Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2K1

Krt16, Keratin, type I cytoskeletal 16, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt16Q9Z2K1 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Krt16Q9Z2K1 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Krt16Q9Z2K1 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Krt16Q9Z2K1 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Krt16Q9Z2K1 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Krt16Q9Z2K1 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Krt16Q9Z2K1 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Krt16Q9Z2K1 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Krt16Q9Z2K1 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Krt16Q9Z2K1 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Krt16Q9Z2K1 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Krt16Q9Z2K1 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Krt16Q9Z2K1 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Krt16Q9Z2K1 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Krt16Q9Z2K1 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Krt16Q9Z2K1 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Krt16Q9Z2K1 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Krt16Q9Z2K1 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Krt16Q9Z2K1 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Krt16Q9Z2K1 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Krt16Q9Z2K1 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Krt16Q9Z2K1 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Krt16Q9Z2K1 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Krt16Q9Z2K1 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Krt16Q9Z2K1 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Krt16Q9Z2K1 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Krt16Q9Z2K1 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Krt16Q9Z2K1 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Krt16Q9Z2K1 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Krt16Q9Z2K1 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Krt16Q9Z2K1 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Krt16Q9Z2K1 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Krt16Q9Z2K1 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Krt16Q9Z2K1 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Krt16Q9Z2K1 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Krt16Q9Z2K1 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Krt16Q9Z2K1 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Krt16Q9Z2K1 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Krt16Q9Z2K1 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Krt16Q9Z2K1 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Krt16Q9Z2K1 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Krt16Q9Z2K1 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Krt16Q9Z2K1 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Krt16Q9Z2K1 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Krt16Q9Z2K1 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Krt16Q9Z2K1 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Krt16Q9Z2K1 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Krt16Q9Z2K1 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Krt16Q9Z2K1 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Krt16Q9Z2K1 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Krt16Q9Z2K1 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Krt16Q9Z2K1 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Krt16Q9Z2K1 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Krt16Q9Z2K1 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Krt16Q9Z2K1 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Krt16Q9Z2K1 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Krt16Q9Z2K1 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Krt16Q9Z2K1 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Krt16Q9Z2K1 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Krt16Q9Z2K1 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Krt16Q9Z2K1 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Krt16Q9Z2K1 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Krt16Q9Z2K1 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Krt16Q9Z2K1 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Krt16Q9Z2K1 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Krt16Q9Z2K1 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Krt16Q9Z2K1 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Krt16Q9Z2K1 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Krt16Q9Z2K1 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Krt16Q9Z2K1 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Krt16Q9Z2K1 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Krt16Q9Z2K1 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Krt16Q9Z2K1 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Krt16Q9Z2K1 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Krt16Q9Z2K1 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Krt16Q9Z2K1 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Krt16Q9Z2K1 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Krt16Q9Z2K1 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Krt16Q9Z2K1 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Krt16Q9Z2K1 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Krt16Q9Z2K1 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Krt16Q9Z2K1 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Krt16Q9Z2K1 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Krt16Q9Z2K1 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Krt16Q9Z2K1 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Krt16Q9Z2K1 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Krt16Q9Z2K1 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Krt16Q9Z2K1 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Krt16Q9Z2K1 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Krt16Q9Z2K1 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Krt16Q9Z2K1 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Krt16Q9Z2K1 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Krt16Q9Z2K1 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Krt16Q9Z2K1 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Krt16Q9Z2K1 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Krt16Q9Z2K1 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Krt16Q9Z2K1 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Krt16Q9Z2K1 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Krt16Q9Z2K1 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Krt16Q9Z2K1 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms