Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

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Length 1,455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Nav3-201ENSMUST00000032719 9962 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
Ccdc18Q640L5 Fam107b-209ENSMUST00000226435 3602 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
Ccdc18Q640L5 Vmn1r71-201ENSMUST00000079113 4996 ntAPPRIS P2 BASIC7.93□□□□□ -1.14
Ccdc18Q640L5 Csrnp3-204ENSMUST00000122912 10672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Ccdc18Q640L5 3222401L13Rik-202ENSMUST00000192137 6292 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
Ccdc18Q640L5 Slc24a2-203ENSMUST00000107157 10531 ntTSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Ccdc18Q640L5 Abcb7-201ENSMUST00000033695 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Ccdc18Q640L5 Gm12427-201ENSMUST00000117719 302 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
Ccdc18Q640L5 Gm14067-201ENSMUST00000119340 314 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
Ccdc18Q640L5 Gm15288-201ENSMUST00000126640 653 ntTSL 3 BASIC7.93□□□□□ -1.14
Ccdc18Q640L5 Gm16125-201ENSMUST00000159003 339 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
Ccdc18Q640L5 Dlx6os1-204ENSMUST00000184182 146 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
Ccdc18Q640L5 Gm35325-201ENSMUST00000208979 771 ntTSL 2 BASIC7.93□□□□□ -1.14
Ccdc18Q640L5 Gm45604-201ENSMUST00000209665 550 ntTSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Ccdc18Q640L5 AC163651.2-202ENSMUST00000222628 1192 ntTSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
Ccdc18Q640L5 Fam183b-201ENSMUST00000060581 493 ntTSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Ccdc18Q640L5 Olfr876-201ENSMUST00000086064 1048 ntAPPRIS P1 BASIC7.93□□□□□ -1.14
Ccdc18Q640L5 Olfr570-201ENSMUST00000098215 1045 ntAPPRIS P1 BASIC7.93□□□□□ -1.14
Ccdc18Q640L5 Abi1-205ENSMUST00000123948 3067 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Ccdc18Q640L5 Olfr705-202ENSMUST00000213721 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
Ccdc18Q640L5 Vmn1r71-203ENSMUST00000227003 5048 ntAPPRIS P2 BASIC7.92□□□□□ -1.14
Ccdc18Q640L5 Glyat-202ENSMUST00000119960 3296 ntTSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Ccdc18Q640L5 Ctsm-201ENSMUST00000099451 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Ccdc18Q640L5 Cc2d2b-205ENSMUST00000224596 4762 ntAPPRIS P1 BASIC7.92□□□□□ -1.14
Ccdc18Q640L5 Abcg3-202ENSMUST00000130644 2668 ntTSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
Ccdc18Q640L5 AC159188.2-201ENSMUST00000224103 1301 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
Ccdc18Q640L5 Gm43426-201ENSMUST00000197287 2597 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
Ccdc18Q640L5 Olfr1330-202ENSMUST00000105035 1027 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.92□□□□□ -1.14
Ccdc18Q640L5 Gm13132-201ENSMUST00000121194 472 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
Ccdc18Q640L5 Gm14122-201ENSMUST00000122076 973 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
Ccdc18Q640L5 Gm16084-201ENSMUST00000148122 620 ntTSL 3 BASIC7.92□□□□□ -1.14
Ccdc18Q640L5 Gm12214-201ENSMUST00000151643 417 ntTSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
Ccdc18Q640L5 2810429I04Rik-209ENSMUST00000188642 674 ntTSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Ccdc18Q640L5 2310020H05Rik-201ENSMUST00000189489 720 ntTSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Ccdc18Q640L5 Gm37272-201ENSMUST00000193401 488 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
Ccdc18Q640L5 Zfp462-203ENSMUST00000098070 10465 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
Ccdc18Q640L5 Ptprc-204ENSMUST00000182755 4611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Ccdc18Q640L5 Dach2-204ENSMUST00000113380 2894 ntTSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Ccdc18Q640L5 Zfp607a-203ENSMUST00000205715 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
Ccdc18Q640L5 Cntnap5b-201ENSMUST00000086738 4027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.92□□□□□ -1.14
Ccdc18Q640L5 Gm9700-201ENSMUST00000193786 1617 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
Ccdc18Q640L5 Trrap-201ENSMUST00000038980 12344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
Ccdc18Q640L5 Olfr32-204ENSMUST00000215153 3117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.91□□□□□ -1.14
Ccdc18Q640L5 Ino80d-206ENSMUST00000172416 13438 ntTSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
Ccdc18Q640L5 Cyp4a31-202ENSMUST00000030486 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
Ccdc18Q640L5 Olfr986-204ENSMUST00000218134 3487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
Ccdc18Q640L5 Olfr78-201ENSMUST00000060187 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Ccdc18Q640L5 Gm37087-201ENSMUST00000192966 3309 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
Ccdc18Q640L5 Gm37752-201ENSMUST00000193494 3309 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
Ccdc18Q640L5 Oog3-201ENSMUST00000050933 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Ccdc18Q640L5 Vmn1r80-206ENSMUST00000228028 6918 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
Ccdc18Q640L5 Rnf24-201ENSMUST00000059372 5978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Ccdc18Q640L5 Trav10-201ENSMUST00000103583 406 ntAPPRIS P1 BASIC7.91□□□□□ -1.14
Ccdc18Q640L5 Prl2c1-202ENSMUST00000110335 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
Ccdc18Q640L5 Gm15058-201ENSMUST00000117689 458 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
Ccdc18Q640L5 Olfr343-ps1-201ENSMUST00000121883 303 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
Ccdc18Q640L5 Gm13348-201ENSMUST00000147324 690 ntTSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
Ccdc18Q640L5 Rpl31-ps18-201ENSMUST00000180885 377 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
Ccdc18Q640L5 Gm33758-201ENSMUST00000199230 407 ntTSL 3 BASIC7.91□□□□□ -1.14
Ccdc18Q640L5 Gm18258-201ENSMUST00000210413 542 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
Ccdc18Q640L5 6430710M23Rik-201ENSMUST00000210843 1191 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
Ccdc18Q640L5 Gm7807-201ENSMUST00000212475 578 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
Ccdc18Q640L5 2210414F02Rik-201ENSMUST00000215316 396 ntTSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Ccdc18Q640L5 Gm7093-201ENSMUST00000223004 581 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
Ccdc18Q640L5 Mir338-201ENSMUST00000083666 98 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
Ccdc18Q640L5 Dennd4c-204ENSMUST00000142837 5870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Ccdc18Q640L5 Ttc39d-201ENSMUST00000053168 2022 ntAPPRIS P1 BASIC7.91□□□□□ -1.14
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Ccdc18Q640L5 A930004J17Rik-201ENSMUST00000192689 4610 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
Ccdc18Q640L5 Ndnf-201ENSMUST00000054351 10101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Ccdc18Q640L5 AC121844.3-201ENSMUST00000219124 1785 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
Ccdc18Q640L5 Olfr432-202ENSMUST00000213211 4435 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
Ccdc18Q640L5 Atr-213ENSMUST00000215311 8102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
Ccdc18Q640L5 Kcnma1-204ENSMUST00000112423 3664 ntTSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
Ccdc18Q640L5 Gm43953-201ENSMUST00000203709 2867 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
Ccdc18Q640L5 Gm22501-201ENSMUST00000158981 127 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
Ccdc18Q640L5 Vmn1r113-201ENSMUST00000168794 894 ntTSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
Ccdc18Q640L5 Gm18177-201ENSMUST00000188373 404 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
Ccdc18Q640L5 Gm8911-201ENSMUST00000213986 652 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
Ccdc18Q640L5 AC153729.2-201ENSMUST00000215166 560 ntTSL 3 BASIC7.9□□□□□ -1.14
Ccdc18Q640L5 Ifngas1-201ENSMUST00000220034 1121 ntTSL 2 BASIC7.9□□□□□ -1.14
Ccdc18Q640L5 3830408C21Rik-203ENSMUST00000224293 822 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
Ccdc18Q640L5 Mir412-201ENSMUST00000083636 80 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
Ccdc18Q640L5 Olfr259-201ENSMUST00000099862 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.9□□□□□ -1.14
Ccdc18Q640L5 Olfr979-202ENSMUST00000215523 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
Ccdc18Q640L5 Gm28964-202ENSMUST00000186771 1502 ntTSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
Ccdc18Q640L5 Gm29301-202ENSMUST00000189344 1502 ntTSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
Ccdc18Q640L5 Gm13057-201ENSMUST00000105776 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.15
Ccdc18Q640L5 Gm35066-201ENSMUST00000198898 2074 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.15
Ccdc18Q640L5 Sphkap-205ENSMUST00000160953 8154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.15
Ccdc18Q640L5 Ckap5-203ENSMUST00000111337 6384 ntTSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.15
Ccdc18Q640L5 Olfr1301-202ENSMUST00000207590 4820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.9□□□□□ -1.15
Ccdc18Q640L5 Entpd1-201ENSMUST00000112231 4221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.15
Ccdc18Q640L5 Ccdc186-201ENSMUST00000076085 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.15
Ccdc18Q640L5 Stk31-204ENSMUST00000172459 2922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Ccdc18Q640L5 Vmn2r110-201ENSMUST00000169559 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Ccdc18Q640L5 Gm15603-201ENSMUST00000119252 492 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Ccdc18Q640L5 Gm16222-201ENSMUST00000124320 1298 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Ccdc18Q640L5 Gm11418-201ENSMUST00000156193 626 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.9 ms