Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZW0

Atp11c, Phospholipid-transporting ATPase 11C, mousemouse

Predictions only

Length 1,129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp11cQ9QZW0 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Atp11cQ9QZW0 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Atp11cQ9QZW0 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Atp11cQ9QZW0 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Atp11cQ9QZW0 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Atp11cQ9QZW0 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Atp11cQ9QZW0 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Atp11cQ9QZW0 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Atp11cQ9QZW0 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Atp11cQ9QZW0 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Atp11cQ9QZW0 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Atp11cQ9QZW0 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Atp11cQ9QZW0 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Atp11cQ9QZW0 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Atp11cQ9QZW0 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Atp11cQ9QZW0 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atp11cQ9QZW0 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atp11cQ9QZW0 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atp11cQ9QZW0 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atp11cQ9QZW0 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atp11cQ9QZW0 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Atp11cQ9QZW0 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atp11cQ9QZW0 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atp11cQ9QZW0 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Atp11cQ9QZW0 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atp11cQ9QZW0 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atp11cQ9QZW0 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atp11cQ9QZW0 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atp11cQ9QZW0 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atp11cQ9QZW0 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Atp11cQ9QZW0 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atp11cQ9QZW0 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atp11cQ9QZW0 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atp11cQ9QZW0 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atp11cQ9QZW0 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atp11cQ9QZW0 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atp11cQ9QZW0 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atp11cQ9QZW0 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atp11cQ9QZW0 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atp11cQ9QZW0 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atp11cQ9QZW0 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atp11cQ9QZW0 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atp11cQ9QZW0 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atp11cQ9QZW0 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atp11cQ9QZW0 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atp11cQ9QZW0 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atp11cQ9QZW0 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atp11cQ9QZW0 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atp11cQ9QZW0 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atp11cQ9QZW0 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atp11cQ9QZW0 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atp11cQ9QZW0 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atp11cQ9QZW0 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atp11cQ9QZW0 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atp11cQ9QZW0 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atp11cQ9QZW0 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atp11cQ9QZW0 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atp11cQ9QZW0 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atp11cQ9QZW0 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atp11cQ9QZW0 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atp11cQ9QZW0 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Atp11cQ9QZW0 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atp11cQ9QZW0 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Atp11cQ9QZW0 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atp11cQ9QZW0 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atp11cQ9QZW0 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atp11cQ9QZW0 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atp11cQ9QZW0 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atp11cQ9QZW0 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atp11cQ9QZW0 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Atp11cQ9QZW0 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Atp11cQ9QZW0 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Atp11cQ9QZW0 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Atp11cQ9QZW0 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Atp11cQ9QZW0 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Atp11cQ9QZW0 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Atp11cQ9QZW0 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Atp11cQ9QZW0 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Atp11cQ9QZW0 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Atp11cQ9QZW0 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Atp11cQ9QZW0 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Atp11cQ9QZW0 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Atp11cQ9QZW0 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Atp11cQ9QZW0 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Atp11cQ9QZW0 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Atp11cQ9QZW0 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Atp11cQ9QZW0 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atp11cQ9QZW0 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atp11cQ9QZW0 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atp11cQ9QZW0 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Atp11cQ9QZW0 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atp11cQ9QZW0 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atp11cQ9QZW0 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atp11cQ9QZW0 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atp11cQ9QZW0 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atp11cQ9QZW0 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atp11cQ9QZW0 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atp11cQ9QZW0 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atp11cQ9QZW0 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atp11cQ9QZW0 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms