Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1T1

Ap3b1, AP-3 complex subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap3b1Q9Z1T1 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ap3b1Q9Z1T1 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ap3b1Q9Z1T1 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ap3b1Q9Z1T1 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ap3b1Q9Z1T1 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Ap3b1Q9Z1T1 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Ap3b1Q9Z1T1 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Ap3b1Q9Z1T1 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Ap3b1Q9Z1T1 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Ap3b1Q9Z1T1 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Ap3b1Q9Z1T1 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Ap3b1Q9Z1T1 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
Ap3b1Q9Z1T1 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Ap3b1Q9Z1T1 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Ap3b1Q9Z1T1 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Ap3b1Q9Z1T1 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Ap3b1Q9Z1T1 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ap3b1Q9Z1T1 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ap3b1Q9Z1T1 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ap3b1Q9Z1T1 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ap3b1Q9Z1T1 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ap3b1Q9Z1T1 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ap3b1Q9Z1T1 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ap3b1Q9Z1T1 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ap3b1Q9Z1T1 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ap3b1Q9Z1T1 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ap3b1Q9Z1T1 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ap3b1Q9Z1T1 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ap3b1Q9Z1T1 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ap3b1Q9Z1T1 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ap3b1Q9Z1T1 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ap3b1Q9Z1T1 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ap3b1Q9Z1T1 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ap3b1Q9Z1T1 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ap3b1Q9Z1T1 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ap3b1Q9Z1T1 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ap3b1Q9Z1T1 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ap3b1Q9Z1T1 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ap3b1Q9Z1T1 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ap3b1Q9Z1T1 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ap3b1Q9Z1T1 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ap3b1Q9Z1T1 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Ap3b1Q9Z1T1 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Ap3b1Q9Z1T1 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Ap3b1Q9Z1T1 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Ap3b1Q9Z1T1 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Ap3b1Q9Z1T1 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Ap3b1Q9Z1T1 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Ap3b1Q9Z1T1 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Ap3b1Q9Z1T1 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Ap3b1Q9Z1T1 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Ap3b1Q9Z1T1 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Ap3b1Q9Z1T1 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Ap3b1Q9Z1T1 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Ap3b1Q9Z1T1 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Ap3b1Q9Z1T1 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC27.39■■□□□ 1.97
Ap3b1Q9Z1T1 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ap3b1Q9Z1T1 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ap3b1Q9Z1T1 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
Ap3b1Q9Z1T1 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ap3b1Q9Z1T1 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ap3b1Q9Z1T1 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ap3b1Q9Z1T1 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ap3b1Q9Z1T1 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ap3b1Q9Z1T1 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
Ap3b1Q9Z1T1 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
Ap3b1Q9Z1T1 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ap3b1Q9Z1T1 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
Ap3b1Q9Z1T1 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ap3b1Q9Z1T1 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ap3b1Q9Z1T1 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ap3b1Q9Z1T1 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ap3b1Q9Z1T1 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ap3b1Q9Z1T1 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ap3b1Q9Z1T1 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ap3b1Q9Z1T1 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ap3b1Q9Z1T1 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ap3b1Q9Z1T1 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ap3b1Q9Z1T1 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Ap3b1Q9Z1T1 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
Ap3b1Q9Z1T1 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Ap3b1Q9Z1T1 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Ap3b1Q9Z1T1 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Ap3b1Q9Z1T1 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Ap3b1Q9Z1T1 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ap3b1Q9Z1T1 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ap3b1Q9Z1T1 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ap3b1Q9Z1T1 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ap3b1Q9Z1T1 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ap3b1Q9Z1T1 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ap3b1Q9Z1T1 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ap3b1Q9Z1T1 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ap3b1Q9Z1T1 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
Ap3b1Q9Z1T1 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ap3b1Q9Z1T1 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ap3b1Q9Z1T1 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ap3b1Q9Z1T1 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ap3b1Q9Z1T1 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ap3b1Q9Z1T1 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ap3b1Q9Z1T1 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms