Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES63

Usp29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, mousemouse

Predictions only

Length 869 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp29Q9ES63 Trav6-5-202ENSMUST00000183488 335 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Usp29Q9ES63 Gm27255-201ENSMUST00000184303 529 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Usp29Q9ES63 Ssxb8-202ENSMUST00000185125 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Usp29Q9ES63 Gm28429-201ENSMUST00000188521 363 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Usp29Q9ES63 Gm4322-201ENSMUST00000191094 336 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Usp29Q9ES63 Gm9931-201ENSMUST00000193584 1185 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Usp29Q9ES63 Gm9317-201ENSMUST00000197055 862 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Usp29Q9ES63 Gm5309-201ENSMUST00000197416 677 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Usp29Q9ES63 Gm22897-202ENSMUST00000197782 127 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Usp29Q9ES63 Gm43116-201ENSMUST00000199789 195 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Usp29Q9ES63 Gm43342-201ENSMUST00000201027 924 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Usp29Q9ES63 Gm44972-201ENSMUST00000206419 406 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Usp29Q9ES63 1700095K22Rik-201ENSMUST00000206808 282 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Usp29Q9ES63 Gm45636-201ENSMUST00000210497 1064 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Usp29Q9ES63 AC112956.1-201ENSMUST00000213563 492 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Usp29Q9ES63 AC164576.1-201ENSMUST00000218783 693 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Usp29Q9ES63 Gm6056-201ENSMUST00000221253 488 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Usp29Q9ES63 Gm9269-201ENSMUST00000221661 578 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Usp29Q9ES63 Gm34719-201ENSMUST00000222231 382 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Usp29Q9ES63 Gm16497-202ENSMUST00000223480 557 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Usp29Q9ES63 Tpbpb-202ENSMUST00000223698 746 ntAPPRIS P2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Usp29Q9ES63 AC133654.1-201ENSMUST00000228411 672 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Usp29Q9ES63 4930568D16Rik-201ENSMUST00000028243 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Usp29Q9ES63 Cetn2-201ENSMUST00000033713 1026 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Usp29Q9ES63 Orm3-201ENSMUST00000006687 773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Usp29Q9ES63 Gm24525-201ENSMUST00000082917 151 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Usp29Q9ES63 Sirpb1a-203ENSMUST00000192700 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Usp29Q9ES63 Gm43466-201ENSMUST00000197836 5214 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Usp29Q9ES63 Scfd1-201ENSMUST00000021335 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Usp29Q9ES63 Olfr877-202ENSMUST00000213956 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Usp29Q9ES63 Vps50-202ENSMUST00000164052 4824 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Usp29Q9ES63 Gm42702-201ENSMUST00000199515 4217 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Usp29Q9ES63 Olfr221-202ENSMUST00000214071 3044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Usp29Q9ES63 Agps-203ENSMUST00000175646 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Usp29Q9ES63 Abcg3-202ENSMUST00000130644 2668 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Usp29Q9ES63 Olfr983-202ENSMUST00000213087 6196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Usp29Q9ES63 Crem-230ENSMUST00000151311 2485 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Usp29Q9ES63 Slc22a30-202ENSMUST00000096269 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Usp29Q9ES63 Olfr350-203ENSMUST00000215100 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Usp29Q9ES63 Gm26745-201ENSMUST00000181022 1874 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Usp29Q9ES63 Kcnj2-201ENSMUST00000042970 5444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Usp29Q9ES63 Vmn1r171-201ENSMUST00000078458 1581 ntAPPRIS P2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Usp29Q9ES63 Cntnap5c-201ENSMUST00000076038 3931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Usp29Q9ES63 Lrrc69-202ENSMUST00000108276 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Usp29Q9ES63 Gm12885-201ENSMUST00000122246 328 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Usp29Q9ES63 Gm22895-201ENSMUST00000157508 308 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Usp29Q9ES63 Gm25348-201ENSMUST00000158961 111 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Usp29Q9ES63 Gm7609-204ENSMUST00000161424 461 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Usp29Q9ES63 Vmn2r-ps118-201ENSMUST00000176785 908 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Usp29Q9ES63 Gm21860-201ENSMUST00000177893 309 ntAPPRIS P1 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Usp29Q9ES63 Gm21748-201ENSMUST00000179623 309 ntAPPRIS P1 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Usp29Q9ES63 Gm27037-201ENSMUST00000182270 960 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Usp29Q9ES63 Gm27234-201ENSMUST00000183362 581 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Usp29Q9ES63 Gm29159-201ENSMUST00000187969 379 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Usp29Q9ES63 1700020G17Rik-202ENSMUST00000190237 739 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Usp29Q9ES63 Gm20915-201ENSMUST00000191575 663 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Usp29Q9ES63 Gm20770-201ENSMUST00000193474 694 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Usp29Q9ES63 Gm19057-201ENSMUST00000194329 1197 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Usp29Q9ES63 4921511E07Rik-201ENSMUST00000194790 827 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Usp29Q9ES63 Obox4-ps5-201ENSMUST00000196368 397 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Usp29Q9ES63 Gm32051-201ENSMUST00000196818 709 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Usp29Q9ES63 Obox4-ps4-201ENSMUST00000196934 397 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Usp29Q9ES63 Obox4-ps10-201ENSMUST00000199376 504 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Usp29Q9ES63 Chaer1-201ENSMUST00000201649 651 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Usp29Q9ES63 Gm44796-201ENSMUST00000205272 626 ntTSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Usp29Q9ES63 Gm20948-201ENSMUST00000211091 449 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Usp29Q9ES63 Gm45908-201ENSMUST00000212977 1177 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Usp29Q9ES63 Gm45722-201ENSMUST00000213075 466 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Usp29Q9ES63 Olfr950-ps1-201ENSMUST00000213804 878 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Usp29Q9ES63 Olfr1065-202ENSMUST00000216162 2148 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Usp29Q9ES63 AC159297.2-201ENSMUST00000219567 1075 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Usp29Q9ES63 CT030182.2-201ENSMUST00000223569 620 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Usp29Q9ES63 AC154583.1-201ENSMUST00000224788 655 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Usp29Q9ES63 AC099612.2-201ENSMUST00000226824 721 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Usp29Q9ES63 AC154738.4-201ENSMUST00000228310 414 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Usp29Q9ES63 C130073F10Rik-201ENSMUST00000051043 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Usp29Q9ES63 Sprr3-201ENSMUST00000058142 1222 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Usp29Q9ES63 Olfr867-201ENSMUST00000060780 996 ntAPPRIS P1 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Usp29Q9ES63 Serpinb9d-201ENSMUST00000067198 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Usp29Q9ES63 Olfr801-201ENSMUST00000072063 957 ntAPPRIS P1 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Usp29Q9ES63 Gm5471-201ENSMUST00000072732 337 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Usp29Q9ES63 Olfr248-201ENSMUST00000075329 1010 ntAPPRIS P1 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Usp29Q9ES63 Olfr192-201ENSMUST00000080251 925 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Usp29Q9ES63 Zfp934-201ENSMUST00000082203 993 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Usp29Q9ES63 Gm26163-201ENSMUST00000083792 178 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Usp29Q9ES63 Mrgprb3-201ENSMUST00000094383 1009 ntAPPRIS P1 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Usp29Q9ES63 Olfr1061-201ENSMUST00000099889 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Usp29Q9ES63 Gm44175-201ENSMUST00000204863 4256 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Usp29Q9ES63 Gm14569-204ENSMUST00000169499 5181 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Usp29Q9ES63 Gm13058-201ENSMUST00000117097 1435 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Usp29Q9ES63 Mdga2-211ENSMUST00000222623 1449 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Usp29Q9ES63 Nfia-201ENSMUST00000052018 9249 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Usp29Q9ES63 Gm15337-201ENSMUST00000135378 3888 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Usp29Q9ES63 5430403G16Rik-201ENSMUST00000092720 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Usp29Q9ES63 Kif2a-201ENSMUST00000022204 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
Usp29Q9ES63 AI987944-201ENSMUST00000071804 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
Usp29Q9ES63 Dazl-201ENSMUST00000010736 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
Usp29Q9ES63 Gm37779-201ENSMUST00000194221 3380 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Usp29Q9ES63 Sdr16c6-202ENSMUST00000108383 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
Usp29Q9ES63 Usp25-201ENSMUST00000023580 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
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