927 ntAPPRIS P1 BASIC4.07□□□□□ -1.76
Ccl20O89093 Gm38101-201ENSMUST00000193484 3557 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
Ccl20O89093 Mlip-205ENSMUST00000183955 3069 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
Ccl20O89093 Zfp143-201ENSMUST00000084727 3003 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
Ccl20O89093 Olfr1297-202ENSMUST00000213398 6998 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.07□□□□□ -1.76
Ccl20O89093 Gm45378-201ENSMUST00000211063 2711 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
Ccl20O89093 Cmah-206ENSMUST00000167746 9727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
Ccl20O89093 Stag2-202ENSMUST00000115072 5955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.2 ms