Protein–RNA interactions for Protein: Q149F1

Rpusd2, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd2Q149F1 Bdnf-204ENSMUST00000111044 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Rpusd2Q149F1 Reep3-202ENSMUST00000217841 2925 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Rpusd2Q149F1 Gm44046-201ENSMUST00000203145 2678 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Rpusd2Q149F1 Vmn1r26-204ENSMUST00000228951 4591 ntAPPRIS P1 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Rpusd2Q149F1 Nsun4-202ENSMUST00000030475 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Rpusd2Q149F1 Gm43728-201ENSMUST00000198817 2622 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Rpusd2Q149F1 Gm14373-201ENSMUST00000122467 2158 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Rpusd2Q149F1 Gm45073-201ENSMUST00000207688 4247 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Rpusd2Q149F1 Zfp583-206ENSMUST00000165705 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Rpusd2Q149F1 G6pd2-201ENSMUST00000053876 2348 ntAPPRIS P1 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Rpusd2Q149F1 C87436-201ENSMUST00000050497 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Rpusd2Q149F1 Olfr76-202ENSMUST00000213471 3109 ntTSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Rpusd2Q149F1 Piwil2-201ENSMUST00000048129 4916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Rpusd2Q149F1 F13a1-202ENSMUST00000164727 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Rpusd2Q149F1 Gm13712-201ENSMUST00000117484 2295 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Rpusd2Q149F1 Gm43718-201ENSMUST00000197524 1857 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Rpusd2Q149F1 Klra1-201ENSMUST00000032288 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Rpusd2Q149F1 Olfr1384-202ENSMUST00000213776 4437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Rpusd2Q149F1 Glrb-202ENSMUST00000107743 1101 ntTSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Rpusd2Q149F1 Mir466i-201ENSMUST00000116924 121 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Rpusd2Q149F1 Gm6893-201ENSMUST00000118385 522 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Rpusd2Q149F1 Gm11794-201ENSMUST00000119446 237 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Rpusd2Q149F1 Gm11504-201ENSMUST00000120211 173 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Rpusd2Q149F1 Gm15158-201ENSMUST00000120577 570 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Rpusd2Q149F1 Rps12-ps20-201ENSMUST00000121168 402 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Rpusd2Q149F1 Gm14038-201ENSMUST00000121500 807 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Rpusd2Q149F1 Gm13470-201ENSMUST00000123911 421 ntTSL 2 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Rpusd2Q149F1 Gm14364-201ENSMUST00000129209 267 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Rpusd2Q149F1 Tmbim6-203ENSMUST00000159531 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Rpusd2Q149F1 Gm17201-201ENSMUST00000167226 390 ntTSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Rpusd2Q149F1 Gm22132-201ENSMUST00000175316 100 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Rpusd2Q149F1 Cypt14-201ENSMUST00000179096 508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Rpusd2Q149F1 n-R5s109-201ENSMUST00000179195 119 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Rpusd2Q149F1 Rps12-ps23-201ENSMUST00000179414 402 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Rpusd2Q149F1 Gm27636-201ENSMUST00000184528 122 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Rpusd2Q149F1 Npn2-202ENSMUST00000189275 235 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Rpusd2Q149F1 Gm28822-201ENSMUST00000191140 778 ntTSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Rpusd2Q149F1 Igkv4-83-201ENSMUST00000196933 334 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Rpusd2Q149F1 Gm9560-201ENSMUST00000205012 1201 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Rpusd2Q149F1 Gm45082-201ENSMUST00000206082 601 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Rpusd2Q149F1 Gm44611-201ENSMUST00000207507 355 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Rpusd2Q149F1 Gm7760-201ENSMUST00000212265 578 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Rpusd2Q149F1 Gm7807-201ENSMUST00000212475 578 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Rpusd2Q149F1 AC108846.2-201ENSMUST00000214925 731 ntTSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Rpusd2Q149F1 AC153557.1-201ENSMUST00000217697 403 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Rpusd2Q149F1 Gm36501-201ENSMUST00000221857 745 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Rpusd2Q149F1 AC117588.3-201ENSMUST00000228517 325 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Rpusd2Q149F1 AC154738.7-201ENSMUST00000228606 579 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Rpusd2Q149F1 Olfr513-201ENSMUST00000055146 930 ntAPPRIS P1 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Rpusd2Q149F1 Gm24207-201ENSMUST00000082781 108 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Rpusd2Q149F1 A630072L19Rik-201ENSMUST00000180617 3405 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Rpusd2Q149F1 Uba1y-202ENSMUST00000190013 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Rpusd2Q149F1 AC134577.3-201ENSMUST00000226490 3000 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Rpusd2Q149F1 Kcnmb2-201ENSMUST00000119310 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Rpusd2Q149F1 Pcdh19-203ENSMUST00000167944 8407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Rpusd2Q149F1 Synj2-204ENSMUST00000115785 3778 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Rpusd2Q149F1 Gm44708-201ENSMUST00000205580 2237 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Rpusd2Q149F1 Olfr1048-202ENSMUST00000215607 2981 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Rpusd2Q149F1 Gm34549-201ENSMUST00000207057 1611 ntTSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Rpusd2Q149F1 Atp13a4-202ENSMUST00000057018 4054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Rpusd2Q149F1 Cnr1-202ENSMUST00000084736 5761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Rpusd2Q149F1 Gm37077-201ENSMUST00000195723 3691 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Rpusd2Q149F1 Gm18409-201ENSMUST00000218988 2506 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Rpusd2Q149F1 Bcorl1-201ENSMUST00000037596 7360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Rpusd2Q149F1 D630045J12Rik-201ENSMUST00000117556 10916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.16
Rpusd2Q149F1 Gm44689-201ENSMUST00000208786 1372 ntTSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.16
Rpusd2Q149F1 Dnah9-201ENSMUST00000080665 13798 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.16
Rpusd2Q149F1 E230015B07Rik-202ENSMUST00000159884 2822 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.16
Rpusd2Q149F1 Lin54-204ENSMUST00000137750 4056 ntTSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Rpusd2Q149F1 4930449A18Rik-201ENSMUST00000094228 2071 ntTSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Rpusd2Q149F1 Top3b-203ENSMUST00000119787 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Rpusd2Q149F1 Aldh1l2-201ENSMUST00000020497 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Rpusd2Q149F1 Rrh-201ENSMUST00000029648 1506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Rpusd2Q149F1 Sap30bp-203ENSMUST00000140991 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Rpusd2Q149F1 Kcnc2-202ENSMUST00000218445 4033 ntTSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Rpusd2Q149F1 Olfr1140-203ENSMUST00000217572 1327 ntAPPRIS P1 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Rpusd2Q149F1 Csde1-201ENSMUST00000029446 4318 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Rpusd2Q149F1 Zfp353-ps-201ENSMUST00000107130 1650 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Rpusd2Q149F1 Olfr1052-203ENSMUST00000217166 1694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Rpusd2Q149F1 Rsad2-201ENSMUST00000020970 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Rpusd2Q149F1 Olfr295-202ENSMUST00000215365 6013 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Rpusd2Q149F1 Muc5ac-202ENSMUST00000155534 10752 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Rpusd2Q149F1 Gm44847-201ENSMUST00000207104 1991 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Rpusd2Q149F1 Gm40020-201ENSMUST00000215677 1635 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Rpusd2Q149F1 Gm24069-201ENSMUST00000104512 127 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Rpusd2Q149F1 Gm11271-201ENSMUST00000116054 440 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Rpusd2Q149F1 Gm16205-201ENSMUST00000117720 1027 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Rpusd2Q149F1 Gm13085-201ENSMUST00000118356 171 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Rpusd2Q149F1 Rps12-ps19-201ENSMUST00000119773 400 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Rpusd2Q149F1 Gm14655-201ENSMUST00000120124 578 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Rpusd2Q149F1 Gm16100-201ENSMUST00000120489 231 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Rpusd2Q149F1 Gm22383-201ENSMUST00000158188 327 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Rpusd2Q149F1 Gm25660-201ENSMUST00000158470 104 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Rpusd2Q149F1 Gm25363-201ENSMUST00000158850 245 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Rpusd2Q149F1 Gm5225-201ENSMUST00000178572 324 ntAPPRIS P1 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Rpusd2Q149F1 Gm7952-201ENSMUST00000180540 984 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Rpusd2Q149F1 Gm28840-203ENSMUST00000187128 975 ntTSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Rpusd2Q149F1 Nabp1-207ENSMUST00000188204 972 ntTSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Rpusd2Q149F1 4632404H12Rik-202ENSMUST00000195940 4671 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Rpusd2Q149F1 Ghrl-202ENSMUST00000203363 400 ntTSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.3 ms