Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1B8

Phf1, PHD finger protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf1Q9Z1B8 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Phf1Q9Z1B8 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Phf1Q9Z1B8 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Phf1Q9Z1B8 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Phf1Q9Z1B8 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Phf1Q9Z1B8 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Phf1Q9Z1B8 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Phf1Q9Z1B8 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Phf1Q9Z1B8 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Phf1Q9Z1B8 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Phf1Q9Z1B8 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Phf1Q9Z1B8 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Phf1Q9Z1B8 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Phf1Q9Z1B8 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Phf1Q9Z1B8 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Phf1Q9Z1B8 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Phf1Q9Z1B8 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Phf1Q9Z1B8 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Phf1Q9Z1B8 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Phf1Q9Z1B8 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Phf1Q9Z1B8 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Phf1Q9Z1B8 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Phf1Q9Z1B8 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Phf1Q9Z1B8 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Phf1Q9Z1B8 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Phf1Q9Z1B8 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Phf1Q9Z1B8 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Phf1Q9Z1B8 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Phf1Q9Z1B8 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Phf1Q9Z1B8 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Phf1Q9Z1B8 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Phf1Q9Z1B8 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Phf1Q9Z1B8 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Phf1Q9Z1B8 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Phf1Q9Z1B8 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Phf1Q9Z1B8 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Phf1Q9Z1B8 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Phf1Q9Z1B8 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Phf1Q9Z1B8 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Phf1Q9Z1B8 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Phf1Q9Z1B8 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Phf1Q9Z1B8 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Phf1Q9Z1B8 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Phf1Q9Z1B8 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Phf1Q9Z1B8 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Phf1Q9Z1B8 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Phf1Q9Z1B8 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Phf1Q9Z1B8 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Phf1Q9Z1B8 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Phf1Q9Z1B8 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Phf1Q9Z1B8 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Phf1Q9Z1B8 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Phf1Q9Z1B8 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Phf1Q9Z1B8 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Phf1Q9Z1B8 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Phf1Q9Z1B8 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Phf1Q9Z1B8 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Phf1Q9Z1B8 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Phf1Q9Z1B8 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Phf1Q9Z1B8 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Phf1Q9Z1B8 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Phf1Q9Z1B8 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Phf1Q9Z1B8 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Phf1Q9Z1B8 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Phf1Q9Z1B8 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Phf1Q9Z1B8 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Phf1Q9Z1B8 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Phf1Q9Z1B8 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Phf1Q9Z1B8 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Phf1Q9Z1B8 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Phf1Q9Z1B8 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Phf1Q9Z1B8 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Phf1Q9Z1B8 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Phf1Q9Z1B8 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Phf1Q9Z1B8 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Phf1Q9Z1B8 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Phf1Q9Z1B8 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Phf1Q9Z1B8 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Phf1Q9Z1B8 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Phf1Q9Z1B8 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Phf1Q9Z1B8 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Phf1Q9Z1B8 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Phf1Q9Z1B8 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Phf1Q9Z1B8 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Phf1Q9Z1B8 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Phf1Q9Z1B8 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Phf1Q9Z1B8 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Phf1Q9Z1B8 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Phf1Q9Z1B8 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Phf1Q9Z1B8 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Phf1Q9Z1B8 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Phf1Q9Z1B8 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Phf1Q9Z1B8 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Phf1Q9Z1B8 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Phf1Q9Z1B8 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Phf1Q9Z1B8 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Phf1Q9Z1B8 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Phf1Q9Z1B8 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Phf1Q9Z1B8 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Phf1Q9Z1B8 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms