Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ49

Ubxn8, UBX domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 277 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn8Q9QZ49 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Ubxn8Q9QZ49 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ubxn8Q9QZ49 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ubxn8Q9QZ49 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ubxn8Q9QZ49 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Ubxn8Q9QZ49 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ubxn8Q9QZ49 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ubxn8Q9QZ49 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ubxn8Q9QZ49 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Ubxn8Q9QZ49 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ubxn8Q9QZ49 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ubxn8Q9QZ49 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ubxn8Q9QZ49 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ubxn8Q9QZ49 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ubxn8Q9QZ49 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Ubxn8Q9QZ49 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ubxn8Q9QZ49 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ubxn8Q9QZ49 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ubxn8Q9QZ49 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ubxn8Q9QZ49 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ubxn8Q9QZ49 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ubxn8Q9QZ49 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ubxn8Q9QZ49 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ubxn8Q9QZ49 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ubxn8Q9QZ49 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ubxn8Q9QZ49 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ubxn8Q9QZ49 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ubxn8Q9QZ49 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ubxn8Q9QZ49 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ubxn8Q9QZ49 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ubxn8Q9QZ49 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ubxn8Q9QZ49 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ubxn8Q9QZ49 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ubxn8Q9QZ49 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ubxn8Q9QZ49 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ubxn8Q9QZ49 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ubxn8Q9QZ49 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ubxn8Q9QZ49 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ubxn8Q9QZ49 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ubxn8Q9QZ49 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ubxn8Q9QZ49 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ubxn8Q9QZ49 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ubxn8Q9QZ49 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ubxn8Q9QZ49 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Ubxn8Q9QZ49 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ubxn8Q9QZ49 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ubxn8Q9QZ49 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ubxn8Q9QZ49 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ubxn8Q9QZ49 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ubxn8Q9QZ49 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ubxn8Q9QZ49 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ubxn8Q9QZ49 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ubxn8Q9QZ49 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ubxn8Q9QZ49 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ubxn8Q9QZ49 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ubxn8Q9QZ49 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ubxn8Q9QZ49 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ubxn8Q9QZ49 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ubxn8Q9QZ49 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ubxn8Q9QZ49 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ubxn8Q9QZ49 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Ubxn8Q9QZ49 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ubxn8Q9QZ49 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ubxn8Q9QZ49 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ubxn8Q9QZ49 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ubxn8Q9QZ49 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ubxn8Q9QZ49 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ubxn8Q9QZ49 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ubxn8Q9QZ49 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ubxn8Q9QZ49 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ubxn8Q9QZ49 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ubxn8Q9QZ49 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ubxn8Q9QZ49 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Ubxn8Q9QZ49 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ubxn8Q9QZ49 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ubxn8Q9QZ49 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ubxn8Q9QZ49 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ubxn8Q9QZ49 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ubxn8Q9QZ49 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Ubxn8Q9QZ49 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ubxn8Q9QZ49 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ubxn8Q9QZ49 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ubxn8Q9QZ49 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ubxn8Q9QZ49 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ubxn8Q9QZ49 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ubxn8Q9QZ49 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ubxn8Q9QZ49 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ubxn8Q9QZ49 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ubxn8Q9QZ49 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ubxn8Q9QZ49 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ubxn8Q9QZ49 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ubxn8Q9QZ49 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ubxn8Q9QZ49 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ubxn8Q9QZ49 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ubxn8Q9QZ49 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ubxn8Q9QZ49 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ubxn8Q9QZ49 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ubxn8Q9QZ49 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ubxn8Q9QZ49 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ubxn8Q9QZ49 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms