Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZM3

Clcf1, Cardiotrophin-like cytokine factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clcf1Q9QZM3 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clcf1Q9QZM3 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Clcf1Q9QZM3 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clcf1Q9QZM3 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clcf1Q9QZM3 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clcf1Q9QZM3 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clcf1Q9QZM3 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clcf1Q9QZM3 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clcf1Q9QZM3 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clcf1Q9QZM3 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clcf1Q9QZM3 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clcf1Q9QZM3 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clcf1Q9QZM3 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clcf1Q9QZM3 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clcf1Q9QZM3 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clcf1Q9QZM3 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clcf1Q9QZM3 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clcf1Q9QZM3 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clcf1Q9QZM3 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clcf1Q9QZM3 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clcf1Q9QZM3 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clcf1Q9QZM3 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clcf1Q9QZM3 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clcf1Q9QZM3 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clcf1Q9QZM3 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clcf1Q9QZM3 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clcf1Q9QZM3 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clcf1Q9QZM3 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clcf1Q9QZM3 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clcf1Q9QZM3 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clcf1Q9QZM3 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clcf1Q9QZM3 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clcf1Q9QZM3 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clcf1Q9QZM3 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clcf1Q9QZM3 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clcf1Q9QZM3 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clcf1Q9QZM3 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clcf1Q9QZM3 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Clcf1Q9QZM3 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Clcf1Q9QZM3 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Clcf1Q9QZM3 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Clcf1Q9QZM3 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Clcf1Q9QZM3 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Clcf1Q9QZM3 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Clcf1Q9QZM3 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Clcf1Q9QZM3 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Clcf1Q9QZM3 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Clcf1Q9QZM3 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Clcf1Q9QZM3 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Clcf1Q9QZM3 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Clcf1Q9QZM3 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Clcf1Q9QZM3 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Clcf1Q9QZM3 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Clcf1Q9QZM3 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Clcf1Q9QZM3 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Clcf1Q9QZM3 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Clcf1Q9QZM3 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Clcf1Q9QZM3 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Clcf1Q9QZM3 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Clcf1Q9QZM3 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Clcf1Q9QZM3 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Clcf1Q9QZM3 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Clcf1Q9QZM3 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Clcf1Q9QZM3 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Clcf1Q9QZM3 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Clcf1Q9QZM3 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Clcf1Q9QZM3 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Clcf1Q9QZM3 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Clcf1Q9QZM3 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Clcf1Q9QZM3 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Clcf1Q9QZM3 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Clcf1Q9QZM3 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Clcf1Q9QZM3 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Clcf1Q9QZM3 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Clcf1Q9QZM3 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Clcf1Q9QZM3 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Clcf1Q9QZM3 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Clcf1Q9QZM3 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Clcf1Q9QZM3 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Clcf1Q9QZM3 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Clcf1Q9QZM3 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Clcf1Q9QZM3 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Clcf1Q9QZM3 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Clcf1Q9QZM3 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Clcf1Q9QZM3 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Clcf1Q9QZM3 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Clcf1Q9QZM3 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Clcf1Q9QZM3 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Clcf1Q9QZM3 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Clcf1Q9QZM3 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Clcf1Q9QZM3 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Clcf1Q9QZM3 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Clcf1Q9QZM3 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Clcf1Q9QZM3 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Clcf1Q9QZM3 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Clcf1Q9QZM3 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Clcf1Q9QZM3 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Clcf1Q9QZM3 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Clcf1Q9QZM3 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Clcf1Q9QZM3 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.1 ms