Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPR4

Actn1, Alpha-actinin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 892 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actn1Q7TPR4 Zscan4c-201ENSMUST00000131379 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
Actn1Q7TPR4 Olfr1097-202ENSMUST00000217403 4430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
Actn1Q7TPR4 Ccr9-204ENSMUST00000168910 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
Actn1Q7TPR4 Cfap61-207ENSMUST00000138774 3308 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
Actn1Q7TPR4 Pbrm1-201ENSMUST00000022471 5871 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
Actn1Q7TPR4 Olfr1056-202ENSMUST00000216547 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
Actn1Q7TPR4 Zfp932-202ENSMUST00000112536 2509 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
Actn1Q7TPR4 Olfr828-202ENSMUST00000215380 1689 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
Actn1Q7TPR4 4933439N06Rik-201ENSMUST00000203062 1365 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Actn1Q7TPR4 Samd3-202ENSMUST00000164660 2620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
Actn1Q7TPR4 Samd3-203ENSMUST00000218301 2620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
Actn1Q7TPR4 Gm45324-201ENSMUST00000211193 5638 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Actn1Q7TPR4 Gm18186-201ENSMUST00000192239 1580 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Actn1Q7TPR4 Olfr570-202ENSMUST00000209778 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
Actn1Q7TPR4 Iglv2-201ENSMUST00000103752 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
Actn1Q7TPR4 Gm22020-201ENSMUST00000104358 136 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Actn1Q7TPR4 Gm5383-201ENSMUST00000121177 617 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Actn1Q7TPR4 n-R5s174-201ENSMUST00000122638 121 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Actn1Q7TPR4 Gm16222-201ENSMUST00000124320 1298 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
Actn1Q7TPR4 Gm12602-202ENSMUST00000154352 707 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
Actn1Q7TPR4 Vmn1r116-201ENSMUST00000164288 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.69□□□□□ -1.5
Actn1Q7TPR4 Vmn1r152-201ENSMUST00000168326 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.69□□□□□ -1.5
Actn1Q7TPR4 Vmn1r95-201ENSMUST00000168984 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.69□□□□□ -1.5
Actn1Q7TPR4 Vmn1r104-201ENSMUST00000169689 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.69□□□□□ -1.5
Actn1Q7TPR4 Vmn2r-ps64-201ENSMUST00000173690 523 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Actn1Q7TPR4 Vmn1r148-201ENSMUST00000177774 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.69□□□□□ -1.5
Actn1Q7TPR4 Vmn1r100-201ENSMUST00000177815 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.69□□□□□ -1.5
Actn1Q7TPR4 Gm21959-201ENSMUST00000178439 452 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Actn1Q7TPR4 2310030A07Rik-201ENSMUST00000186460 610 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
Actn1Q7TPR4 Gm33050-201ENSMUST00000198132 501 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
Actn1Q7TPR4 Gm45078-201ENSMUST00000205343 546 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Actn1Q7TPR4 Gm33501-201ENSMUST00000209257 1193 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
Actn1Q7TPR4 Gm19201-201ENSMUST00000210127 778 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Actn1Q7TPR4 Selenok-ps8-201ENSMUST00000221926 280 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Actn1Q7TPR4 Trmt2b-201ENSMUST00000087540 822 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
Actn1Q7TPR4 Vmn1r125-201ENSMUST00000098739 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.69□□□□□ -1.5
Actn1Q7TPR4 Gm2539-201ENSMUST00000180720 2411 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
Actn1Q7TPR4 Olfr1065-202ENSMUST00000216162 2148 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
Actn1Q7TPR4 Casp1-201ENSMUST00000027015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
Actn1Q7TPR4 Rtl9-201ENSMUST00000165829 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
Actn1Q7TPR4 Kcnh7-201ENSMUST00000075052 13321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
Actn1Q7TPR4 Gramd1c-201ENSMUST00000036174 3501 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
Actn1Q7TPR4 Far2-202ENSMUST00000111607 3395 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
Actn1Q7TPR4 Spef2-201ENSMUST00000041840 4247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
Actn1Q7TPR4 AC144772.1-201ENSMUST00000226372 2398 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Actn1Q7TPR4 Tubal3-201ENSMUST00000021639 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
Actn1Q7TPR4 Gm43831-201ENSMUST00000200461 2598 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
Actn1Q7TPR4 Gm28178-201ENSMUST00000188544 2943 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
Actn1Q7TPR4 Zfp995-201ENSMUST00000106026 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
Actn1Q7TPR4 Gm20342-201ENSMUST00000185480 9720 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
Actn1Q7TPR4 Gm6853-202ENSMUST00000211360 4375 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
Actn1Q7TPR4 Gm37217-201ENSMUST00000194017 3521 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
Actn1Q7TPR4 Olfr1286-203ENSMUST00000213210 3740 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
Actn1Q7TPR4 Gm43283-201ENSMUST00000199138 2548 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
Actn1Q7TPR4 Gm11020-201ENSMUST00000109447 186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
Actn1Q7TPR4 Crem-206ENSMUST00000124747 973 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
Actn1Q7TPR4 Gm23993-201ENSMUST00000157478 144 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
Actn1Q7TPR4 Gm22804-201ENSMUST00000158052 101 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
Actn1Q7TPR4 Gm27202-201ENSMUST00000183838 512 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
Actn1Q7TPR4 Stk-ps2-204ENSMUST00000187808 616 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
Actn1Q7TPR4 Pinc-202ENSMUST00000190487 961 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
Actn1Q7TPR4 Gm44307-201ENSMUST00000204466 764 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
Actn1Q7TPR4 Gm45422-201ENSMUST00000211476 246 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
Actn1Q7TPR4 Gm45789-201ENSMUST00000213038 364 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
Actn1Q7TPR4 Gm46191-201ENSMUST00000218899 433 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
Actn1Q7TPR4 9430078K24Rik-202ENSMUST00000219857 348 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
Actn1Q7TPR4 AC134439.1-201ENSMUST00000220923 600 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
Actn1Q7TPR4 Sprr3-201ENSMUST00000058142 1222 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
Actn1Q7TPR4 Tas2r109-201ENSMUST00000067539 951 ntAPPRIS P1 BASIC5.68□□□□□ -1.5
Actn1Q7TPR4 Gm22826-201ENSMUST00000083774 165 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
Actn1Q7TPR4 Olfr738-203ENSMUST00000214853 2046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
Actn1Q7TPR4 Trim38-201ENSMUST00000074067 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
Actn1Q7TPR4 Kynu-202ENSMUST00000050511 2778 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
Actn1Q7TPR4 Scfd1-201ENSMUST00000021335 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
Actn1Q7TPR4 Vmn1r34-204ENSMUST00000226999 3048 ntAPPRIS P1 BASIC5.68□□□□□ -1.5
Actn1Q7TPR4 Cyp2c38-201ENSMUST00000035488 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
Actn1Q7TPR4 4930532I03Rik-201ENSMUST00000218463 1724 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
Actn1Q7TPR4 Gm44668-201ENSMUST00000207911 3265 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
Actn1Q7TPR4 Nlrp5-202ENSMUST00000086341 3471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
Actn1Q7TPR4 Spag5-201ENSMUST00000045026 3887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
Actn1Q7TPR4 Gm38264-201ENSMUST00000194850 2032 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
Actn1Q7TPR4 Rptn-201ENSMUST00000045912 4146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
Actn1Q7TPR4 Pih1d3-201ENSMUST00000027230 1451 ntAPPRIS P1 BASIC5.67□□□□□ -1.5
Actn1Q7TPR4 Abca12-201ENSMUST00000087268 9137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
Actn1Q7TPR4 Gm22899-201ENSMUST00000104540 131 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
Actn1Q7TPR4 Gm15297-201ENSMUST00000117795 290 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
Actn1Q7TPR4 Mup-ps18-201ENSMUST00000120145 531 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
Actn1Q7TPR4 Gm12466-201ENSMUST00000121199 620 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
Actn1Q7TPR4 9030622O22Rik-201ENSMUST00000129082 1245 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
Actn1Q7TPR4 Gm23467-201ENSMUST00000157127 159 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
Actn1Q7TPR4 Gm25278-201ENSMUST00000157267 120 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
Actn1Q7TPR4 Gm24186-201ENSMUST00000157983 127 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
Actn1Q7TPR4 Gm24175-201ENSMUST00000158931 129 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
Actn1Q7TPR4 D6Ertd474e-203ENSMUST00000160188 683 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
Actn1Q7TPR4 Vmn1r-ps71-201ENSMUST00000172648 924 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
Actn1Q7TPR4 1700025F22Rik-203ENSMUST00000181284 562 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
Actn1Q7TPR4 Gm26895-201ENSMUST00000181295 619 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
Actn1Q7TPR4 Il19-203ENSMUST00000187410 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
Actn1Q7TPR4 Gm5511-201ENSMUST00000189380 802 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
Actn1Q7TPR4 Gm7721-201ENSMUST00000200446 546 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
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