Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU60

Atrn, Attractin, mousemouse

Predictions only

Length 1,428 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AtrnQ9WU60 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
AtrnQ9WU60 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
AtrnQ9WU60 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
AtrnQ9WU60 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
AtrnQ9WU60 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
AtrnQ9WU60 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
AtrnQ9WU60 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
AtrnQ9WU60 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
AtrnQ9WU60 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
AtrnQ9WU60 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
AtrnQ9WU60 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
AtrnQ9WU60 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
AtrnQ9WU60 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
AtrnQ9WU60 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
AtrnQ9WU60 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
AtrnQ9WU60 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
AtrnQ9WU60 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
AtrnQ9WU60 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
AtrnQ9WU60 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
AtrnQ9WU60 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
AtrnQ9WU60 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
AtrnQ9WU60 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
AtrnQ9WU60 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
AtrnQ9WU60 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
AtrnQ9WU60 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
AtrnQ9WU60 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
AtrnQ9WU60 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
AtrnQ9WU60 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
AtrnQ9WU60 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
AtrnQ9WU60 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
AtrnQ9WU60 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
AtrnQ9WU60 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
AtrnQ9WU60 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
AtrnQ9WU60 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
AtrnQ9WU60 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
AtrnQ9WU60 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
AtrnQ9WU60 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
AtrnQ9WU60 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
AtrnQ9WU60 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
AtrnQ9WU60 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
AtrnQ9WU60 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
AtrnQ9WU60 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
AtrnQ9WU60 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
AtrnQ9WU60 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
AtrnQ9WU60 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
AtrnQ9WU60 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
AtrnQ9WU60 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
AtrnQ9WU60 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
AtrnQ9WU60 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
AtrnQ9WU60 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
AtrnQ9WU60 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
AtrnQ9WU60 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
AtrnQ9WU60 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
AtrnQ9WU60 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
AtrnQ9WU60 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
AtrnQ9WU60 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
AtrnQ9WU60 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
AtrnQ9WU60 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
AtrnQ9WU60 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
AtrnQ9WU60 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
AtrnQ9WU60 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
AtrnQ9WU60 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
AtrnQ9WU60 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
AtrnQ9WU60 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
AtrnQ9WU60 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
AtrnQ9WU60 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
AtrnQ9WU60 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
AtrnQ9WU60 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
AtrnQ9WU60 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
AtrnQ9WU60 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
AtrnQ9WU60 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
AtrnQ9WU60 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
AtrnQ9WU60 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
AtrnQ9WU60 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
AtrnQ9WU60 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
AtrnQ9WU60 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
AtrnQ9WU60 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
AtrnQ9WU60 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
AtrnQ9WU60 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
AtrnQ9WU60 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
AtrnQ9WU60 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
AtrnQ9WU60 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
AtrnQ9WU60 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
AtrnQ9WU60 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
AtrnQ9WU60 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
AtrnQ9WU60 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
AtrnQ9WU60 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
AtrnQ9WU60 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
AtrnQ9WU60 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
AtrnQ9WU60 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
AtrnQ9WU60 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
AtrnQ9WU60 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
AtrnQ9WU60 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
AtrnQ9WU60 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
AtrnQ9WU60 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
AtrnQ9WU60 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
AtrnQ9WU60 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
AtrnQ9WU60 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
AtrnQ9WU60 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
AtrnQ9WU60 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms