Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1B9

Slit2, Slit homolog 2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,521 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slit2Q9R1B9 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Slit2Q9R1B9 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Slit2Q9R1B9 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Slit2Q9R1B9 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Slit2Q9R1B9 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Slit2Q9R1B9 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Slit2Q9R1B9 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Slit2Q9R1B9 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Slit2Q9R1B9 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Slit2Q9R1B9 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Slit2Q9R1B9 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Slit2Q9R1B9 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
Slit2Q9R1B9 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Slit2Q9R1B9 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Slit2Q9R1B9 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
Slit2Q9R1B9 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Slit2Q9R1B9 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Slit2Q9R1B9 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Slit2Q9R1B9 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Slit2Q9R1B9 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Slit2Q9R1B9 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Slit2Q9R1B9 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Slit2Q9R1B9 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Slit2Q9R1B9 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Slit2Q9R1B9 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Slit2Q9R1B9 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Slit2Q9R1B9 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Slit2Q9R1B9 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Slit2Q9R1B9 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Slit2Q9R1B9 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Slit2Q9R1B9 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Slit2Q9R1B9 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Slit2Q9R1B9 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Slit2Q9R1B9 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Slit2Q9R1B9 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Slit2Q9R1B9 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Slit2Q9R1B9 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Slit2Q9R1B9 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Slit2Q9R1B9 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Slit2Q9R1B9 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Slit2Q9R1B9 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Slit2Q9R1B9 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Slit2Q9R1B9 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Slit2Q9R1B9 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Slit2Q9R1B9 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Slit2Q9R1B9 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Slit2Q9R1B9 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Slit2Q9R1B9 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Slit2Q9R1B9 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Slit2Q9R1B9 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Slit2Q9R1B9 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Slit2Q9R1B9 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Slit2Q9R1B9 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Slit2Q9R1B9 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Slit2Q9R1B9 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Slit2Q9R1B9 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Slit2Q9R1B9 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Slit2Q9R1B9 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Slit2Q9R1B9 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Slit2Q9R1B9 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Slit2Q9R1B9 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Slit2Q9R1B9 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Slit2Q9R1B9 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Slit2Q9R1B9 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Slit2Q9R1B9 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Slit2Q9R1B9 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Slit2Q9R1B9 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Slit2Q9R1B9 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Slit2Q9R1B9 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Slit2Q9R1B9 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Slit2Q9R1B9 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Slit2Q9R1B9 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Slit2Q9R1B9 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Slit2Q9R1B9 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Slit2Q9R1B9 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Slit2Q9R1B9 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Slit2Q9R1B9 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Slit2Q9R1B9 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Slit2Q9R1B9 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Slit2Q9R1B9 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Slit2Q9R1B9 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Slit2Q9R1B9 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Slit2Q9R1B9 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Slit2Q9R1B9 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Slit2Q9R1B9 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Slit2Q9R1B9 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Slit2Q9R1B9 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Slit2Q9R1B9 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Slit2Q9R1B9 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Slit2Q9R1B9 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Slit2Q9R1B9 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Slit2Q9R1B9 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Slit2Q9R1B9 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Slit2Q9R1B9 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
Slit2Q9R1B9 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Slit2Q9R1B9 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Slit2Q9R1B9 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Slit2Q9R1B9 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Slit2Q9R1B9 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Slit2Q9R1B9 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms