Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 AC153924.1-201ENSMUST00000220117 312 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Rabgef1Q9JM13 AC153821.2-201ENSMUST00000220253 468 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Rabgef1Q9JM13 Vmn2r-ps99-201ENSMUST00000221276 1203 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Rabgef1Q9JM13 AC163354.1-203ENSMUST00000222356 643 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Rabgef1Q9JM13 AC113269.1-201ENSMUST00000227185 674 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Rabgef1Q9JM13 Capza3-201ENSMUST00000043797 1222 ntAPPRIS P1 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Rabgef1Q9JM13 Fgb-201ENSMUST00000048246 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Rabgef1Q9JM13 Ghrl-201ENSMUST00000064993 527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Rabgef1Q9JM13 n-R5s79-201ENSMUST00000083071 120 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Rabgef1Q9JM13 Pou2f1-205ENSMUST00000111427 13050 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Rabgef1Q9JM13 Gm6614-202ENSMUST00000181628 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Rabgef1Q9JM13 Clk1-201ENSMUST00000034868 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Rabgef1Q9JM13 Gm12018-201ENSMUST00000150694 3375 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Rabgef1Q9JM13 2900079G21Rik-204ENSMUST00000163302 2764 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Rabgef1Q9JM13 Gm43330-201ENSMUST00000199706 2153 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Rabgef1Q9JM13 Kat6b-ps2-201ENSMUST00000188339 1600 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Rabgef1Q9JM13 Gm1720-201ENSMUST00000135086 1503 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Rabgef1Q9JM13 CT009757.4-201ENSMUST00000221520 2541 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Rabgef1Q9JM13 Itih4-201ENSMUST00000006703 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Rabgef1Q9JM13 Olfr300-ps1-201ENSMUST00000174262 2395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Rabgef1Q9JM13 Gm10165-201ENSMUST00000217666 2380 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Rabgef1Q9JM13 Fignl1-202ENSMUST00000109664 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Rabgef1Q9JM13 Psg20-202ENSMUST00000108482 1871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Rabgef1Q9JM13 Olfr448-203ENSMUST00000214529 2764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Rabgef1Q9JM13 Spata22-201ENSMUST00000117445 3200 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Rabgef1Q9JM13 Enpp2-202ENSMUST00000167541 2664 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Rabgef1Q9JM13 4930563J15Rik-201ENSMUST00000218306 3468 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Rabgef1Q9JM13 Gm15140-201ENSMUST00000112565 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Rabgef1Q9JM13 Gm12492-201ENSMUST00000117665 564 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Rabgef1Q9JM13 Gm15766-201ENSMUST00000118025 813 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Rabgef1Q9JM13 Gm13349-201ENSMUST00000118436 411 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Rabgef1Q9JM13 Gm12016-201ENSMUST00000119079 681 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Rabgef1Q9JM13 Rpl26-ps5-201ENSMUST00000122220 439 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Rabgef1Q9JM13 Mup-ps2-201ENSMUST00000142602 533 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Rabgef1Q9JM13 Gm10057-201ENSMUST00000144098 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Rabgef1Q9JM13 Gm12860-201ENSMUST00000148457 957 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Rabgef1Q9JM13 2810442N19Rik-202ENSMUST00000161583 919 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Rabgef1Q9JM13 Gm3084-201ENSMUST00000169967 598 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Rabgef1Q9JM13 Olfr756-ps1-201ENSMUST00000173450 928 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Rabgef1Q9JM13 4921511M17Rik-201ENSMUST00000177994 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Rabgef1Q9JM13 Samt1-201ENSMUST00000178342 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Rabgef1Q9JM13 Samt1-202ENSMUST00000178698 834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Rabgef1Q9JM13 4921511M17Rik-202ENSMUST00000179369 834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Rabgef1Q9JM13 Gm5252-201ENSMUST00000189030 909 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Rabgef1Q9JM13 Nanog-ps2-201ENSMUST00000190988 529 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Rabgef1Q9JM13 Gm8823-201ENSMUST00000193158 433 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Rabgef1Q9JM13 Gm38108-201ENSMUST00000193891 399 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Rabgef1Q9JM13 Gm42896-201ENSMUST00000201249 1113 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Rabgef1Q9JM13 Ndufa4-204ENSMUST00000204714 452 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Rabgef1Q9JM13 AC161456.1-201ENSMUST00000206771 887 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Rabgef1Q9JM13 Gm45690-201ENSMUST00000210775 246 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Rabgef1Q9JM13 Dynlrb2-202ENSMUST00000213007 527 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Rabgef1Q9JM13 4933432G23Rik-201ENSMUST00000213675 840 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Rabgef1Q9JM13 AC157085.1-201ENSMUST00000216343 162 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Rabgef1Q9JM13 AC102435.1-201ENSMUST00000222199 908 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Rabgef1Q9JM13 AC123705.4-201ENSMUST00000222411 493 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Rabgef1Q9JM13 Trappc1-201ENSMUST00000060956 628 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Rabgef1Q9JM13 Olfr395-201ENSMUST00000072991 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Rabgef1Q9JM13 Dynlrb2-201ENSMUST00000078170 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Rabgef1Q9JM13 Mir196a-1-201ENSMUST00000083612 102 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Rabgef1Q9JM13 Olfr583-201ENSMUST00000098211 960 ntAPPRIS P1 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Rabgef1Q9JM13 Gm43874-201ENSMUST00000204853 2798 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Rabgef1Q9JM13 Il7r-201ENSMUST00000003981 3540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Rabgef1Q9JM13 Gm765-201ENSMUST00000164491 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Rabgef1Q9JM13 Sult1b1-201ENSMUST00000031199 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Rabgef1Q9JM13 Olfr1333-202ENSMUST00000214477 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Rabgef1Q9JM13 Slc22a26-202ENSMUST00000120522 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Rabgef1Q9JM13 Gm37079-201ENSMUST00000194114 2135 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Rabgef1Q9JM13 Naip3-201ENSMUST00000118082 4208 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Rabgef1Q9JM13 Lifr-203ENSMUST00000171588 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Rabgef1Q9JM13 Lpar6-201ENSMUST00000044405 5400 ntAPPRIS P1 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Rabgef1Q9JM13 Gm7646-201ENSMUST00000198590 1346 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Rabgef1Q9JM13 Olfr1140-203ENSMUST00000217572 1327 ntAPPRIS P1 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Rabgef1Q9JM13 Gm13544-201ENSMUST00000131189 2940 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Rabgef1Q9JM13 Cwf19l1-201ENSMUST00000026218 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Rabgef1Q9JM13 Ighv12-3-201ENSMUST00000103485 353 ntAPPRIS P1 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Rabgef1Q9JM13 Gm14769-201ENSMUST00000118590 432 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Rabgef1Q9JM13 Gm9005-201ENSMUST00000119908 607 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Rabgef1Q9JM13 Gm14070-201ENSMUST00000120773 428 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Rabgef1Q9JM13 Gm15164-201ENSMUST00000122203 271 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Rabgef1Q9JM13 Gm11341-201ENSMUST00000122316 447 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Rabgef1Q9JM13 Gm13715-201ENSMUST00000136578 411 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Rabgef1Q9JM13 Gm13029-201ENSMUST00000137283 594 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Rabgef1Q9JM13 Gm13166-203ENSMUST00000144166 326 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Rabgef1Q9JM13 Gm10177-201ENSMUST00000160052 444 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Rabgef1Q9JM13 Gm9613-201ENSMUST00000171662 196 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Rabgef1Q9JM13 Gm17060-201ENSMUST00000172394 824 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Rabgef1Q9JM13 Vmn1r-ps84-201ENSMUST00000172853 923 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Rabgef1Q9JM13 Gm18522-201ENSMUST00000173947 650 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Rabgef1Q9JM13 Gm26654-201ENSMUST00000180455 256 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Rabgef1Q9JM13 Sbp-206ENSMUST00000183155 882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Rabgef1Q9JM13 Gm27804-201ENSMUST00000185135 119 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Rabgef1Q9JM13 Gm28078-201ENSMUST00000190381 874 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Rabgef1Q9JM13 Gm37202-201ENSMUST00000193679 361 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Rabgef1Q9JM13 Gm42522-201ENSMUST00000196071 255 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Rabgef1Q9JM13 Gm18702-201ENSMUST00000196923 588 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Rabgef1Q9JM13 Gm43148-201ENSMUST00000198237 520 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Rabgef1Q9JM13 Gm43505-201ENSMUST00000200579 139 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Rabgef1Q9JM13 Usf2-ps1-201ENSMUST00000206657 311 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Rabgef1Q9JM13 Olfr1064-ps1-201ENSMUST00000213670 600 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
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