Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTR0

Mmp16, Matrix metalloproteinase-16, mousemouse

Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp16Q9WTR0 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mmp16Q9WTR0 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mmp16Q9WTR0 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mmp16Q9WTR0 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mmp16Q9WTR0 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mmp16Q9WTR0 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mmp16Q9WTR0 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mmp16Q9WTR0 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mmp16Q9WTR0 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mmp16Q9WTR0 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mmp16Q9WTR0 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mmp16Q9WTR0 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mmp16Q9WTR0 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Mmp16Q9WTR0 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Mmp16Q9WTR0 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Mmp16Q9WTR0 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Mmp16Q9WTR0 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mmp16Q9WTR0 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mmp16Q9WTR0 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mmp16Q9WTR0 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mmp16Q9WTR0 Gm8369-204ENSMUST00000188633 1227 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mmp16Q9WTR0 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Mmp16Q9WTR0 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Mmp16Q9WTR0 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mmp16Q9WTR0 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mmp16Q9WTR0 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mmp16Q9WTR0 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mmp16Q9WTR0 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mmp16Q9WTR0 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mmp16Q9WTR0 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mmp16Q9WTR0 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mmp16Q9WTR0 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mmp16Q9WTR0 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mmp16Q9WTR0 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mmp16Q9WTR0 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mmp16Q9WTR0 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mmp16Q9WTR0 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mmp16Q9WTR0 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mmp16Q9WTR0 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mmp16Q9WTR0 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mmp16Q9WTR0 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mmp16Q9WTR0 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mmp16Q9WTR0 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mmp16Q9WTR0 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mmp16Q9WTR0 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mmp16Q9WTR0 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mmp16Q9WTR0 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mmp16Q9WTR0 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mmp16Q9WTR0 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mmp16Q9WTR0 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mmp16Q9WTR0 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Mmp16Q9WTR0 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Mmp16Q9WTR0 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mmp16Q9WTR0 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mmp16Q9WTR0 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mmp16Q9WTR0 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mmp16Q9WTR0 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mmp16Q9WTR0 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mmp16Q9WTR0 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mmp16Q9WTR0 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mmp16Q9WTR0 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mmp16Q9WTR0 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mmp16Q9WTR0 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mmp16Q9WTR0 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Mmp16Q9WTR0 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mmp16Q9WTR0 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Mmp16Q9WTR0 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Mmp16Q9WTR0 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mmp16Q9WTR0 Klk1b7-ps-201ENSMUST00000078897 448 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mmp16Q9WTR0 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mmp16Q9WTR0 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mmp16Q9WTR0 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mmp16Q9WTR0 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mmp16Q9WTR0 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mmp16Q9WTR0 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mmp16Q9WTR0 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mmp16Q9WTR0 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mmp16Q9WTR0 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mmp16Q9WTR0 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mmp16Q9WTR0 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mmp16Q9WTR0 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mmp16Q9WTR0 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mmp16Q9WTR0 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Mmp16Q9WTR0 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mmp16Q9WTR0 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mmp16Q9WTR0 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mmp16Q9WTR0 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mmp16Q9WTR0 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mmp16Q9WTR0 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mmp16Q9WTR0 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mmp16Q9WTR0 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mmp16Q9WTR0 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mmp16Q9WTR0 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mmp16Q9WTR0 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mmp16Q9WTR0 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Mmp16Q9WTR0 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mmp16Q9WTR0 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mmp16Q9WTR0 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mmp16Q9WTR0 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mmp16Q9WTR0 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms