Protein–RNA interactions for Protein: B2RW11

Ankrd34a, Ankyrin repeat domain 34A, mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd34aB2RW11 Zfp663-202ENSMUST00000103085 3451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Ankrd34aB2RW11 Gm15448-205ENSMUST00000189095 1905 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Ankrd34aB2RW11 Ccdc170-202ENSMUST00000138112 3350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Ankrd34aB2RW11 Ppp1r9a-201ENSMUST00000035813 9547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Ankrd34aB2RW11 Gm37937-201ENSMUST00000194130 2168 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Ankrd34aB2RW11 Orc2-202ENSMUST00000114325 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Ankrd34aB2RW11 Rprd2-201ENSMUST00000090791 7756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Ankrd34aB2RW11 Gm37745-201ENSMUST00000193304 8163 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Ankrd34aB2RW11 Trps1-204ENSMUST00000183757 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Ankrd34aB2RW11 Gpr165-201ENSMUST00000033554 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Ankrd34aB2RW11 AC154270.2-201ENSMUST00000226755 2306 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Ankrd34aB2RW11 Trrap-215ENSMUST00000213013 12398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Ankrd34aB2RW11 Sntg1-204ENSMUST00000132064 4165 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Ankrd34aB2RW11 Clrn1-202ENSMUST00000055636 3083 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Ankrd34aB2RW11 Serpina3c-201ENSMUST00000085050 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Ankrd34aB2RW11 Gm31343-201ENSMUST00000207967 2454 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Ankrd34aB2RW11 Tmem182-201ENSMUST00000114765 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Ankrd34aB2RW11 Fam205a1-201ENSMUST00000107979 4146 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
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Ankrd34aB2RW11 Itih5-201ENSMUST00000026886 7900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Ankrd34aB2RW11 Gm28515-201ENSMUST00000189823 2530 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Ankrd34aB2RW11 Fam193a-201ENSMUST00000094867 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Ankrd34aB2RW11 Sox5-201ENSMUST00000038815 7243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Ankrd34aB2RW11 Ttc17-201ENSMUST00000055081 3163 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Ankrd34aB2RW11 Pramel6-201ENSMUST00000026956 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
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Ankrd34aB2RW11 Scgb1b24-201ENSMUST00000108087 279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Ankrd34aB2RW11 Gm14865-201ENSMUST00000117523 494 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
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Ankrd34aB2RW11 Gm12740-201ENSMUST00000118794 308 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Ankrd34aB2RW11 Gm14541-201ENSMUST00000118985 157 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Ankrd34aB2RW11 Gm12710-201ENSMUST00000119011 216 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Ankrd34aB2RW11 Gm12519-201ENSMUST00000134099 693 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Ankrd34aB2RW11 Gm12833-201ENSMUST00000136112 477 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Ankrd34aB2RW11 Gm13905-201ENSMUST00000140009 579 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Ankrd34aB2RW11 Gm22765-201ENSMUST00000158371 128 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Ankrd34aB2RW11 Gm16027-201ENSMUST00000161618 758 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Ankrd34aB2RW11 Bhlhe40-202ENSMUST00000163617 476 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Ankrd34aB2RW11 Calml4-202ENSMUST00000163820 699 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Ankrd34aB2RW11 Gm20491-201ENSMUST00000173765 1241 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Ankrd34aB2RW11 AU023070-201ENSMUST00000176972 387 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Ankrd34aB2RW11 Gm23191-201ENSMUST00000179147 107 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Ankrd34aB2RW11 Rpl31-ps21-201ENSMUST00000181182 374 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Ankrd34aB2RW11 Mir7072-201ENSMUST00000184542 60 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
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Ankrd34aB2RW11 Igkv4-83-201ENSMUST00000196933 334 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Ankrd34aB2RW11 Gm43739-201ENSMUST00000198294 307 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Ankrd34aB2RW11 Ndufa4-204ENSMUST00000204714 452 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Ankrd34aB2RW11 Gm44571-201ENSMUST00000208092 533 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Ankrd34aB2RW11 BC024386-205ENSMUST00000210080 731 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
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Ankrd34aB2RW11 Gm39329-201ENSMUST00000215849 798 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Ankrd34aB2RW11 CAAA01216754.6-201ENSMUST00000217183 398 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
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Ankrd34aB2RW11 Gm9318-201ENSMUST00000222444 438 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
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Ankrd34aB2RW11 CT485612.2-201ENSMUST00000223014 151 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
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Ankrd34aB2RW11 Ninj2-201ENSMUST00000035244 823 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
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Ankrd34aB2RW11 Mir138-1-201ENSMUST00000083480 99 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
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Ankrd34aB2RW11 Fam19a1-201ENSMUST00000075080 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
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Ankrd34aB2RW11 Trim43b-202ENSMUST00000189557 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
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Ankrd34aB2RW11 Apobec3-209ENSMUST00000176325 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Ankrd34aB2RW11 G6pc2-202ENSMUST00000112317 1749 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
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Ankrd34aB2RW11 Sh3rf2-202ENSMUST00000074679 4444 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Ankrd34aB2RW11 Gm15097-201ENSMUST00000101180 2029 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Ankrd34aB2RW11 Gm15107-201ENSMUST00000112796 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Ankrd34aB2RW11 Gm15080-201ENSMUST00000112804 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Ankrd34aB2RW11 Ott-201ENSMUST00000177554 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Ankrd34aB2RW11 Ott-202ENSMUST00000177606 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Ankrd34aB2RW11 Gm15085-201ENSMUST00000178169 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Ankrd34aB2RW11 Ott-203ENSMUST00000179348 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
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Ankrd34aB2RW11 Cdhr3-201ENSMUST00000095774 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Ankrd34aB2RW11 Gm14896-201ENSMUST00000121311 1351 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
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Ankrd34aB2RW11 Myot-202ENSMUST00000115498 2087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Ankrd34aB2RW11 Gm14988-201ENSMUST00000117224 1548 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Ankrd34aB2RW11 Itpr2-201ENSMUST00000053273 8331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Ankrd34aB2RW11 Gm42820-201ENSMUST00000200084 3063 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
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Ankrd34aB2RW11 Trim60-201ENSMUST00000048565 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Ankrd34aB2RW11 Clasp1-212ENSMUST00000189262 6918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Ankrd34aB2RW11 Trbv13-2-201ENSMUST00000103270 340 ntAPPRIS P1 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Ankrd34aB2RW11 Pde4b-204ENSMUST00000106901 2129 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Ankrd34aB2RW11 Gm24586-201ENSMUST00000116695 89 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Ankrd34aB2RW11 Vmn1r-ps108-201ENSMUST00000117059 365 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Ankrd34aB2RW11 Gm12245-201ENSMUST00000117266 357 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 98.1 ms