Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTX5

Skp1, S-phase kinase-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 163 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skp1Q9WTX5 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Skp1Q9WTX5 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Skp1Q9WTX5 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Skp1Q9WTX5 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Skp1Q9WTX5 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Skp1Q9WTX5 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Skp1Q9WTX5 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Skp1Q9WTX5 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Skp1Q9WTX5 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Skp1Q9WTX5 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Skp1Q9WTX5 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Skp1Q9WTX5 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Skp1Q9WTX5 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Skp1Q9WTX5 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Skp1Q9WTX5 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Skp1Q9WTX5 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Skp1Q9WTX5 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Skp1Q9WTX5 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Skp1Q9WTX5 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Skp1Q9WTX5 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Skp1Q9WTX5 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Skp1Q9WTX5 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Skp1Q9WTX5 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Skp1Q9WTX5 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Skp1Q9WTX5 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Skp1Q9WTX5 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Skp1Q9WTX5 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Skp1Q9WTX5 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Skp1Q9WTX5 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Skp1Q9WTX5 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Skp1Q9WTX5 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Skp1Q9WTX5 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Skp1Q9WTX5 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Skp1Q9WTX5 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Skp1Q9WTX5 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Skp1Q9WTX5 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Skp1Q9WTX5 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Skp1Q9WTX5 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Skp1Q9WTX5 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Skp1Q9WTX5 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Skp1Q9WTX5 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Skp1Q9WTX5 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Skp1Q9WTX5 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Skp1Q9WTX5 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Skp1Q9WTX5 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Skp1Q9WTX5 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Skp1Q9WTX5 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Skp1Q9WTX5 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Skp1Q9WTX5 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Skp1Q9WTX5 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Skp1Q9WTX5 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Skp1Q9WTX5 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Skp1Q9WTX5 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Skp1Q9WTX5 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Skp1Q9WTX5 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Skp1Q9WTX5 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Skp1Q9WTX5 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Skp1Q9WTX5 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Skp1Q9WTX5 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Skp1Q9WTX5 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Skp1Q9WTX5 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Skp1Q9WTX5 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Skp1Q9WTX5 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Skp1Q9WTX5 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Skp1Q9WTX5 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Skp1Q9WTX5 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Skp1Q9WTX5 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Skp1Q9WTX5 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Skp1Q9WTX5 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Skp1Q9WTX5 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Skp1Q9WTX5 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Skp1Q9WTX5 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Skp1Q9WTX5 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Skp1Q9WTX5 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Skp1Q9WTX5 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Skp1Q9WTX5 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Skp1Q9WTX5 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Skp1Q9WTX5 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Skp1Q9WTX5 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Skp1Q9WTX5 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Skp1Q9WTX5 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Skp1Q9WTX5 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Skp1Q9WTX5 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Skp1Q9WTX5 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Skp1Q9WTX5 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Skp1Q9WTX5 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Skp1Q9WTX5 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Skp1Q9WTX5 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Skp1Q9WTX5 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Skp1Q9WTX5 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Skp1Q9WTX5 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Skp1Q9WTX5 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Skp1Q9WTX5 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Skp1Q9WTX5 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Skp1Q9WTX5 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Skp1Q9WTX5 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Skp1Q9WTX5 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Skp1Q9WTX5 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Skp1Q9WTX5 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Skp1Q9WTX5 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms