Protein–RNA interactions for Protein: O35599

Opn1mw, Medium-wave-sensitive opsin 1, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn1mwO35599 Gm26691-202ENSMUST00000181952 4183 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Opn1mwO35599 Ranbp3l-201ENSMUST00000053308 3017 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Opn1mwO35599 Olfr2-206ENSMUST00000216375 5828 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Opn1mwO35599 Esp3-201ENSMUST00000177574 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Opn1mwO35599 Gm42798-201ENSMUST00000200853 3972 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Opn1mwO35599 Olfr137-202ENSMUST00000213505 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Opn1mwO35599 Cyp4a28-ps-201ENSMUST00000121884 1477 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Opn1mwO35599 1700080O16Rik-201ENSMUST00000033449 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Opn1mwO35599 Gm17017-201ENSMUST00000161540 2405 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Opn1mwO35599 Stau2-213ENSMUST00000159558 3901 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Opn1mwO35599 Fndc3c1-201ENSMUST00000039447 4859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Opn1mwO35599 Gm37880-201ENSMUST00000192216 3257 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Opn1mwO35599 Olfr473-202ENSMUST00000217618 2319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Opn1mwO35599 Herc2-202ENSMUST00000164095 15261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Opn1mwO35599 Scfd1-201ENSMUST00000021335 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Opn1mwO35599 Cd44-203ENSMUST00000099673 2848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Opn1mwO35599 Gm23593-201ENSMUST00000104309 120 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Opn1mwO35599 Olfr1330-202ENSMUST00000105035 1027 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Opn1mwO35599 Gm13491-201ENSMUST00000118267 235 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Opn1mwO35599 Gm14352-201ENSMUST00000119250 449 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Opn1mwO35599 Gm13367-201ENSMUST00000119955 796 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Opn1mwO35599 Mup-ps18-201ENSMUST00000120145 531 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Opn1mwO35599 Gm11844-201ENSMUST00000129207 459 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Opn1mwO35599 1700061F12Rik-201ENSMUST00000132414 876 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Opn1mwO35599 1810065E05Rik-201ENSMUST00000013797 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Opn1mwO35599 Gm12602-202ENSMUST00000154352 707 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Opn1mwO35599 Mir1947-201ENSMUST00000158235 85 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Opn1mwO35599 Ear-ps9-201ENSMUST00000161963 460 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Opn1mwO35599 Gm27492-201ENSMUST00000185194 187 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Opn1mwO35599 Gm28503-201ENSMUST00000185966 147 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Opn1mwO35599 2310030A07Rik-201ENSMUST00000186460 610 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Opn1mwO35599 Gm37581-201ENSMUST00000192371 988 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Opn1mwO35599 Gm30667-201ENSMUST00000193120 870 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Opn1mwO35599 Gm18864-201ENSMUST00000194518 1051 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Opn1mwO35599 Gm44319-201ENSMUST00000196974 93 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Opn1mwO35599 D030025E07Rik-204ENSMUST00000198275 653 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Opn1mwO35599 Gm2623-201ENSMUST00000199229 286 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Opn1mwO35599 Gm38562-201ENSMUST00000199398 1126 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Opn1mwO35599 Gm18100-201ENSMUST00000200897 452 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Opn1mwO35599 Gm43090-201ENSMUST00000202459 314 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Opn1mwO35599 Gm44761-201ENSMUST00000209080 440 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Opn1mwO35599 Gm18255-201ENSMUST00000211316 765 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Opn1mwO35599 Gm8106-201ENSMUST00000213123 523 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Opn1mwO35599 Gm18242-201ENSMUST00000218455 542 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Opn1mwO35599 Olfr589-202ENSMUST00000218483 966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Opn1mwO35599 4930448C13Rik-204ENSMUST00000221610 1044 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Opn1mwO35599 Tmem209-211ENSMUST00000222934 1212 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Opn1mwO35599 Gm9512-201ENSMUST00000223112 497 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Opn1mwO35599 AC154840.1-201ENSMUST00000225216 408 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Opn1mwO35599 Olfr589-201ENSMUST00000061055 954 