Protein–RNA interactions for Protein: P70217

Hoxd13, Homeobox protein Hox-D13, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd13P70217 Gm38362-201ENSMUST00000192999 2064 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Hoxd13P70217 Asb15-202ENSMUST00000117688 4371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Hoxd13P70217 Gm12018-201ENSMUST00000150694 3375 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
Hoxd13P70217 Olfr1340-203ENSMUST00000216242 3341 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.48
Hoxd13P70217 Gm45838-201ENSMUST00000207355 2447 ntBASIC5.84□□□□□ -1.48
Hoxd13P70217 4933403O08Rik-203ENSMUST00000164272 1517 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
Hoxd13P70217 AC122357.2-201ENSMUST00000220732 1525 ntBASIC5.84□□□□□ -1.48
Hoxd13P70217 AC164297.2-201ENSMUST00000224388 1508 ntBASIC5.84□□□□□ -1.48
Hoxd13P70217 Shoc2-202ENSMUST00000169861 4065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
Hoxd13P70217 Slco6d1-201ENSMUST00000027575 2328 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Hoxd13P70217 Gm21778-202ENSMUST00000185926 1482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Hoxd13P70217 Muc15-203ENSMUST00000111017 3095 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Hoxd13P70217 Fam26d-202ENSMUST00000218239 3075 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Hoxd13P70217 Klhl24-201ENSMUST00000023509 6683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Hoxd13P70217 Usp47-202ENSMUST00000210309 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Hoxd13P70217 Gm37407-201ENSMUST00000194793 1316 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Hoxd13P70217 Gab3-203ENSMUST00000114109 2093 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Hoxd13P70217 Map9-201ENSMUST00000091014 6218 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Hoxd13P70217 Olfr1299-201ENSMUST00000207228 1678 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Hoxd13P70217 Mier1-203ENSMUST00000106855 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Hoxd13P70217 Gm14786-201ENSMUST00000117127 944 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Hoxd13P70217 Olfr1103-ps1-201ENSMUST00000119132 937 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Hoxd13P70217 Gm16179-201ENSMUST00000120685 373 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Hoxd13P70217 Gm12026-201ENSMUST00000120961 1024 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Hoxd13P70217 Gm12706-201ENSMUST00000121588 698 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Hoxd13P70217 Gstm2-201ENSMUST00000012348 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Hoxd13P70217 Gm17472-201ENSMUST00000167638 352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Hoxd13P70217 Gm23806-201ENSMUST00000175157 109 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Hoxd13P70217 Dlx6os1-204ENSMUST00000184182 146 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Hoxd13P70217 Gm28075-201ENSMUST00000189179 354 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Hoxd13P70217 Gm6260-202ENSMUST00000197170 921 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Hoxd13P70217 4930425K10Rik-201ENSMUST00000201190 745 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Hoxd13P70217 1810017P11Rik-201ENSMUST00000202592 558 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Hoxd13P70217 Gm44727-201ENSMUST00000204225 451 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Hoxd13P70217 AC163621.2-201ENSMUST00000222229 682 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Hoxd13P70217 Gm18338-201ENSMUST00000222381 560 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Hoxd13P70217 AC154198.1-201ENSMUST00000222839 424 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Hoxd13P70217 AC137902.2-201ENSMUST00000227989 576 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Hoxd13P70217 Olfr957-201ENSMUST00000051653 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Hoxd13P70217 Olfr1451-201ENSMUST00000063144 933 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Hoxd13P70217 Olfr965-201ENSMUST00000069342 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Hoxd13P70217 Vmn1r52-201ENSMUST00000079832 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Hoxd13P70217 Mir129-1-201ENSMUST00000083535 73 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Hoxd13P70217 Gm25187-201ENSMUST00000083906 133 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Hoxd13P70217 Olfr704-202ENSMUST00000098141 948 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Hoxd13P70217 Cx3cr1-201ENSMUST00000064165 3753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Hoxd13P70217 Fap-209ENSMUST00000174448 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Hoxd13P70217 Vmn1r39-201ENSMUST00000226217 2258 ntAPPRIS P2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Hoxd13P70217 Vmn1r39-204ENSMUST00000227555 2297 ntAPPRIS P2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Hoxd13P70217 Vmn1r39-205ENSMUST00000228008 2283 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Hoxd13P70217 AC113031.7-201ENSMUST00000228609 1928 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Hoxd13P70217 Speer4a-201ENSMUST00000079447 2980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Hoxd13P70217 Gm45633-201ENSMUST00000210669 3253 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Hoxd13P70217 Zfp606-205ENSMUST00000209403 2211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Hoxd13P70217 Gria4-204ENSMUST00000212533 5207 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Hoxd13P70217 Mfsd4b4-201ENSMUST00000178045 3508 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Hoxd13P70217 Kdm4c-202ENSMUST00000077851 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Hoxd13P70217 Gm43210-201ENSMUST00000196743 6152 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Hoxd13P70217 Sirpb1c-203ENSMUST00000108350 2489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Hoxd13P70217 Zfp933-201ENSMUST00000105718 4238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Hoxd13P70217 Olfr655-204ENSMUST00000216750 2010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Hoxd13P70217 AC132852.1-201ENSMUST00000214683 2324 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Hoxd13P70217 Pou2f1-205ENSMUST00000111427 13050 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Hoxd13P70217 Cyp2j12-201ENSMUST00000097972 1675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Hoxd13P70217 Ncoa7-208ENSMUST00000215926 2875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Hoxd13P70217 Sytl2-202ENSMUST00000107210 3718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Hoxd13P70217 Ckap5-203ENSMUST00000111337 6384 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Hoxd13P70217 Gm37971-201ENSMUST00000193516 3391 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
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Hoxd13P70217 Il22ra2-201ENSMUST00000036564 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Hoxd13P70217 Lrrtm4-208ENSMUST00000147663 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Hoxd13P70217 Trbv26-201ENSMUST00000103280 344 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Hoxd13P70217 Gm11042-201ENSMUST00000110441 120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Hoxd13P70217 Olfr133-201ENSMUST00000113636 1090 ntAPPRIS P1 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Hoxd13P70217 Gm23839-201ENSMUST00000116957 109 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Hoxd13P70217 Gm14621-201ENSMUST00000117709 689 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Hoxd13P70217 Gm16383-201ENSMUST00000118122 232 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Hoxd13P70217 Gm12889-201ENSMUST00000118684 241 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Hoxd13P70217 Gm14065-201ENSMUST00000120848 585 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Hoxd13P70217 Rpl36a-ps4-201ENSMUST00000121019 296 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Hoxd13P70217 Gm14979-201ENSMUST00000121561 1035 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Hoxd13P70217 Gm15840-201ENSMUST00000122099 943 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Hoxd13P70217 Gm16146-201ENSMUST00000160306 439 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Hoxd13P70217 AY512915-204ENSMUST00000162315 676 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Hoxd13P70217 Gm6650-201ENSMUST00000166710 614 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Hoxd13P70217 Gm17121-201ENSMUST00000170414 847 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Hoxd13P70217 Rps8-ps1-201ENSMUST00000172445 624 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Hoxd13P70217 Gm17907-201ENSMUST00000173150 710 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Hoxd13P70217 Vmn1r-ps152-201ENSMUST00000176452 699 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Hoxd13P70217 Gm10715-202ENSMUST00000177969 681 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Hoxd13P70217 Gm17222-201ENSMUST00000180135 847 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Hoxd13P70217 Gm27754-201ENSMUST00000183340 126 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Hoxd13P70217 Gm27636-201ENSMUST00000184528 122 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Hoxd13P70217 Gm18728-201ENSMUST00000186155 753 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Hoxd13P70217 4930554C24Rik-201ENSMUST00000187735 1084 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Hoxd13P70217 1700031L13Rik-204ENSMUST00000188072 812 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Hoxd13P70217 4930434B07Rik-201ENSMUST00000190254 1020 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Hoxd13P70217 Gm37947-201ENSMUST00000192740 894 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Hoxd13P70217 Pvrig-ps-201ENSMUST00000199472 204 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Hoxd13P70217 Gm2011-203ENSMUST00000203750 435 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
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