Protein–RNA interactions for Protein: Q1RLL3

Cpne9, Copine-9, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne9Q1RLL3 Gm7335-201ENSMUST00000172475 373 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Cpne9Q1RLL3 Rian-217ENSMUST00000183266 687 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
Cpne9Q1RLL3 Gm28129-201ENSMUST00000186273 537 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
Cpne9Q1RLL3 Gm28389-201ENSMUST00000190090 697 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Cpne9Q1RLL3 Gm30097-201ENSMUST00000193581 447 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
Cpne9Q1RLL3 Gm43712-201ENSMUST00000198020 291 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Cpne9Q1RLL3 Gm18330-201ENSMUST00000199246 547 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Cpne9Q1RLL3 Gm43036-201ENSMUST00000200594 373 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Cpne9Q1RLL3 Gm18325-201ENSMUST00000203228 835 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Cpne9Q1RLL3 Snhg1-205ENSMUST00000205825 495 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
Cpne9Q1RLL3 Olfr654-202ENSMUST00000210457 1156 ntAPPRIS P1 BASIC4.74□□□□□ -1.65
Cpne9Q1RLL3 AC138284.5-201ENSMUST00000214389 652 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Cpne9Q1RLL3 Gm3086-202ENSMUST00000221248 310 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Cpne9Q1RLL3 Hmgb1-ps11-201ENSMUST00000221749 621 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Cpne9Q1RLL3 Gm6049-201ENSMUST00000222369 458 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Cpne9Q1RLL3 AC116724.1-201ENSMUST00000227900 972 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Cpne9Q1RLL3 AC125539.2-202ENSMUST00000227983 587 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Cpne9Q1RLL3 AC125539.2-201ENSMUST00000228339 753 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Cpne9Q1RLL3 Gm26063-201ENSMUST00000083378 107 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Cpne9Q1RLL3 Olfr654-201ENSMUST00000098173 1155 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Cpne9Q1RLL3 Olfr1170-201ENSMUST00000099831 951 ntAPPRIS P1 BASIC4.74□□□□□ -1.65
Cpne9Q1RLL3 Vmn2r43-201ENSMUST00000066317 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
Cpne9Q1RLL3 Mcmdc2-202ENSMUST00000118098 2072 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
Cpne9Q1RLL3 Tcp1-ps1-201ENSMUST00000120941 1466 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Cpne9Q1RLL3 Ncr1-202ENSMUST00000126417 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
Cpne9Q1RLL3 Fbxw15-201ENSMUST00000056745 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
Cpne9Q1RLL3 Olfr1191-ps1-202ENSMUST00000217379 5933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
Cpne9Q1RLL3 Zfp62-202ENSMUST00000109197 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
Cpne9Q1RLL3 Gm26753-201ENSMUST00000181938 2731 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
Cpne9Q1RLL3 Gm37205-201ENSMUST00000194820 2736 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Cpne9Q1RLL3 Slc22a22-201ENSMUST00000022995 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
Cpne9Q1RLL3 Vmn1r34-204ENSMUST00000226999 3048 ntAPPRIS P1 BASIC4.73□□□□□ -1.65
Cpne9Q1RLL3 Gm19301-201ENSMUST00000174283 2210 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
Cpne9Q1RLL3 Vmn1r184-206ENSMUST00000228145 5888 ntAPPRIS P1 BASIC4.73□□□□□ -1.65
Cpne9Q1RLL3 Vmn1r57-202ENSMUST00000227798 2409 ntAPPRIS P1 BASIC4.73□□□□□ -1.65
Cpne9Q1RLL3 Uhmk1-203ENSMUST00000150821 7676 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
Cpne9Q1RLL3 Vmn1r173-202ENSMUST00000226233 9416 ntAPPRIS P1 BASIC4.73□□□□□ -1.65
Cpne9Q1RLL3 Igkv3-2-201ENSMUST00000103403 378 ntAPPRIS P1 BASIC4.73□□□□□ -1.65
Cpne9Q1RLL3 Gm23746-201ENSMUST00000104229 125 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Cpne9Q1RLL3 Mir290a-201ENSMUST00000104627 83 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Cpne9Q1RLL3 Gm13250-201ENSMUST00000117209 753 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Cpne9Q1RLL3 Gm14369-201ENSMUST00000121355 285 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Cpne9Q1RLL3 Gm22958-201ENSMUST00000122512 184 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Cpne9Q1RLL3 Gm568-201ENSMUST00000135777 506 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
Cpne9Q1RLL3 Gm3182-202ENSMUST00000169364 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
Cpne9Q1RLL3 Gm28750-201ENSMUST00000186327 658 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
Cpne9Q1RLL3 Gm37631-201ENSMUST00000192275 364 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Cpne9Q1RLL3 Igkv12-66-201ENSMUST00000199305 348 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Cpne9Q1RLL3 Olfr1310-201ENSMUST00000207169 1009 ntAPPRIS P1 BASIC4.73□□□□□ -1.65
Cpne9Q1RLL3 Gm4574-201ENSMUST00000207804 542 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Cpne9Q1RLL3 Gm36372-201ENSMUST00000221011 778 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
