Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGA3

Lrrtm2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm2Q8BGA3 Apob-202ENSMUST00000037811 13934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
Lrrtm2Q8BGA3 Stag2-201ENSMUST00000069619 5825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
Lrrtm2Q8BGA3 Nop58-215ENSMUST00000191142 9507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
Lrrtm2Q8BGA3 C430019N01Rik-201ENSMUST00000199517 1567 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Lrrtm2Q8BGA3 Gm28394-201ENSMUST00000186805 1495 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
Lrrtm2Q8BGA3 Gm28570-201ENSMUST00000188300 1495 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
Lrrtm2Q8BGA3 Olfr813-202ENSMUST00000204622 2410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
Lrrtm2Q8BGA3 A530083M17Rik-201ENSMUST00000199877 3376 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Lrrtm2Q8BGA3 Herc2-201ENSMUST00000076226 15250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
Lrrtm2Q8BGA3 Gm12931-201ENSMUST00000117046 324 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Lrrtm2Q8BGA3 Gm11550-201ENSMUST00000118210 699 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Lrrtm2Q8BGA3 Gm7657-201ENSMUST00000118851 666 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Lrrtm2Q8BGA3 H3f3c-201ENSMUST00000119459 411 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Lrrtm2Q8BGA3 Gm15388-201ENSMUST00000121578 726 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Lrrtm2Q8BGA3 Gm15171-201ENSMUST00000122191 334 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Lrrtm2Q8BGA3 Gm23837-201ENSMUST00000122656 286 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Lrrtm2Q8BGA3 St8sia3os-201ENSMUST00000123473 652 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
Lrrtm2Q8BGA3 1700007M16Rik-201ENSMUST00000129075 435 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
Lrrtm2Q8BGA3 Gm5699-201ENSMUST00000152491 723 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Lrrtm2Q8BGA3 Gm7609-204ENSMUST00000161424 461 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Lrrtm2Q8BGA3 Kcne1-202ENSMUST00000166707 601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
Lrrtm2Q8BGA3 Gm37682-201ENSMUST00000191776 522 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Lrrtm2Q8BGA3 Gm34882-201ENSMUST00000193245 974 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
Lrrtm2Q8BGA3 Gm32554-201ENSMUST00000196310 970 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
Lrrtm2Q8BGA3 Csn2-209ENSMUST00000199624 890 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
Lrrtm2Q8BGA3 Gm43093-201ENSMUST00000202439 1213 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Lrrtm2Q8BGA3 Gm18215-201ENSMUST00000204429 798 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Lrrtm2Q8BGA3 Gm45524-201ENSMUST00000211374 1250 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
Lrrtm2Q8BGA3 Gm18997-201ENSMUST00000216353 822 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Lrrtm2Q8BGA3 AC164576.1-201ENSMUST00000218783 693 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
Lrrtm2Q8BGA3 AC157515.1-201ENSMUST00000220953 450 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Lrrtm2Q8BGA3 AC153153.2-201ENSMUST00000223572 411 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Lrrtm2Q8BGA3 AC163646.1-201ENSMUST00000227704 397 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Lrrtm2Q8BGA3 Olfr190-201ENSMUST00000071243 924 ntAPPRIS P1 BASIC4.71□□□□□ -1.66
Lrrtm2Q8BGA3 Csn2-201ENSMUST00000082370 1117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
Lrrtm2Q8BGA3 Vmn1r185-205ENSMUST00000227461 5318 ntAPPRIS P1 BASIC4.71□□□□□ -1.66
Lrrtm2Q8BGA3 Nlrp4g-201ENSMUST00000067621 2030 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Lrrtm2Q8BGA3 Vmn1r217-202ENSMUST00000227110 9888 ntAPPRIS P1 BASIC4.71□□□□□ -1.66
Lrrtm2Q8BGA3 Acer3-201ENSMUST00000033020 11340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
Lrrtm2Q8BGA3 Rmi1-204ENSMUST00000225815 2447 ntAPPRIS P1 BASIC4.71□□□□□ -1.66
Lrrtm2Q8BGA3 Vmn1r171-207ENSMUST00000227774 2867 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
Lrrtm2Q8BGA3 Aspn-201ENSMUST00000021820 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
Lrrtm2Q8BGA3 Tfec-201ENSMUST00000031533 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
Lrrtm2Q8BGA3 Scn7a-201ENSMUST00000042792 7338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
Lrrtm2Q8BGA3 Klhl28-203ENSMUST00000222508 6459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
Lrrtm2Q8BGA3 Olfr1083-ps-201ENSMUST00000117704 943 ntAPPRIS P1 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Lrrtm2Q8BGA3 Gm15421-202ENSMUST00000118224 399 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Lrrtm2Q8BGA3 Gm14352-201ENSMUST00000119250 449 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Lrrtm2Q8BGA3 Gm14603-201ENSMUST00000121275 448 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Lrrtm2Q8BGA3 Gm12332-201ENSMUST00000121397 922 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Lrrtm2Q8BGA3 Gm11714-201ENSMUST00000136927 876 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
Lrrtm2Q8BGA3 Gm14697-201ENSMUST00000147144 648 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
Lrrtm2Q8BGA3 Gm25271-201ENSMUST00000157273 290 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Lrrtm2Q8BGA3 Gm26310-201ENSMUST00000157766 117 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Lrrtm2Q8BGA3 Gm23546-201ENSMUST00000158211 137 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Lrrtm2Q8BGA3 Gm20618-202ENSMUST00000177482 1227 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Lrrtm2Q8BGA3 Gm26925-201ENSMUST00000182470 957 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Lrrtm2Q8BGA3 Gm27818-201ENSMUST00000184536 159 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Lrrtm2Q8BGA3 Gm28962-201ENSMUST00000187993 621 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Lrrtm2Q8BGA3 Gm21617-201ENSMUST00000188297 691 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Lrrtm2Q8BGA3 Gm28692-202ENSMUST00000189645 621 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Lrrtm2Q8BGA3 Trav7d-5-201ENSMUST00000197128 340 ntAPPRIS P1 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Lrrtm2Q8BGA3 4930599N24Rik-201ENSMUST00000198822 1003 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Lrrtm2Q8BGA3 Gm18330-201ENSMUST00000199246 547 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Lrrtm2Q8BGA3 Trav7n-5-201ENSMUST00000199753 340 ntAPPRIS P1 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Lrrtm2Q8BGA3 Gm44048-201ENSMUST00000204531 361 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Lrrtm2Q8BGA3 Gm45272-202ENSMUST00000209875 502 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Lrrtm2Q8BGA3 Mir670hg-207ENSMUST00000211619 819 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Lrrtm2Q8BGA3 Gm21041-201ENSMUST00000214829 823 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Lrrtm2Q8BGA3 AC164087.1-201ENSMUST00000215174 733 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Lrrtm2Q8BGA3 1700129C05Rik-201ENSMUST00000022548 1067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
Lrrtm2Q8BGA3 Mup14-201ENSMUST00000071005 652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Lrrtm2Q8BGA3 Gm23514-201ENSMUST00000082827 130 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Lrrtm2Q8BGA3 Mrgprb3-201ENSMUST00000094383 1009 ntAPPRIS P1 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Lrrtm2Q8BGA3 Wfdc9-201ENSMUST00000099095 252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Lrrtm2Q8BGA3 Defb25-201ENSMUST00000099203 293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
Lrrtm2Q8BGA3 Zfp738-203ENSMUST00000137496 13215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
Lrrtm2Q8BGA3 Gm43281-201ENSMUST00000202522 2704 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Lrrtm2Q8BGA3 Fap-201ENSMUST00000000402 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Lrrtm2Q8BGA3 Olfr124-202ENSMUST00000215168 4497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Lrrtm2Q8BGA3 Obox5-201ENSMUST00000098802 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
Lrrtm2Q8BGA3 Gm15624-203ENSMUST00000204811 3402 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Lrrtm2Q8BGA3 Olfr733-204ENSMUST00000216195 3669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Lrrtm2Q8BGA3 Fbxw15-201ENSMUST00000056745 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
Lrrtm2Q8BGA3 Gm35629-201ENSMUST00000209684 2241 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Lrrtm2Q8BGA3 Cd44-202ENSMUST00000060516 3495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
Lrrtm2Q8BGA3 Ccna2-205ENSMUST00000196316 2001 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Lrrtm2Q8BGA3 Gm3115-201ENSMUST00000166928 1797 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Lrrtm2Q8BGA3 Gm2888-201ENSMUST00000170521 1758 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Lrrtm2Q8BGA3 Gm7876-202ENSMUST00000171305 1758 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Lrrtm2Q8BGA3 Tmem167-201ENSMUST00000012566 1541 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Lrrtm2Q8BGA3 Gm42910-201ENSMUST00000198917 2921 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Lrrtm2Q8BGA3 Rif1-201ENSMUST00000112693 8509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Lrrtm2Q8BGA3 Gm24170-201ENSMUST00000104124 133 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Lrrtm2Q8BGA3 Gm23746-201ENSMUST00000104229 125 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Lrrtm2Q8BGA3 Gm13195-201ENSMUST00000117229 261 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Lrrtm2Q8BGA3 Gm15012-201ENSMUST00000119176 106 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Lrrtm2Q8BGA3 Smt3h2-ps-201ENSMUST00000121084 285 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Lrrtm2Q8BGA3 Rps10-ps3-201ENSMUST00000122317 500 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Lrrtm2Q8BGA3 Gm14027-201ENSMUST00000135186 622 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.3 ms