ntAPPRIS P1 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Opn1mwO35599 Olfr664-201ENSMUST00000072887 966 ntAPPRIS P5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Opn1mwO35599 Olfr586-201ENSMUST00000084811 954 ntAPPRIS P2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Opn1mwO35599 Gm28183-201ENSMUST00000191321 1406 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Opn1mwO35599 Olfr644-202ENSMUST00000213184 3572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Opn1mwO35599 AC134860.3-201ENSMUST00000223564 1300 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Opn1mwO35599 Asap1-210ENSMUST00000176384 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Opn1mwO35599 Ncoa7-203ENSMUST00000213836 2989 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Opn1mwO35599 Mrc1-201ENSMUST00000028045 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Opn1mwO35599 Polk-201ENSMUST00000022172 4225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
Opn1mwO35599 Olfr329-ps-203ENSMUST00000219448 4052 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
Opn1mwO35599 9330175M20Rik-201ENSMUST00000189867 2552 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
Opn1mwO35599 Zfp456-201ENSMUST00000057070 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
Opn1mwO35599 Rnf2-204ENSMUST00000187048 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
Opn1mwO35599 Lrp2bp-203ENSMUST00000110381 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
Opn1mwO35599 Gm15170-201ENSMUST00000121593 2023 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
Opn1mwO35599 Clca4b-201ENSMUST00000098549 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
Opn1mwO35599 Ugt8a-203ENSMUST00000198610 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
Opn1mwO35599 Gm37250-201ENSMUST00000194919 2388 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
Opn1mwO35599 Ostn-201ENSMUST00000066852 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
Opn1mwO35599 Zfp143-201ENSMUST00000084727 3003 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
Opn1mwO35599 Trav2-201ENSMUST00000103568 325 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
Opn1mwO35599 Olfr612-201ENSMUST00000104879 972 ntAPPRIS P1 BASIC5.18□□□□□ -1.58
Opn1mwO35599 Gm12073-201ENSMUST00000117382 524 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
Opn1mwO35599 Gm13452-201ENSMUST00000120896 1097 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
Opn1mwO35599 Olfr1397-ps1-201ENSMUST00000121388 962 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
Opn1mwO35599 Gm13363-201ENSMUST00000122008 522 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
Opn1mwO35599 9130015L21Rik-201ENSMUST00000140319 606 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
Opn1mwO35599 Gm16365-204ENSMUST00000143877 779 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
Opn1mwO35599 Gm16019-201ENSMUST00000149538 261 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
Opn1mwO35599 Gm24188-201ENSMUST00000157980 108 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
Opn1mwO35599 Gm17430-201ENSMUST00000171339 474 ntAPPRIS P1 BASIC5.18□□□□□ -1.58
Opn1mwO35599 Gm21820-201ENSMUST00000179056 1083 ntAPPRIS P1 BASIC5.18□□□□□ -1.58
Opn1mwO35599 Gm27820-201ENSMUST00000183628 175 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
Opn1mwO35599 1700101O22Rik-201ENSMUST00000187396 339 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
Opn1mwO35599 1700007K09Rik-202ENSMUST00000188899 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
Opn1mwO35599 Gm29332-201ENSMUST00000190829 227 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
Opn1mwO35599 Gm43018-201ENSMUST00000198075 1275 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
Opn1mwO35599 Ube2l3-ps1-201ENSMUST00000199777 436 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
Opn1mwO35599 Gm43418-201ENSMUST00000201334 428 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
Opn1mwO35599 Gm44214-201ENSMUST00000204153 606 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
Opn1mwO35599 Gm36864-201ENSMUST00000205530 684 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
Opn1mwO35599 Jakmip1-216ENSMUST00000212997 138 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
Opn1mwO35599 4930401A07Rik-201ENSMUST00000214657 746 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
Opn1mwO35599 AC122395.1-201ENSMUST00000214666 374 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
Opn1mwO35599 Gm18039-201ENSMUST00000217816 728 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
Opn1mwO35599 Gm6906-201ENSMUST00000218014 569 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
Opn1mwO35599 AC154424.1-201ENSMUST00000225883 799 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
Opn1mwO35599 AC140209.1-201ENSMUST00000227875 284 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
Opn1mwO35599 Trmt2b-201ENSMUST00000087540 822 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
Opn1mwO35599 Olfr1111-201ENSMUST00000099860 940 ntAPPRIS P1 BASIC5.18□□□□□ -1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.3 ms