Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Lipm-201ENSMUST00000025685 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
Col5a3Q9JLI2 Pcsk1-201ENSMUST00000022075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
Col5a3Q9JLI2 Olfr396-ps1-201ENSMUST00000143750 1675 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
Col5a3Q9JLI2 Olfr799-203ENSMUST00000214182 1694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
Col5a3Q9JLI2 Zfp811-201ENSMUST00000080905 1656 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
Col5a3Q9JLI2 Gm28964-202ENSMUST00000186771 1502 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
Col5a3Q9JLI2 Gm29301-202ENSMUST00000189344 1502 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
Col5a3Q9JLI2 Gm29515-201ENSMUST00000188273 2077 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
Col5a3Q9JLI2 Btbd35f13-201ENSMUST00000177912 1701 ntAPPRIS P1 BASIC5.14□□□□□ -1.59
Col5a3Q9JLI2 Olfr495-202ENSMUST00000215215 2460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
Col5a3Q9JLI2 Gabpb2-204ENSMUST00000107209 8357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
Col5a3Q9JLI2 Zfp867-201ENSMUST00000057799 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
Col5a3Q9JLI2 Olfr1500-205ENSMUST00000216287 2178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r220-203ENSMUST00000227679 7868 ntAPPRIS P1 BASIC5.14□□□□□ -1.59
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r220-206ENSMUST00000228854 7854 ntAPPRIS P1 BASIC5.14□□□□□ -1.59
Col5a3Q9JLI2 Gm14688-201ENSMUST00000119169 303 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Col5a3Q9JLI2 Gm2165-201ENSMUST00000124609 1118 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
Col5a3Q9JLI2 Gm14553-201ENSMUST00000126711 1118 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
Col5a3Q9JLI2 Gm2101-204ENSMUST00000137421 1118 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
Col5a3Q9JLI2 Gm3669-205ENSMUST00000144018 1118 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
Col5a3Q9JLI2 Reg3d-202ENSMUST00000167492 644 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
Col5a3Q9JLI2 Gm17571-201ENSMUST00000167906 90 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r57-201ENSMUST00000170780 933 ntAPPRIS P1 BASIC5.14□□□□□ -1.59
Col5a3Q9JLI2 Gm19807-201ENSMUST00000173971 667 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Col5a3Q9JLI2 Gm27308-201ENSMUST00000184807 233 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Col5a3Q9JLI2 Gm3259-205ENSMUST00000185432 1077 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
Col5a3Q9JLI2 4930503O07Rik-201ENSMUST00000193395 578 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
Col5a3Q9JLI2 Reg3d-203ENSMUST00000205240 544 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
Col5a3Q9JLI2 Snhg1-207ENSMUST00000205909 709 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
Col5a3Q9JLI2 Gm21885-202ENSMUST00000208510 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
Col5a3Q9JLI2 AC132315.1-201ENSMUST00000221771 390 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Col5a3Q9JLI2 Gm7093-201ENSMUST00000223004 581 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Col5a3Q9JLI2 AC116589.3-201ENSMUST00000223034 1165 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
Col5a3Q9JLI2 Reg3d-201ENSMUST00000089667 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
Col5a3Q9JLI2 Gm43990-201ENSMUST00000203790 1691 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Col5a3Q9JLI2 Gm35066-201ENSMUST00000198898 2074 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
Col5a3Q9JLI2 Tlr6-201ENSMUST00000062315 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
Col5a3Q9JLI2 Cped1-202ENSMUST00000115383 5690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
Col5a3Q9JLI2 R3hdm1-201ENSMUST00000036288 4795 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
Col5a3Q9JLI2 Spp1-204ENSMUST00000112747 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
Col5a3Q9JLI2 AC159326.1-201ENSMUST00000219989 1302 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Col5a3Q9JLI2 Olfr596-202ENSMUST00000214577 3392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Col5a3Q9JLI2 AC113059.3-201ENSMUST00000217423 2777 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Col5a3Q9JLI2 Rbms3-206ENSMUST00000111773 7908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Col5a3Q9JLI2 Gm26764-201ENSMUST00000181175 2596 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Col5a3Q9JLI2 Gm17275-201ENSMUST00000181811 2550 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Col5a3Q9JLI2 Gm19950-204ENSMUST00000208167 4196 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Col5a3Q9JLI2 AC153964.1-201ENSMUST00000219677 3142 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Col5a3Q9JLI2 Zfp955b-201ENSMUST00000099414 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Col5a3Q9JLI2 Synpr-207ENSMUST00000223583 3362 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Col5a3Q9JLI2 Gm26786-201ENSMUST00000180410 6243 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Col5a3Q9JLI2 Olfr1204-202ENSMUST00000213283 6935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Col5a3Q9JLI2 Cdc42bpa-202ENSMUST00000097450 5160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Col5a3Q9JLI2 Map2-205ENSMUST00000114015 5440 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Col5a3Q9JLI2 Gm24935-201ENSMUST00000103770 110 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Col5a3Q9JLI2 Gm23481-201ENSMUST00000104173 131 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Col5a3Q9JLI2 Gm12112-201ENSMUST00000117772 231 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Col5a3Q9JLI2 Gm12252-201ENSMUST00000119517 219 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Col5a3Q9JLI2 Xlr3e-ps-201ENSMUST00000119644 682 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Col5a3Q9JLI2 Gm14656-201ENSMUST00000120342 502 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Col5a3Q9JLI2 Gm15799-201ENSMUST00000120899 289 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Col5a3Q9JLI2 Xlr3d-ps-201ENSMUST00000121687 658 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Col5a3Q9JLI2 4930517O19Rik-202ENSMUST00000145018 571 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Col5a3Q9JLI2 Gm17916-202ENSMUST00000187634 1187 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Col5a3Q9JLI2 1700031M16Rik-204ENSMUST00000189724 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Col5a3Q9JLI2 1700031M16Rik-207ENSMUST00000191513 847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Col5a3Q9JLI2 Gm38053-201ENSMUST00000193938 160 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Col5a3Q9JLI2 Gm37359-201ENSMUST00000195243 526 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Col5a3Q9JLI2 Gm43144-201ENSMUST00000198256 485 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Col5a3Q9JLI2 Gm45839-201ENSMUST00000209884 399 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Col5a3Q9JLI2 Olfr175-ps1-202ENSMUST00000215069 1201 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Col5a3Q9JLI2 AC114573.1-201ENSMUST00000224120 1210 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Col5a3Q9JLI2 Olfr175-ps1-201ENSMUST00000079955 1169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Col5a3Q9JLI2 Mir383-201ENSMUST00000083523 70 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Col5a3Q9JLI2 Obp1b-201ENSMUST00000088198 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Col5a3Q9JLI2 n-R5s152-201ENSMUST00000093641 119 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Col5a3Q9JLI2 Cmah-208ENSMUST00000224819 9482 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Col5a3Q9JLI2 Pcdh15-202ENSMUST00000092420 6917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Col5a3Q9JLI2 Kif27-201ENSMUST00000043605 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Col5a3Q9JLI2 Gm19666-201ENSMUST00000198176 1893 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Col5a3Q9JLI2 Dcun1d4-202ENSMUST00000087181 4117 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Col5a3Q9JLI2 Olfr1097-202ENSMUST00000217403 4430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Col5a3Q9JLI2 Gm44742-201ENSMUST00000207190 1412 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Col5a3Q9JLI2 Abca6-201ENSMUST00000044003 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Col5a3Q9JLI2 Ctsm-201ENSMUST00000099451 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Col5a3Q9JLI2 Olfr1293-ps-203ENSMUST00000217845 3628 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Col5a3Q9JLI2 Maoa-201ENSMUST00000026013 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Col5a3Q9JLI2 Gm17540-201ENSMUST00000181617 1528 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Col5a3Q9JLI2 Top2a-201ENSMUST00000068031 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Col5a3Q9JLI2 Olfr1330-202ENSMUST00000105035 1027 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Col5a3Q9JLI2 Gm16394-201ENSMUST00000117289 675 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Col5a3Q9JLI2 Gm11313-201ENSMUST00000118779 432 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Col5a3Q9JLI2 Gm12186-201ENSMUST00000119050 945 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Col5a3Q9JLI2 Gm4914-201ENSMUST00000119757 459 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Col5a3Q9JLI2 Gm3788-201ENSMUST00000119949 136 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Col5a3Q9JLI2 Gm14845-201ENSMUST00000121259 306 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Col5a3Q9JLI2 Gm1992-201ENSMUST00000161581 250 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Col5a3Q9JLI2 Gm7976-201ENSMUST00000181507 1242 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Col5a3Q9JLI2 Gm29479-201ENSMUST00000190352 455 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Col5a3Q9JLI2 Gm44820-201ENSMUST00000207420 396 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.6 ms