Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2D6

Mecp2, Methyl-CpG-binding protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 484 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mecp2Q9Z2D6 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Mecp2Q9Z2D6 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mecp2Q9Z2D6 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mecp2Q9Z2D6 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mecp2Q9Z2D6 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mecp2Q9Z2D6 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mecp2Q9Z2D6 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mecp2Q9Z2D6 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Mecp2Q9Z2D6 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mecp2Q9Z2D6 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Mecp2Q9Z2D6 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mecp2Q9Z2D6 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mecp2Q9Z2D6 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mecp2Q9Z2D6 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mecp2Q9Z2D6 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mecp2Q9Z2D6 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mecp2Q9Z2D6 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mecp2Q9Z2D6 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mecp2Q9Z2D6 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mecp2Q9Z2D6 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mecp2Q9Z2D6 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Mecp2Q9Z2D6 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Mecp2Q9Z2D6 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mecp2Q9Z2D6 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mecp2Q9Z2D6 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mecp2Q9Z2D6 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mecp2Q9Z2D6 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mecp2Q9Z2D6 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mecp2Q9Z2D6 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mecp2Q9Z2D6 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mecp2Q9Z2D6 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mecp2Q9Z2D6 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mecp2Q9Z2D6 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mecp2Q9Z2D6 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Mecp2Q9Z2D6 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mecp2Q9Z2D6 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mecp2Q9Z2D6 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mecp2Q9Z2D6 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mecp2Q9Z2D6 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Mecp2Q9Z2D6 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Mecp2Q9Z2D6 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mecp2Q9Z2D6 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mecp2Q9Z2D6 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mecp2Q9Z2D6 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mecp2Q9Z2D6 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mecp2Q9Z2D6 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mecp2Q9Z2D6 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mecp2Q9Z2D6 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mecp2Q9Z2D6 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mecp2Q9Z2D6 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mecp2Q9Z2D6 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mecp2Q9Z2D6 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mecp2Q9Z2D6 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mecp2Q9Z2D6 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mecp2Q9Z2D6 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mecp2Q9Z2D6 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mecp2Q9Z2D6 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mecp2Q9Z2D6 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mecp2Q9Z2D6 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mecp2Q9Z2D6 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mecp2Q9Z2D6 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mecp2Q9Z2D6 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mecp2Q9Z2D6 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mecp2Q9Z2D6 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mecp2Q9Z2D6 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mecp2Q9Z2D6 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mecp2Q9Z2D6 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Mecp2Q9Z2D6 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mecp2Q9Z2D6 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mecp2Q9Z2D6 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mecp2Q9Z2D6 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mecp2Q9Z2D6 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mecp2Q9Z2D6 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mecp2Q9Z2D6 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mecp2Q9Z2D6 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mecp2Q9Z2D6 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mecp2Q9Z2D6 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Mecp2Q9Z2D6 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mecp2Q9Z2D6 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mecp2Q9Z2D6 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mecp2Q9Z2D6 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mecp2Q9Z2D6 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Mecp2Q9Z2D6 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mecp2Q9Z2D6 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mecp2Q9Z2D6 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mecp2Q9Z2D6 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mecp2Q9Z2D6 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mecp2Q9Z2D6 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mecp2Q9Z2D6 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mecp2Q9Z2D6 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mecp2Q9Z2D6 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mecp2Q9Z2D6 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mecp2Q9Z2D6 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mecp2Q9Z2D6 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mecp2Q9Z2D6 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mecp2Q9Z2D6 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mecp2Q9Z2D6 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mecp2Q9Z2D6 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mecp2Q9Z2D6 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mecp2Q9Z2D6 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms