Protein–RNA interactions for Protein: V9GX34

Csmd2, CUB and Sushi multiple domains 2, mousemouse

Predictions only

Length 3,611 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csmd2V9GX34 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Csmd2V9GX34 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Csmd2V9GX34 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Csmd2V9GX34 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Csmd2V9GX34 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Csmd2V9GX34 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Csmd2V9GX34 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Csmd2V9GX34 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Csmd2V9GX34 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Csmd2V9GX34 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Csmd2V9GX34 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Csmd2V9GX34 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Csmd2V9GX34 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Csmd2V9GX34 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Csmd2V9GX34 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Csmd2V9GX34 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Csmd2V9GX34 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Csmd2V9GX34 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Csmd2V9GX34 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Csmd2V9GX34 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Csmd2V9GX34 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Csmd2V9GX34 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Csmd2V9GX34 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Csmd2V9GX34 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Csmd2V9GX34 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Csmd2V9GX34 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Csmd2V9GX34 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Csmd2V9GX34 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Csmd2V9GX34 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Csmd2V9GX34 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Csmd2V9GX34 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Csmd2V9GX34 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Csmd2V9GX34 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Csmd2V9GX34 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Csmd2V9GX34 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Csmd2V9GX34 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Csmd2V9GX34 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Csmd2V9GX34 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Csmd2V9GX34 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
Csmd2V9GX34 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Csmd2V9GX34 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Csmd2V9GX34 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Csmd2V9GX34 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Csmd2V9GX34 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Csmd2V9GX34 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Csmd2V9GX34 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Csmd2V9GX34 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Csmd2V9GX34 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Csmd2V9GX34 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Csmd2V9GX34 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Csmd2V9GX34 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Csmd2V9GX34 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Csmd2V9GX34 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Csmd2V9GX34 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Csmd2V9GX34 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Csmd2V9GX34 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Csmd2V9GX34 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Csmd2V9GX34 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Csmd2V9GX34 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Csmd2V9GX34 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Csmd2V9GX34 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Csmd2V9GX34 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Csmd2V9GX34 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Csmd2V9GX34 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Csmd2V9GX34 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Csmd2V9GX34 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Csmd2V9GX34 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Csmd2V9GX34 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Csmd2V9GX34 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Csmd2V9GX34 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Csmd2V9GX34 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Csmd2V9GX34 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Csmd2V9GX34 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Csmd2V9GX34 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Csmd2V9GX34 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Csmd2V9GX34 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Csmd2V9GX34 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Csmd2V9GX34 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Csmd2V9GX34 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Csmd2V9GX34 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Csmd2V9GX34 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Csmd2V9GX34 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Csmd2V9GX34 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Csmd2V9GX34 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Csmd2V9GX34 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Csmd2V9GX34 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Csmd2V9GX34 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Csmd2V9GX34 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Csmd2V9GX34 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Csmd2V9GX34 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Csmd2V9GX34 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Csmd2V9GX34 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Csmd2V9GX34 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Csmd2V9GX34 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Csmd2V9GX34 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Csmd2V9GX34 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Csmd2V9GX34 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Csmd2V9GX34 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Csmd2V9GX34 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Csmd2V9GX34 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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