Protein–RNA interactions for Protein: P41245

Mmp9, Matrix metalloproteinase-9, mousemouse

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Length 730 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp9P41245 Serpinb1-ps1-201ENSMUST00000118548 586 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
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Mmp9P41245 Gm12730-201ENSMUST00000125277 291 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Mmp9P41245 Gm12160-201ENSMUST00000146372 342 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Mmp9P41245 Gm12148-201ENSMUST00000153791 292 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Mmp9P41245 4930548K13Rik-201ENSMUST00000154459 561 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Mmp9P41245 1700080G11Rik-201ENSMUST00000156401 436 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Mmp9P41245 Gm23553-201ENSMUST00000157817 295 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Mmp9P41245 Gm26037-201ENSMUST00000158150 311 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Mmp9P41245 Prl3d2-202ENSMUST00000164964 675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
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Mmp9P41245 Smr3a-202ENSMUST00000189633 467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
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Mmp9P41245 Ctla4-202ENSMUST00000097720 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Mmp9P41245 Bcl2a1a-201ENSMUST00000098485 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
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Mmp9P41245 Gm13480-201ENSMUST00000125095 1000 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
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Mmp9P41245 Gm16343-201ENSMUST00000162027 410 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
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Mmp9P41245 Gm4152-201ENSMUST00000172675 259 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Mmp9P41245 Mir7235-201ENSMUST00000183796 56 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Mmp9P41245 Gm18728-201ENSMUST00000186155 753 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Mmp9P41245 Gm18447-201ENSMUST00000187501 307 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Mmp9P41245 Gm8241-201ENSMUST00000189286 816 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Mmp9P41245 Gm28788-201ENSMUST00000189717 375 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Mmp9P41245 Gm29558-201ENSMUST00000190134 375 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Mmp9P41245 1700025B11Rik-201ENSMUST00000190233 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
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