Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2Y3

Homer1, Homer protein homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Homer1Q9Z2Y3 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Homer1Q9Z2Y3 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Homer1Q9Z2Y3 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Homer1Q9Z2Y3 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Homer1Q9Z2Y3 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Homer1Q9Z2Y3 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Homer1Q9Z2Y3 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Homer1Q9Z2Y3 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Homer1Q9Z2Y3 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Homer1Q9Z2Y3 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Homer1Q9Z2Y3 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Homer1Q9Z2Y3 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Homer1Q9Z2Y3 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Homer1Q9Z2Y3 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Homer1Q9Z2Y3 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Homer1Q9Z2Y3 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Homer1Q9Z2Y3 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Homer1Q9Z2Y3 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Homer1Q9Z2Y3 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Homer1Q9Z2Y3 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Homer1Q9Z2Y3 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Homer1Q9Z2Y3 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Homer1Q9Z2Y3 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Homer1Q9Z2Y3 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Homer1Q9Z2Y3 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Homer1Q9Z2Y3 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Homer1Q9Z2Y3 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Homer1Q9Z2Y3 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Homer1Q9Z2Y3 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Homer1Q9Z2Y3 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Homer1Q9Z2Y3 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Homer1Q9Z2Y3 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Homer1Q9Z2Y3 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Homer1Q9Z2Y3 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Homer1Q9Z2Y3 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Homer1Q9Z2Y3 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Homer1Q9Z2Y3 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Homer1Q9Z2Y3 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Homer1Q9Z2Y3 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Homer1Q9Z2Y3 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Homer1Q9Z2Y3 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Homer1Q9Z2Y3 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Homer1Q9Z2Y3 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Homer1Q9Z2Y3 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Homer1Q9Z2Y3 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Homer1Q9Z2Y3 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Homer1Q9Z2Y3 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Homer1Q9Z2Y3 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Homer1Q9Z2Y3 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Homer1Q9Z2Y3 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Homer1Q9Z2Y3 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Homer1Q9Z2Y3 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Homer1Q9Z2Y3 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Homer1Q9Z2Y3 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Homer1Q9Z2Y3 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Homer1Q9Z2Y3 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Homer1Q9Z2Y3 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Homer1Q9Z2Y3 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Homer1Q9Z2Y3 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Homer1Q9Z2Y3 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Homer1Q9Z2Y3 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Homer1Q9Z2Y3 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Homer1Q9Z2Y3 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Homer1Q9Z2Y3 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Homer1Q9Z2Y3 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Homer1Q9Z2Y3 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Homer1Q9Z2Y3 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Homer1Q9Z2Y3 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Homer1Q9Z2Y3 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Homer1Q9Z2Y3 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Homer1Q9Z2Y3 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Homer1Q9Z2Y3 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Homer1Q9Z2Y3 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Homer1Q9Z2Y3 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Homer1Q9Z2Y3 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Homer1Q9Z2Y3 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Homer1Q9Z2Y3 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Homer1Q9Z2Y3 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Homer1Q9Z2Y3 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Homer1Q9Z2Y3 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Homer1Q9Z2Y3 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Homer1Q9Z2Y3 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Homer1Q9Z2Y3 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Homer1Q9Z2Y3 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Homer1Q9Z2Y3 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Homer1Q9Z2Y3 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Homer1Q9Z2Y3 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Homer1Q9Z2Y3 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Homer1Q9Z2Y3 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Homer1Q9Z2Y3 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Homer1Q9Z2Y3 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Homer1Q9Z2Y3 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Homer1Q9Z2Y3 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Homer1Q9Z2Y3 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Homer1Q9Z2Y3 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Homer1Q9Z2Y3 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Homer1Q9Z2Y3 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Homer1Q9Z2Y3 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Homer1Q9Z2Y3 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Homer1Q9Z2Y3 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms