Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0U0

Xpr1, Xenotropic and polytropic retrovirus receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 695 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xpr1Q9Z0U0 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Xpr1Q9Z0U0 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Xpr1Q9Z0U0 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Xpr1Q9Z0U0 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Xpr1Q9Z0U0 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Xpr1Q9Z0U0 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Xpr1Q9Z0U0 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Xpr1Q9Z0U0 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Xpr1Q9Z0U0 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Xpr1Q9Z0U0 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Xpr1Q9Z0U0 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Xpr1Q9Z0U0 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Xpr1Q9Z0U0 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Xpr1Q9Z0U0 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Xpr1Q9Z0U0 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Xpr1Q9Z0U0 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Xpr1Q9Z0U0 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Xpr1Q9Z0U0 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Xpr1Q9Z0U0 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Xpr1Q9Z0U0 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Xpr1Q9Z0U0 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Xpr1Q9Z0U0 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Xpr1Q9Z0U0 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Xpr1Q9Z0U0 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Xpr1Q9Z0U0 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Xpr1Q9Z0U0 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Xpr1Q9Z0U0 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Xpr1Q9Z0U0 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Xpr1Q9Z0U0 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Xpr1Q9Z0U0 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Xpr1Q9Z0U0 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Xpr1Q9Z0U0 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Xpr1Q9Z0U0 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Xpr1Q9Z0U0 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Xpr1Q9Z0U0 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Xpr1Q9Z0U0 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Xpr1Q9Z0U0 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Xpr1Q9Z0U0 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Xpr1Q9Z0U0 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Xpr1Q9Z0U0 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Xpr1Q9Z0U0 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Xpr1Q9Z0U0 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Xpr1Q9Z0U0 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Xpr1Q9Z0U0 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Xpr1Q9Z0U0 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Xpr1Q9Z0U0 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Xpr1Q9Z0U0 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Xpr1Q9Z0U0 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Xpr1Q9Z0U0 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Xpr1Q9Z0U0 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Xpr1Q9Z0U0 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Xpr1Q9Z0U0 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Xpr1Q9Z0U0 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Xpr1Q9Z0U0 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Xpr1Q9Z0U0 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Xpr1Q9Z0U0 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Xpr1Q9Z0U0 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Xpr1Q9Z0U0 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Xpr1Q9Z0U0 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Xpr1Q9Z0U0 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Xpr1Q9Z0U0 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Xpr1Q9Z0U0 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Xpr1Q9Z0U0 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Xpr1Q9Z0U0 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Xpr1Q9Z0U0 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Xpr1Q9Z0U0 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Xpr1Q9Z0U0 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Xpr1Q9Z0U0 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Xpr1Q9Z0U0 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Xpr1Q9Z0U0 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Xpr1Q9Z0U0 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Xpr1Q9Z0U0 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Xpr1Q9Z0U0 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Xpr1Q9Z0U0 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Xpr1Q9Z0U0 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Xpr1Q9Z0U0 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Xpr1Q9Z0U0 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Xpr1Q9Z0U0 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Xpr1Q9Z0U0 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Xpr1Q9Z0U0 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Xpr1Q9Z0U0 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Xpr1Q9Z0U0 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Xpr1Q9Z0U0 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Xpr1Q9Z0U0 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Xpr1Q9Z0U0 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Xpr1Q9Z0U0 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Xpr1Q9Z0U0 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Xpr1Q9Z0U0 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Xpr1Q9Z0U0 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Xpr1Q9Z0U0 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Xpr1Q9Z0U0 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Xpr1Q9Z0U0 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Xpr1Q9Z0U0 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Xpr1Q9Z0U0 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Xpr1Q9Z0U0 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Xpr1Q9Z0U0 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Xpr1Q9Z0U0 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Xpr1Q9Z0U0 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Xpr1Q9Z0U0 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Xpr1Q9Z0U0 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms