Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTV6

Usp18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, mousemouse

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp18Q9WTV6 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Usp18Q9WTV6 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Usp18Q9WTV6 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Usp18Q9WTV6 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp18Q9WTV6 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp18Q9WTV6 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp18Q9WTV6 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp18Q9WTV6 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp18Q9WTV6 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp18Q9WTV6 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp18Q9WTV6 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp18Q9WTV6 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp18Q9WTV6 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp18Q9WTV6 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp18Q9WTV6 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp18Q9WTV6 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp18Q9WTV6 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp18Q9WTV6 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp18Q9WTV6 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp18Q9WTV6 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp18Q9WTV6 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp18Q9WTV6 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp18Q9WTV6 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp18Q9WTV6 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp18Q9WTV6 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp18Q9WTV6 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp18Q9WTV6 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp18Q9WTV6 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Usp18Q9WTV6 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Usp18Q9WTV6 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Usp18Q9WTV6 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Usp18Q9WTV6 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Usp18Q9WTV6 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Usp18Q9WTV6 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Usp18Q9WTV6 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Usp18Q9WTV6 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Usp18Q9WTV6 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Usp18Q9WTV6 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Usp18Q9WTV6 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Usp18Q9WTV6 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Usp18Q9WTV6 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Usp18Q9WTV6 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Usp18Q9WTV6 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Usp18Q9WTV6 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Usp18Q9WTV6 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Usp18Q9WTV6 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Usp18Q9WTV6 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Usp18Q9WTV6 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Usp18Q9WTV6 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Usp18Q9WTV6 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Usp18Q9WTV6 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Usp18Q9WTV6 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Usp18Q9WTV6 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Usp18Q9WTV6 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Usp18Q9WTV6 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Usp18Q9WTV6 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Usp18Q9WTV6 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Usp18Q9WTV6 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Usp18Q9WTV6 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Usp18Q9WTV6 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Usp18Q9WTV6 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Usp18Q9WTV6 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Usp18Q9WTV6 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Usp18Q9WTV6 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Usp18Q9WTV6 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Usp18Q9WTV6 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Usp18Q9WTV6 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Usp18Q9WTV6 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Usp18Q9WTV6 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Usp18Q9WTV6 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Usp18Q9WTV6 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Usp18Q9WTV6 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Usp18Q9WTV6 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Usp18Q9WTV6 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Usp18Q9WTV6 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Usp18Q9WTV6 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Usp18Q9WTV6 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Usp18Q9WTV6 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Usp18Q9WTV6 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Usp18Q9WTV6 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Usp18Q9WTV6 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Usp18Q9WTV6 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Usp18Q9WTV6 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Usp18Q9WTV6 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Usp18Q9WTV6 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Usp18Q9WTV6 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Usp18Q9WTV6 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Usp18Q9WTV6 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Usp18Q9WTV6 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Usp18Q9WTV6 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Usp18Q9WTV6 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Usp18Q9WTV6 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Usp18Q9WTV6 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Usp18Q9WTV6 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Usp18Q9WTV6 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Usp18Q9WTV6 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Usp18Q9WTV6 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Usp18Q9WTV6 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Usp18Q9WTV6 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Usp18Q9WTV6 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms