Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0K7

Atp2b2, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2b2Q9R0K7 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Atp2b2Q9R0K7 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Atp2b2Q9R0K7 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Atp2b2Q9R0K7 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Atp2b2Q9R0K7 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Atp2b2Q9R0K7 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Atp2b2Q9R0K7 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Atp2b2Q9R0K7 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Atp2b2Q9R0K7 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Atp2b2Q9R0K7 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Atp2b2Q9R0K7 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Atp2b2Q9R0K7 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Atp2b2Q9R0K7 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Atp2b2Q9R0K7 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Atp2b2Q9R0K7 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Atp2b2Q9R0K7 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Atp2b2Q9R0K7 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Atp2b2Q9R0K7 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Atp2b2Q9R0K7 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Atp2b2Q9R0K7 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Atp2b2Q9R0K7 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Atp2b2Q9R0K7 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Atp2b2Q9R0K7 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Atp2b2Q9R0K7 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Atp2b2Q9R0K7 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Atp2b2Q9R0K7 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Atp2b2Q9R0K7 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Atp2b2Q9R0K7 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Atp2b2Q9R0K7 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Atp2b2Q9R0K7 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Atp2b2Q9R0K7 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Atp2b2Q9R0K7 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Atp2b2Q9R0K7 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Atp2b2Q9R0K7 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Atp2b2Q9R0K7 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Atp2b2Q9R0K7 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Atp2b2Q9R0K7 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Atp2b2Q9R0K7 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Atp2b2Q9R0K7 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Atp2b2Q9R0K7 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Atp2b2Q9R0K7 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Atp2b2Q9R0K7 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Atp2b2Q9R0K7 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Atp2b2Q9R0K7 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Atp2b2Q9R0K7 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Atp2b2Q9R0K7 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Atp2b2Q9R0K7 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Atp2b2Q9R0K7 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Atp2b2Q9R0K7 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Atp2b2Q9R0K7 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Atp2b2Q9R0K7 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Atp2b2Q9R0K7 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Atp2b2Q9R0K7 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Atp2b2Q9R0K7 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Atp2b2Q9R0K7 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Atp2b2Q9R0K7 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Atp2b2Q9R0K7 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Atp2b2Q9R0K7 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Atp2b2Q9R0K7 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Atp2b2Q9R0K7 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Atp2b2Q9R0K7 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Atp2b2Q9R0K7 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Atp2b2Q9R0K7 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Atp2b2Q9R0K7 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Atp2b2Q9R0K7 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Atp2b2Q9R0K7 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Atp2b2Q9R0K7 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Atp2b2Q9R0K7 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Atp2b2Q9R0K7 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Atp2b2Q9R0K7 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Atp2b2Q9R0K7 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Atp2b2Q9R0K7 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Atp2b2Q9R0K7 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Atp2b2Q9R0K7 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Atp2b2Q9R0K7 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Atp2b2Q9R0K7 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Atp2b2Q9R0K7 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Atp2b2Q9R0K7 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Atp2b2Q9R0K7 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Atp2b2Q9R0K7 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Atp2b2Q9R0K7 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Atp2b2Q9R0K7 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Atp2b2Q9R0K7 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Atp2b2Q9R0K7 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Atp2b2Q9R0K7 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Atp2b2Q9R0K7 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Atp2b2Q9R0K7 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Atp2b2Q9R0K7 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Atp2b2Q9R0K7 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Atp2b2Q9R0K7 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Atp2b2Q9R0K7 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Atp2b2Q9R0K7 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Atp2b2Q9R0K7 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Atp2b2Q9R0K7 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Atp2b2Q9R0K7 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Atp2b2Q9R0K7 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Atp2b2Q9R0K7 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Atp2b2Q9R0K7 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Atp2b2Q9R0K7 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Atp2b2Q9R0K7 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms