Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0E6

Gbp2, Guanylate-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 589 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp2Q9Z0E6 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gbp2Q9Z0E6 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gbp2Q9Z0E6 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gbp2Q9Z0E6 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gbp2Q9Z0E6 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Gbp2Q9Z0E6 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gbp2Q9Z0E6 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gbp2Q9Z0E6 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gbp2Q9Z0E6 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gbp2Q9Z0E6 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Gbp2Q9Z0E6 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gbp2Q9Z0E6 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gbp2Q9Z0E6 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gbp2Q9Z0E6 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gbp2Q9Z0E6 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Gbp2Q9Z0E6 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gbp2Q9Z0E6 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gbp2Q9Z0E6 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gbp2Q9Z0E6 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gbp2Q9Z0E6 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gbp2Q9Z0E6 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gbp2Q9Z0E6 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gbp2Q9Z0E6 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gbp2Q9Z0E6 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gbp2Q9Z0E6 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gbp2Q9Z0E6 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gbp2Q9Z0E6 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gbp2Q9Z0E6 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gbp2Q9Z0E6 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gbp2Q9Z0E6 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gbp2Q9Z0E6 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gbp2Q9Z0E6 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gbp2Q9Z0E6 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gbp2Q9Z0E6 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gbp2Q9Z0E6 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gbp2Q9Z0E6 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gbp2Q9Z0E6 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gbp2Q9Z0E6 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gbp2Q9Z0E6 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gbp2Q9Z0E6 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gbp2Q9Z0E6 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gbp2Q9Z0E6 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Gbp2Q9Z0E6 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Gbp2Q9Z0E6 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gbp2Q9Z0E6 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gbp2Q9Z0E6 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gbp2Q9Z0E6 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gbp2Q9Z0E6 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gbp2Q9Z0E6 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gbp2Q9Z0E6 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gbp2Q9Z0E6 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gbp2Q9Z0E6 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gbp2Q9Z0E6 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Gbp2Q9Z0E6 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gbp2Q9Z0E6 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gbp2Q9Z0E6 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gbp2Q9Z0E6 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gbp2Q9Z0E6 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gbp2Q9Z0E6 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gbp2Q9Z0E6 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gbp2Q9Z0E6 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Gbp2Q9Z0E6 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gbp2Q9Z0E6 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gbp2Q9Z0E6 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gbp2Q9Z0E6 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gbp2Q9Z0E6 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gbp2Q9Z0E6 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gbp2Q9Z0E6 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gbp2Q9Z0E6 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gbp2Q9Z0E6 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gbp2Q9Z0E6 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gbp2Q9Z0E6 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gbp2Q9Z0E6 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gbp2Q9Z0E6 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gbp2Q9Z0E6 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gbp2Q9Z0E6 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gbp2Q9Z0E6 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gbp2Q9Z0E6 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gbp2Q9Z0E6 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gbp2Q9Z0E6 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gbp2Q9Z0E6 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gbp2Q9Z0E6 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gbp2Q9Z0E6 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gbp2Q9Z0E6 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gbp2Q9Z0E6 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gbp2Q9Z0E6 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gbp2Q9Z0E6 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gbp2Q9Z0E6 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gbp2Q9Z0E6 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gbp2Q9Z0E6 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gbp2Q9Z0E6 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gbp2Q9Z0E6 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gbp2Q9Z0E6 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gbp2Q9Z0E6 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gbp2Q9Z0E6 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gbp2Q9Z0E6 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gbp2Q9Z0E6 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gbp2Q9Z0E6 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gbp2Q9Z0E6 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gbp2Q9Z0E6 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms