Protein–RNA interactions for Protein: A0A0N4SWI3

D6Ertd527e, DNA segment, Chr 6, ERATO Doi 527,-expressed, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm2309-201ENSMUST00000149994 1941 ntTSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Btbd35f24-201ENSMUST00000178080 1941 ntAPPRIS P1 BASIC2.97□□□□□ -1.93
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dcun1d1-212ENSMUST00000198389 3020 ntTSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Kcnh7-201ENSMUST00000075052 13321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ankar-203ENSMUST00000212573 3952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Grik1-203ENSMUST00000114137 2894 ntTSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm37541-201ENSMUST00000192464 2315 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lingo2-203ENSMUST00000108122 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr655-203ENSMUST00000215538 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr655-204ENSMUST00000216750 2010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm43784-201ENSMUST00000202922 2436 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Postn-202ENSMUST00000081564 2670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.93
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Spag5-201ENSMUST00000045026 3887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.93
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm12633-201ENSMUST00000117742 1705 ntBASIC2.96□□□□□ -1.93
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nxf2-203ENSMUST00000113189 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 4930402H24Rik-203ENSMUST00000119422 3815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm18186-201ENSMUST00000192239 1580 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cnot1-202ENSMUST00000098473 8390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dst-215ENSMUST00000185269 16340 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm42559-201ENSMUST00000201811 3532 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lrrc4c-203ENSMUST00000162807 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm37606-201ENSMUST00000191816 3116 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ermn-201ENSMUST00000090940 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 P2ry12-203ENSMUST00000196583 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ctsm-202ENSMUST00000223778 1905 ntAPPRIS P1 BASIC2.96□□□□□ -1.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC162467.3-201ENSMUST00000219716 2172 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Angel2-201ENSMUST00000027947 3562 ntTSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm37916-201ENSMUST00000192153 2435 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr934-203ENSMUST00000216823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm24235-201ENSMUST00000104319 129 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm14304-201ENSMUST00000117272 446 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm12884-201ENSMUST00000120371 325 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm12007-201ENSMUST00000120978 597 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm12413-201ENSMUST00000121508 312 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm12807-201ENSMUST00000121546 962 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm16220-201ENSMUST00000131874 405 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 9030204H09Rik-201ENSMUST00000139455 653 ntTSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm26034-201ENSMUST00000158154 116 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rab26os-201ENSMUST00000176215 477 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Faiml-201ENSMUST00000178051 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cox6b2-209ENSMUST00000184143 435 ntTSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mir6933-201ENSMUST00000184982 81 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm28962-201ENSMUST00000187993 621 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 4930532M18Rik-202ENSMUST00000190980 534 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm37386-201ENSMUST00000194755 72 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm5842-201ENSMUST00000195073 622 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mir6516-201ENSMUST00000196236 110 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm44738-201ENSMUST00000206393 371 ntTSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm45236-201ENSMUST00000208632 229 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm34853-201ENSMUST00000211662 509 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr1077-ps1-201ENSMUST00000213225 1212 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm39363-201ENSMUST00000214251 723 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm46327-201ENSMUST00000218240 365 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm40392-201ENSMUST00000220656 562 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 9530050K03Rik-201ENSMUST00000221663 1299 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm40658-202ENSMUST00000221900 701 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 4930442G10Rik-202ENSMUST00000221968 1096 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm2645-201ENSMUST00000223516 547 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC154724.1-201ENSMUST00000225782 821 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC133910.1-201ENSMUST00000228128 624 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pglyrp3-201ENSMUST00000047660 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr738-201ENSMUST00000058972 936 ntAPPRIS P1 BASIC2.96□□□□□ -1.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Defb35-201ENSMUST00000076786 267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm23927-201ENSMUST00000082466 215 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Snord59a-201ENSMUST00000082844 74 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm5458-201ENSMUST00000096121 997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Kncn-201ENSMUST00000097918 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr1087-201ENSMUST00000099877 942 ntAPPRIS P1 BASIC2.96□□□□□ -1.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm37051-201ENSMUST00000194535 2943 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ranbp3l-201ENSMUST00000053308 3017 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Itih4-203ENSMUST00000120269 3531 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Serpinb3b-202ENSMUST00000166100 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm9577-201ENSMUST00000174655 2620 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr57-202ENSMUST00000203906 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm30849-201ENSMUST00000214503 1379 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 9230109A22Rik-202ENSMUST00000228644 1853 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm16041-201ENSMUST00000144339 3725 ntTSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Glb1l3-201ENSMUST00000034448 2468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm43567-201ENSMUST00000197581 1978 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Abca12-201ENSMUST00000087268 9137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm42615-201ENSMUST00000197704 1820 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Satl1-201ENSMUST00000026601 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hmmr-201ENSMUST00000020579 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lrrc4c-202ENSMUST00000135431 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr1443-203ENSMUST00000215134 3995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm38253-201ENSMUST00000194058 4678 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cnot4-203ENSMUST00000114993 3473 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr351-203ENSMUST00000215137 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Samd3-202ENSMUST00000164660 2620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Samd3-203ENSMUST00000218301 2620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Clk4-202ENSMUST00000109111 1427 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr1312-203ENSMUST00000213961 5345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zfp763-201ENSMUST00000087654 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Postn-201ENSMUST00000073012 3189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nipal1-201ENSMUST00000087212 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr465-ps1-201ENSMUST00000206324 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zfp329-202ENSMUST00000108546 2577 ntTSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ptgs2os-202ENSMUST00000181915 2937 ntTSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm18163-201ENSMUST00000197877 1643 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Traj50-201ENSMUST00000103693 63 ntAPPRIS P1 BASIC2.95□□□□□ -1.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.7 ms