Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1P0

Psma4, Proteasome subunit alpha type-4, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psma4Q9R1P0 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Psma4Q9R1P0 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Psma4Q9R1P0 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Psma4Q9R1P0 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Psma4Q9R1P0 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Psma4Q9R1P0 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Psma4Q9R1P0 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Psma4Q9R1P0 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Psma4Q9R1P0 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Psma4Q9R1P0 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Psma4Q9R1P0 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Psma4Q9R1P0 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Psma4Q9R1P0 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Psma4Q9R1P0 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Psma4Q9R1P0 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Psma4Q9R1P0 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Psma4Q9R1P0 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Psma4Q9R1P0 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Psma4Q9R1P0 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Psma4Q9R1P0 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Psma4Q9R1P0 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Psma4Q9R1P0 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Psma4Q9R1P0 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Psma4Q9R1P0 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Psma4Q9R1P0 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Psma4Q9R1P0 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Psma4Q9R1P0 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Psma4Q9R1P0 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Psma4Q9R1P0 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Psma4Q9R1P0 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Psma4Q9R1P0 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Psma4Q9R1P0 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Psma4Q9R1P0 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Psma4Q9R1P0 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Psma4Q9R1P0 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Psma4Q9R1P0 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Psma4Q9R1P0 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Psma4Q9R1P0 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Psma4Q9R1P0 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Psma4Q9R1P0 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
Psma4Q9R1P0 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Psma4Q9R1P0 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Psma4Q9R1P0 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Psma4Q9R1P0 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Psma4Q9R1P0 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Psma4Q9R1P0 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Psma4Q9R1P0 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Psma4Q9R1P0 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Psma4Q9R1P0 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Psma4Q9R1P0 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Psma4Q9R1P0 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Psma4Q9R1P0 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Psma4Q9R1P0 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Psma4Q9R1P0 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Psma4Q9R1P0 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Psma4Q9R1P0 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Psma4Q9R1P0 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Psma4Q9R1P0 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Psma4Q9R1P0 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Psma4Q9R1P0 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Psma4Q9R1P0 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Psma4Q9R1P0 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Psma4Q9R1P0 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Psma4Q9R1P0 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Psma4Q9R1P0 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Psma4Q9R1P0 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Psma4Q9R1P0 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Psma4Q9R1P0 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Psma4Q9R1P0 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Psma4Q9R1P0 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Psma4Q9R1P0 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Psma4Q9R1P0 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Psma4Q9R1P0 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Psma4Q9R1P0 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Psma4Q9R1P0 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Psma4Q9R1P0 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Psma4Q9R1P0 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Psma4Q9R1P0 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Psma4Q9R1P0 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Psma4Q9R1P0 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Psma4Q9R1P0 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Psma4Q9R1P0 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Psma4Q9R1P0 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Psma4Q9R1P0 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Psma4Q9R1P0 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Psma4Q9R1P0 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Psma4Q9R1P0 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Psma4Q9R1P0 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Psma4Q9R1P0 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Psma4Q9R1P0 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Psma4Q9R1P0 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Psma4Q9R1P0 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Psma4Q9R1P0 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Psma4Q9R1P0 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Psma4Q9R1P0 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Psma4Q9R1P0 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Psma4Q9R1P0 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Psma4Q9R1P0 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Psma4Q9R1P0 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Psma4Q9R1P0 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms