Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM73

Srf, Serum response factor, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrfQ9JM73 Pdlim5-205ENSMUST00000170361 2010 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
SrfQ9JM73 Ccdc127-201ENSMUST00000022063 9559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
SrfQ9JM73 Gm45112-201ENSMUST00000208576 5125 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
SrfQ9JM73 Gm10822-201ENSMUST00000181596 2320 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
SrfQ9JM73 Atp1a4-201ENSMUST00000111243 3470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
SrfQ9JM73 Gm43627-201ENSMUST00000197119 2299 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
SrfQ9JM73 Gm15834-202ENSMUST00000139825 2613 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
SrfQ9JM73 4930563E22Rik-201ENSMUST00000066087 3313 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
SrfQ9JM73 4930509K18Rik-201ENSMUST00000144039 1810 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
SrfQ9JM73 Gm4541-201ENSMUST00000208901 1848 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
SrfQ9JM73 AC153564.1-201ENSMUST00000217771 3607 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
SrfQ9JM73 Epha7-202ENSMUST00000080934 2880 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
SrfQ9JM73 Mbd3l2-202ENSMUST00000213777 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
SrfQ9JM73 Gm43789-201ENSMUST00000199275 2472 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
SrfQ9JM73 Amer1-201ENSMUST00000084535 8496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
SrfQ9JM73 Plb1-205ENSMUST00000202201 3539 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
SrfQ9JM73 A730091E23Rik-201ENSMUST00000221700 3825 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
SrfQ9JM73 Olfr1462-202ENSMUST00000208533 3424 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
SrfQ9JM73 AC130219.1-201ENSMUST00000228406 3433 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
SrfQ9JM73 Frem1-208ENSMUST00000170248 9527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
SrfQ9JM73 Osbpl3-202ENSMUST00000090019 4039 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
SrfQ9JM73 Gm43679-201ENSMUST00000197051 3677 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
SrfQ9JM73 Gm26656-201ENSMUST00000181825 2972 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
SrfQ9JM73 Pcyt1b-202ENSMUST00000113933 4867 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
SrfQ9JM73 Scd1-201ENSMUST00000041331 4836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
SrfQ9JM73 C8a-203ENSMUST00000106808 3539 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
SrfQ9JM73 Gm12805-201ENSMUST00000117305 1048 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
SrfQ9JM73 Vmn1r-ps93-201ENSMUST00000117599 432 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
SrfQ9JM73 Gm14790-201ENSMUST00000117760 1293 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
SrfQ9JM73 Gm13064-201ENSMUST00000119125 557 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
SrfQ9JM73 Gm11881-201ENSMUST00000119408 572 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
SrfQ9JM73 Gm14614-201ENSMUST00000119873 384 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
SrfQ9JM73 Gm11388-201ENSMUST00000120908 159 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
SrfQ9JM73 Gm12101-201ENSMUST00000121590 390 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
SrfQ9JM73 Xlr3d-ps-201ENSMUST00000121687 658 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
SrfQ9JM73 Gm25178-201ENSMUST00000122633 325 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
SrfQ9JM73 Gm11507-201ENSMUST00000156462 412 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
SrfQ9JM73 Gm26410-201ENSMUST00000157670 261 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
SrfQ9JM73 Gm26486-201ENSMUST00000158021 110 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
SrfQ9JM73 Gm22136-201ENSMUST00000158751 268 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
SrfQ9JM73 Gm8220-202ENSMUST00000169601 525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
SrfQ9JM73 Gm27018-201ENSMUST00000181136 225 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
SrfQ9JM73 Olr1-203ENSMUST00000182784 570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
SrfQ9JM73 Gm28023-201ENSMUST00000184556 60 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
SrfQ9JM73 Gm27825-201ENSMUST00000184586 60 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
SrfQ9JM73 Mrgprc1-ps-201ENSMUST00000185552 952 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
SrfQ9JM73 Gm29784-201ENSMUST00000196217 406 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
SrfQ9JM73 Gm43116-201ENSMUST00000199789 195 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
SrfQ9JM73 Gm43415-201ENSMUST00000201934 750 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
SrfQ9JM73 Gm42673-201ENSMUST00000202676 337 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
SrfQ9JM73 Kap-202ENSMUST00000203168 464 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
SrfQ9JM73 Gm45735-201ENSMUST00000212779 319 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
SrfQ9JM73 Gm2774-201ENSMUST00000213650 1165 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
SrfQ9JM73 Gm18586-201ENSMUST00000217265 518 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
SrfQ9JM73 AC164567.2-201ENSMUST00000219363 445 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
SrfQ9JM73 Gm6575-201ENSMUST00000222946 697 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
SrfQ9JM73 Lalba-201ENSMUST00000023726 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
SrfQ9JM73 Olfr690-201ENSMUST00000061920 1062 ntAPPRIS P1 BASIC6.59□□□□□ -1.35
SrfQ9JM73 Gm23515-201ENSMUST00000082829 107 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
SrfQ9JM73 Adgrl4-201ENSMUST00000046977 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
SrfQ9JM73 Igsf1-201ENSMUST00000033442 4421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
SrfQ9JM73 Trps1-201ENSMUST00000077935 4436 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
SrfQ9JM73 Rag2-202ENSMUST00000111227 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
SrfQ9JM73 C5ar2-201ENSMUST00000098792 3429 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
SrfQ9JM73 Gm5841-201ENSMUST00000195307 2177 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
SrfQ9JM73 AC125409.2-201ENSMUST00000221888 2158 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
SrfQ9JM73 Gprasp2-201ENSMUST00000113136 3736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
SrfQ9JM73 Qsox2-202ENSMUST00000091263 4011 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
SrfQ9JM73 Masp1-201ENSMUST00000089883 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
SrfQ9JM73 Vmn1r218-204ENSMUST00000227160 9558 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
SrfQ9JM73 Olfr12-202ENSMUST00000213247 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
SrfQ9JM73 Trim38-201ENSMUST00000074067 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.36
SrfQ9JM73 Hepacam2-201ENSMUST00000049985 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.36
SrfQ9JM73 Hmgb1-203ENSMUST00000110505 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.36
SrfQ9JM73 Abcc12-203ENSMUST00000131423 4893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.36
SrfQ9JM73 Speer5-ps1-201ENSMUST00000169525 1430 ntBASIC6.59□□□□□ -1.36
SrfQ9JM73 Vgll1-201ENSMUST00000033465 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.36
SrfQ9JM73 Irgm1-201ENSMUST00000049519 2259 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.36
SrfQ9JM73 Ikzf3-201ENSMUST00000103141 3658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
SrfQ9JM73 Gm4724-201ENSMUST00000109045 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
SrfQ9JM73 Gm45483-201ENSMUST00000209845 1682 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
SrfQ9JM73 Asxl2-201ENSMUST00000092003 11934 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
SrfQ9JM73 Plce1-201ENSMUST00000169713 9439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
SrfQ9JM73 Nt5dc1-203ENSMUST00000105512 2727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
SrfQ9JM73 Ep400-201ENSMUST00000041558 10608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
SrfQ9JM73 Olfr325-202ENSMUST00000203418 1649 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
SrfQ9JM73 Pnliprp1-201ENSMUST00000048644 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
SrfQ9JM73 Pknox2-202ENSMUST00000080754 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
SrfQ9JM73 Rdh1-201ENSMUST00000073639 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
SrfQ9JM73 Sfmbt2-205ENSMUST00000116594 7821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
SrfQ9JM73 Celf2-206ENSMUST00000114934 5470 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
SrfQ9JM73 Trim43b-202ENSMUST00000189557 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
SrfQ9JM73 AC153143.2-201ENSMUST00000220999 1804 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
SrfQ9JM73 Mir450-2-201ENSMUST00000102444 69 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
SrfQ9JM73 Mup1-203ENSMUST00000107499 797 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
SrfQ9JM73 Gm13733-201ENSMUST00000117290 535 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
SrfQ9JM73 Gm14750-201ENSMUST00000118262 516 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
SrfQ9JM73 Gm12053-201ENSMUST00000119022 252 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
SrfQ9JM73 Dnaic1-202ENSMUST00000119127 500 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
SrfQ9JM73 Gm5060-201ENSMUST00000120072 599 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.6 ms