Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0Q3

Tmed2, Transmembrane emp24 domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed2Q9R0Q3 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tmed2Q9R0Q3 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tmed2Q9R0Q3 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tmed2Q9R0Q3 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tmed2Q9R0Q3 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tmed2Q9R0Q3 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tmed2Q9R0Q3 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tmed2Q9R0Q3 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tmed2Q9R0Q3 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tmed2Q9R0Q3 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tmed2Q9R0Q3 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tmed2Q9R0Q3 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tmed2Q9R0Q3 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tmed2Q9R0Q3 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tmed2Q9R0Q3 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tmed2Q9R0Q3 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tmed2Q9R0Q3 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tmed2Q9R0Q3 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tmed2Q9R0Q3 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tmed2Q9R0Q3 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tmed2Q9R0Q3 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tmed2Q9R0Q3 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tmed2Q9R0Q3 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tmed2Q9R0Q3 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tmed2Q9R0Q3 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Tmed2Q9R0Q3 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tmed2Q9R0Q3 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tmed2Q9R0Q3 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tmed2Q9R0Q3 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tmed2Q9R0Q3 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tmed2Q9R0Q3 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tmed2Q9R0Q3 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tmed2Q9R0Q3 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tmed2Q9R0Q3 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tmed2Q9R0Q3 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Tmed2Q9R0Q3 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tmed2Q9R0Q3 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tmed2Q9R0Q3 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tmed2Q9R0Q3 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tmed2Q9R0Q3 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Tmed2Q9R0Q3 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Tmed2Q9R0Q3 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Tmed2Q9R0Q3 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Tmed2Q9R0Q3 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Tmed2Q9R0Q3 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Tmed2Q9R0Q3 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmed2Q9R0Q3 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmed2Q9R0Q3 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmed2Q9R0Q3 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmed2Q9R0Q3 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmed2Q9R0Q3 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmed2Q9R0Q3 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmed2Q9R0Q3 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmed2Q9R0Q3 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmed2Q9R0Q3 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmed2Q9R0Q3 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmed2Q9R0Q3 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmed2Q9R0Q3 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmed2Q9R0Q3 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmed2Q9R0Q3 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmed2Q9R0Q3 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmed2Q9R0Q3 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmed2Q9R0Q3 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmed2Q9R0Q3 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmed2Q9R0Q3 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmed2Q9R0Q3 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmed2Q9R0Q3 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmed2Q9R0Q3 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmed2Q9R0Q3 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmed2Q9R0Q3 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmed2Q9R0Q3 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmed2Q9R0Q3 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmed2Q9R0Q3 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmed2Q9R0Q3 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmed2Q9R0Q3 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmed2Q9R0Q3 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmed2Q9R0Q3 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmed2Q9R0Q3 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmed2Q9R0Q3 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmed2Q9R0Q3 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmed2Q9R0Q3 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmed2Q9R0Q3 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmed2Q9R0Q3 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmed2Q9R0Q3 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmed2Q9R0Q3 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmed2Q9R0Q3 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmed2Q9R0Q3 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmed2Q9R0Q3 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmed2Q9R0Q3 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tmed2Q9R0Q3 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tmed2Q9R0Q3 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tmed2Q9R0Q3 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tmed2Q9R0Q3 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tmed2Q9R0Q3 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tmed2Q9R0Q3 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tmed2Q9R0Q3 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tmed2Q9R0Q3 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tmed2Q9R0Q3 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tmed2Q9R0Q3 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tmed2Q9R0Q3 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms