Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

Predictions only

Length 1,452 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 Dnah17-204ENSMUST00000132685 13612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
PtprmP28828 Gm43990-201ENSMUST00000203790 1691 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
PtprmP28828 Gm11674-201ENSMUST00000124855 3005 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
PtprmP28828 Slc22a27-201ENSMUST00000075619 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
PtprmP28828 Crem-230ENSMUST00000151311 2485 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
PtprmP28828 2900079G21Rik-204ENSMUST00000163302 2764 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
PtprmP28828 Rapgef6-204ENSMUST00000108894 3475 ntTSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
PtprmP28828 Gm15737-201ENSMUST00000113434 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
PtprmP28828 Cenpf-204ENSMUST00000171929 11130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
PtprmP28828 Lrp2bp-203ENSMUST00000110381 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
PtprmP28828 Olfr373-203ENSMUST00000215198 3923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
PtprmP28828 Taf1-201ENSMUST00000101341 8054 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.94□□□□□ -1.3
PtprmP28828 Olfr129-202ENSMUST00000216476 5275 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.94□□□□□ -1.3
PtprmP28828 Olfr487-202ENSMUST00000216489 3785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
PtprmP28828 Agbl2-208ENSMUST00000170320 4507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
PtprmP28828 Olfr351-201ENSMUST00000100150 933 ntAPPRIS P1 BASIC6.94□□□□□ -1.3
PtprmP28828 Igkv8-19-201ENSMUST00000103389 305 ntAPPRIS P1 BASIC6.94□□□□□ -1.3
PtprmP28828 Mir6408-201ENSMUST00000183643 91 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
PtprmP28828 Gm6802-202ENSMUST00000186566 126 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
PtprmP28828 Gm42830-201ENSMUST00000196642 313 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
PtprmP28828 AC156832.3-201ENSMUST00000215591 435 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
PtprmP28828 Capza3-201ENSMUST00000043797 1222 ntAPPRIS P1 BASIC6.94□□□□□ -1.3
PtprmP28828 Gm26330-201ENSMUST00000082817 104 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
PtprmP28828 Obp1b-201ENSMUST00000088198 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
PtprmP28828 Zfp27-205ENSMUST00000162592 3845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
PtprmP28828 Evi5-201ENSMUST00000112642 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
PtprmP28828 A730046J19Rik-201ENSMUST00000135687 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
PtprmP28828 Clock-204ENSMUST00000202122 5508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
PtprmP28828 Scn8a-205ENSMUST00000108910 11232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
PtprmP28828 Snhg14-214ENSMUST00000191191 3991 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
PtprmP28828 Gm21244-202ENSMUST00000189201 3115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
PtprmP28828 4930435E12Rik-201ENSMUST00000122078 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
PtprmP28828 Trav5-1-201ENSMUST00000103570 343 ntAPPRIS P1 BASIC6.93□□□□□ -1.3
PtprmP28828 Gm11406-201ENSMUST00000117418 484 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
PtprmP28828 Gm6031-201ENSMUST00000121314 1054 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
PtprmP28828 1700109K24Rik-201ENSMUST00000181870 1045 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
PtprmP28828 Gm27818-201ENSMUST00000184536 159 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
PtprmP28828 Gm18183-201ENSMUST00000191024 615 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
PtprmP28828 Gm4045-201ENSMUST00000204076 310 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
PtprmP28828 Gm17780-201ENSMUST00000207142 612 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
PtprmP28828 4930458B22Rik-201ENSMUST00000209339 754 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
PtprmP28828 Pole-201ENSMUST00000007296 7163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
PtprmP28828 Mrps25-203ENSMUST00000140438 6073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
PtprmP28828 Fras1-201ENSMUST00000036019 15848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
PtprmP28828 Ugt2b5-201ENSMUST00000067790 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
PtprmP28828 Abcg3-202ENSMUST00000130644 2668 ntTSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
PtprmP28828 Igip-201ENSMUST00000210490 1417 ntAPPRIS P1 BASIC6.93□□□□□ -1.3
PtprmP28828 Olfr1188-202ENSMUST00000217131 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.93□□□□□ -1.3
PtprmP28828 Vmn2r27-201ENSMUST00000100968 2574 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
PtprmP28828 Gm44171-201ENSMUST00000203701 2109 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
PtprmP28828 2310001H17Rik-203ENSMUST00000181517 3981 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
PtprmP28828 6330410L21Rik-201ENSMUST00000199846 3871 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
PtprmP28828 Ptgs2-201ENSMUST00000035065 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
PtprmP28828 AC131743.1-201ENSMUST00000222138 4024 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
PtprmP28828 Rlim-201ENSMUST00000070705 7429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
PtprmP28828 Clcn3-202ENSMUST00000056508 5684 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
PtprmP28828 Prdm9-206ENSMUST00000167994 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
PtprmP28828 Psg21-201ENSMUST00000094793 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
PtprmP28828 Zfp369-202ENSMUST00000126879 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
PtprmP28828 Pcdh15-202ENSMUST00000092420 6917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
PtprmP28828 Gm22343-201ENSMUST00000122648 286 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
PtprmP28828 Spin2-ps4-201ENSMUST00000126395 762 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
PtprmP28828 Spin2-ps3-201ENSMUST00000148147 762 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
PtprmP28828 Gm22816-201ENSMUST00000157450 117 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
PtprmP28828 Gm24939-201ENSMUST00000158325 137 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
PtprmP28828 Gm23816-201ENSMUST00000179617 132 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
PtprmP28828 Gm18802-201ENSMUST00000186270 888 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
PtprmP28828 Gm38201-201ENSMUST00000192143 387 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
PtprmP28828 Gm4734-201ENSMUST00000200117 777 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
PtprmP28828 Gm45507-201ENSMUST00000210611 519 ntTSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
PtprmP28828 Gm32171-201ENSMUST00000217419 1043 ntTSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
PtprmP28828 AC140344.1-201ENSMUST00000223384 387 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
PtprmP28828 AC121137.1-201ENSMUST00000225272 602 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
PtprmP28828 AC154335.2-201ENSMUST00000225916 638 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
PtprmP28828 A730045E13Rik-201ENSMUST00000066740 854 ntTSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
PtprmP28828 Olfr1109-201ENSMUST00000099863 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.92□□□□□ -1.3
PtprmP28828 Gm43891-201ENSMUST00000205132 3112 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
PtprmP28828 Gm10415-201ENSMUST00000204181 2825 ntTSL 2 BASIC6.92□□□□□ -1.3
PtprmP28828 Ugt2b1-201ENSMUST00000031183 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
PtprmP28828 Gm2366-201ENSMUST00000180753 3982 ntTSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
PtprmP28828 Gm42531-201ENSMUST00000201648 4048 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
PtprmP28828 4921539E11Rik-203ENSMUST00000168664 2356 ntTSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
PtprmP28828 AC124569.3-201ENSMUST00000224860 1621 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
PtprmP28828 Gm44250-201ENSMUST00000203092 4229 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
PtprmP28828 Gm5757-201ENSMUST00000117494 528 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
PtprmP28828 Gm14985-201ENSMUST00000118693 786 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
PtprmP28828 n-R5s21-201ENSMUST00000122692 117 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
PtprmP28828 Gm24751-201ENSMUST00000157844 102 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
PtprmP28828 Gm25066-201ENSMUST00000158145 123 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
PtprmP28828 Gm15740-201ENSMUST00000159703 1292 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
PtprmP28828 Gm16107-201ENSMUST00000162523 862 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
PtprmP28828 Gm37401-201ENSMUST00000192053 347 ntTSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
PtprmP28828 Gm19134-201ENSMUST00000221203 487 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
PtprmP28828 AC124562.1-201ENSMUST00000224673 337 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
PtprmP28828 Gm43313-201ENSMUST00000201398 2235 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
PtprmP28828 Olfr97-204ENSMUST00000214622 1573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
PtprmP28828 Ptprd-213ENSMUST00000173376 4793 ntTSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
PtprmP28828 Olfr132-202ENSMUST00000216804 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
PtprmP28828 Peak1-204ENSMUST00000188142 7524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
PtprmP28828 Pcdh15-205ENSMUST00000105429 6719 ntTSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
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