Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHD6

Snx27, Sorting nexin-27, mousemouse

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Length 539 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx27Q3UHD6 Nt5c3-202ENSMUST00000101367 1519 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Snx27Q3UHD6 Zfp442-201ENSMUST00000109916 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Snx27Q3UHD6 Igkv10-95-201ENSMUST00000103329 287 ntAPPRIS P1 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Snx27Q3UHD6 Vmn1r124-201ENSMUST00000105200 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Snx27Q3UHD6 Zfp972-202ENSMUST00000108934 561 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Snx27Q3UHD6 Gm14786-201ENSMUST00000117127 944 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Snx27Q3UHD6 Gm15019-201ENSMUST00000120148 434 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Snx27Q3UHD6 Gm7670-201ENSMUST00000121272 641 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Snx27Q3UHD6 Gm13363-201ENSMUST00000122008 522 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Snx27Q3UHD6 Gm25176-201ENSMUST00000122640 125 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Snx27Q3UHD6 4930405D11Rik-201ENSMUST00000132218 568 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Snx27Q3UHD6 Gm12256-201ENSMUST00000132394 446 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Snx27Q3UHD6 Gm13184-201ENSMUST00000149932 626 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Snx27Q3UHD6 Gm11507-201ENSMUST00000156462 412 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Snx27Q3UHD6 Gm3091-201ENSMUST00000163408 484 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Snx27Q3UHD6 Gm3486-201ENSMUST00000169361 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Snx27Q3UHD6 Gm4181-201ENSMUST00000170249 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Snx27Q3UHD6 Gm13147-202ENSMUST00000177526 1173 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Snx27Q3UHD6 Gm20619-205ENSMUST00000181633 581 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Snx27Q3UHD6 1700027A15Rik-201ENSMUST00000185768 321 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Snx27Q3UHD6 Scgb2b31-ps-201ENSMUST00000188734 328 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Snx27Q3UHD6 Gm28189-201ENSMUST00000190085 571 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Snx27Q3UHD6 Gm19280-201ENSMUST00000190191 205 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Snx27Q3UHD6 Scgb2b32-ps-201ENSMUST00000190326 337 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Snx27Q3UHD6 Gm38360-201ENSMUST00000195130 454 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Snx27Q3UHD6 Mir703-201ENSMUST00000197105 109 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Snx27Q3UHD6 Trav7d-5-201ENSMUST00000197128 340 ntAPPRIS P1 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Snx27Q3UHD6 Gm43712-201ENSMUST00000198020 291 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Snx27Q3UHD6 Gm42461-201ENSMUST00000198627 1150 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Snx27Q3UHD6 Trav7n-5-201ENSMUST00000199753 340 ntAPPRIS P1 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Snx27Q3UHD6 Gm31520-201ENSMUST00000203048 733 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Snx27Q3UHD6 Znrd1as-204ENSMUST00000209623 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Snx27Q3UHD6 Gm45689-201ENSMUST00000210522 133 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Snx27Q3UHD6 4933411E02Rik-201ENSMUST00000216779 1030 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Snx27Q3UHD6 CT030030.1-201ENSMUST00000218809 152 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Snx27Q3UHD6 AC155808.1-201ENSMUST00000219288 409 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Snx27Q3UHD6 AC153548.2-201ENSMUST00000219770 885 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Snx27Q3UHD6 AC124732.4-201ENSMUST00000220930 1274 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Snx27Q3UHD6 CT954323.2-201ENSMUST00000222056 213 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Snx27Q3UHD6 AC158392.1-201ENSMUST00000223720 1069 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Snx27Q3UHD6 AC154335.1-201ENSMUST00000224744 395 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Snx27Q3UHD6 Olfr801-201ENSMUST00000072063 957 ntAPPRIS P1 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Snx27Q3UHD6 Gm24207-201ENSMUST00000082781 108 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Snx27Q3UHD6 Gm39043-201ENSMUST00000207602 2081 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
Snx27Q3UHD6 Ktn1-225ENSMUST00000191446 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
Snx27Q3UHD6 Gm44424-201ENSMUST00000203438 1826 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
Snx27Q3UHD6 Zfp433-201ENSMUST00000085664 1800 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
Snx27Q3UHD6 Gm13712-201ENSMUST00000117484 2295 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
Snx27Q3UHD6 Vmn1r27-203ENSMUST00000228530 3115 ntAPPRIS P2 BASIC5.9□□□□□ -1.47
Snx27Q3UHD6 Gm20125-201ENSMUST00000185722 3201 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Snx27Q3UHD6 Hc-201ENSMUST00000028233 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Snx27Q3UHD6 Asap1-210ENSMUST00000176384 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Snx27Q3UHD6 Vmn1r203-202ENSMUST00000227520 8227 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Snx27Q3UHD6 Cdc27-201ENSMUST00000093923 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Snx27Q3UHD6 Stk3-205ENSMUST00000226555 2730 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Snx27Q3UHD6 Galnt1-208ENSMUST00000178605 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Snx27Q3UHD6 Gm14399-202ENSMUST00000108929 813 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Snx27Q3UHD6 Gm14403-202ENSMUST00000108947 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Snx27Q3UHD6 Gm14444-202ENSMUST00000109070 1281 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Snx27Q3UHD6 Gm14881-201ENSMUST00000120366 372 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Snx27Q3UHD6 Gm14229-201ENSMUST00000121178 850 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Snx27Q3UHD6 Llph-ps1-201ENSMUST00000121281 390 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Snx27Q3UHD6 1700016G14Rik-201ENSMUST00000136906 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Snx27Q3UHD6 Gm8941-201ENSMUST00000181451 899 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Snx27Q3UHD6 Stk-ps2-204ENSMUST00000187808 616 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Snx27Q3UHD6 Ighv1-19-1-201ENSMUST00000192823 351 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Snx27Q3UHD6 Ighv1-35-201ENSMUST00000195265 351 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Snx27Q3UHD6 Gm44456-201ENSMUST00000196554 89 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Snx27Q3UHD6 Mir409-201ENSMUST00000198153 79 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Snx27Q3UHD6 Gm44281-201ENSMUST00000203090 166 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Snx27Q3UHD6 Gm7825-201ENSMUST00000204046 416 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Snx27Q3UHD6 Fam24a-202ENSMUST00000207439 711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Snx27Q3UHD6 Gm6828-201ENSMUST00000207902 1186 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Snx27Q3UHD6 Olfr854-202ENSMUST00000212872 939 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Snx27Q3UHD6 Rpl29-ps2-203ENSMUST00000222043 1036 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Snx27Q3UHD6 AC132833.3-201ENSMUST00000227472 866 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Snx27Q3UHD6 CT025686.1-201ENSMUST00000227592 438 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Snx27Q3UHD6 Olfr488-201ENSMUST00000072968 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Snx27Q3UHD6 Olfr1261-201ENSMUST00000077785 921 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Snx27Q3UHD6 Gm22456-201ENSMUST00000082578 125 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Snx27Q3UHD6 Wfdc9-201ENSMUST00000099095 252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Snx27Q3UHD6 Gm42615-201ENSMUST00000197704 1820 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Snx27Q3UHD6 Olfr31-202ENSMUST00000206009 4017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Snx27Q3UHD6 Vmn1r34-202ENSMUST00000226262 2952 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Snx27Q3UHD6 Gm30292-201ENSMUST00000194198 3000 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Snx27Q3UHD6 Ascc3-206ENSMUST00000219226 1357 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Snx27Q3UHD6 Mrgprb1-201ENSMUST00000094384 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Snx27Q3UHD6 Gm13058-201ENSMUST00000117097 1435 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Snx27Q3UHD6 Slc44a1-205ENSMUST00000107651 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Snx27Q3UHD6 Iqch-203ENSMUST00000163624 3339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Snx27Q3UHD6 Gria4-204ENSMUST00000212533 5207 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Snx27Q3UHD6 Xpo7-202ENSMUST00000167242 15121 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Snx27Q3UHD6 Olfr1423-202ENSMUST00000214472 5570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Snx27Q3UHD6 Gm14326-204ENSMUST00000178829 1665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Snx27Q3UHD6 6430511E19Rik-201ENSMUST00000192772 3835 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Snx27Q3UHD6 Enox2-201ENSMUST00000033437 3170 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Snx27Q3UHD6 Zfp317-202ENSMUST00000208694 3988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Snx27Q3UHD6 Olfr765-202ENSMUST00000216460 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Snx27Q3UHD6 Hbp1-201ENSMUST00000167458 2733 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Snx27Q3UHD6 Usp25-201ENSMUST00000023580 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
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