Cpne9Q1RLL3 Olfr1497-201ENSMUST00000061993 945 ntAPPRIS P1 BASIC4.73□□□□□ -1.65
Cpne9Q1RLL3 Vmn1r214-201ENSMUST00000074252 1227 ntAPPRIS P1 BASIC4.73□□□□□ -1.65
Cpne9Q1RLL3 Olfr1206-201ENSMUST00000077302 924 ntAPPRIS P1 BASIC4.73□□□□□ -1.65
Cpne9Q1RLL3 n-R5s205-201ENSMUST00000083149 125 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Cpne9Q1RLL3 Cftr-204ENSMUST00000129452 2835 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
Cpne9Q1RLL3 Vmn2r3-201ENSMUST00000170244 2670 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
Cpne9Q1RLL3 Gm10471-201ENSMUST00000094946 2967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
Cpne9Q1RLL3 Gm30524-201ENSMUST00000204271 2300 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
Cpne9Q1RLL3 Acsm3-205ENSMUST00000106529 3295 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
Cpne9Q1RLL3 AC140299.2-201ENSMUST00000219546 1969 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Cpne9Q1RLL3 Gm37115-201ENSMUST00000193750 2849 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Cpne9Q1RLL3 Rbm41-203ENSMUST00000113007 3691 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
Cpne9Q1RLL3 Vmn1r89-205ENSMUST00000227276 1417 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
Cpne9Q1RLL3 Cmah-202ENSMUST00000110391 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
Cpne9Q1RLL3 Olfr364-ps1-202ENSMUST00000214905 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
Cpne9Q1RLL3 Olfr1501-203ENSMUST00000215350 4395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
Cpne9Q1RLL3 Fat2-202ENSMUST00000108864 14423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
Cpne9Q1RLL3 Vmn1r197-203ENSMUST00000227017 5158 ntAPPRIS P1 BASIC4.72□□□□□ -1.65
Cpne9Q1RLL3 Cnot4-206ENSMUST00000202143 3202 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
Cpne9Q1RLL3 Gm13491-201ENSMUST00000118267 235 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Cpne9Q1RLL3 Gm4853-201ENSMUST00000119359 394 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Cpne9Q1RLL3 Gm11376-201ENSMUST00000144541 231 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
Cpne9Q1RLL3 Gm14697-201ENSMUST00000147144 648 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
Cpne9Q1RLL3 4930570N18Rik-201ENSMUST00000159273 332 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
Cpne9Q1RLL3 Gm16213-201ENSMUST00000160076 639 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
Cpne9Q1RLL3 Gm6647-201ENSMUST00000170514 641 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Cpne9Q1RLL3 Prl5a1-201ENSMUST00000017208 1061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
Cpne9Q1RLL3 Gm23617-201ENSMUST00000175410 95 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Cpne9Q1RLL3 1500004A13Rik-206ENSMUST00000184170 576 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
Cpne9Q1RLL3 Gm27551-201ENSMUST00000184258 77 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Cpne9Q1RLL3 Gm38217-201ENSMUST00000194358 910 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Cpne9Q1RLL3 4930539C22Rik-201ENSMUST00000198231 970 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
Cpne9Q1RLL3 Gm8891-201ENSMUST00000198546 832 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Cpne9Q1RLL3 Gm44261-201ENSMUST00000203337 209 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Cpne9Q1RLL3 Gm19065-202ENSMUST00000203910 1165 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Cpne9Q1RLL3 Gm45037-201ENSMUST00000207475 673 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
Cpne9Q1RLL3 Gm45731-201ENSMUST00000211988 1203 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Cpne9Q1RLL3 CT030662.2-201ENSMUST00000226942 805 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Cpne9Q1RLL3 AC154618.1-201ENSMUST00000227451 303 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Cpne9Q1RLL3 Gm15128-202ENSMUST00000178833 1350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
Cpne9Q1RLL3 Gm28074-201ENSMUST00000190424 1497 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
Cpne9Q1RLL3 Gm44109-201ENSMUST00000204514 1954 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
Cpne9Q1RLL3 Cep290-201ENSMUST00000164751 8006 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
Cpne9Q1RLL3 Piga-201ENSMUST00000033754 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
Cpne9Q1RLL3 AC154627.2-201ENSMUST00000227028 4669 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Cpne9Q1RLL3 Gm44433-201ENSMUST00000203540 4832 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Cpne9Q1RLL3 Chek1-205ENSMUST00000173963 1509 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
Cpne9Q1RLL3 Trim30a-201ENSMUST00000076922 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.65
Cpne9Q1RLL3 Gm40909-202ENSMUST00000223275 5564 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 119.3 ms