Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYF1

Rdh11, Retinol dehydrogenase 11, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh11Q9QYF1 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rdh11Q9QYF1 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rdh11Q9QYF1 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rdh11Q9QYF1 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Rdh11Q9QYF1 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rdh11Q9QYF1 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rdh11Q9QYF1 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rdh11Q9QYF1 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rdh11Q9QYF1 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Rdh11Q9QYF1 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rdh11Q9QYF1 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rdh11Q9QYF1 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rdh11Q9QYF1 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rdh11Q9QYF1 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rdh11Q9QYF1 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rdh11Q9QYF1 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rdh11Q9QYF1 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rdh11Q9QYF1 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rdh11Q9QYF1 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rdh11Q9QYF1 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rdh11Q9QYF1 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rdh11Q9QYF1 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rdh11Q9QYF1 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rdh11Q9QYF1 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rdh11Q9QYF1 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rdh11Q9QYF1 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rdh11Q9QYF1 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rdh11Q9QYF1 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rdh11Q9QYF1 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
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Rdh11Q9QYF1 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rdh11Q9QYF1 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rdh11Q9QYF1 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rdh11Q9QYF1 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rdh11Q9QYF1 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rdh11Q9QYF1 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rdh11Q9QYF1 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rdh11Q9QYF1 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rdh11Q9QYF1 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rdh11Q9QYF1 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
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Rdh11Q9QYF1 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
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Rdh11Q9QYF1 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rdh11Q9QYF1 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rdh11Q9QYF1 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
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Rdh11Q9QYF1 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rdh11Q9QYF1 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
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Rdh11Q9QYF1 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rdh11Q9QYF1 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rdh11Q9QYF1 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rdh11Q9QYF1 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rdh11Q9QYF1 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
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Rdh11Q9QYF1 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rdh11Q9QYF1 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
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Rdh11Q9QYF1 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
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Rdh11Q9QYF1 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rdh11Q9QYF1 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rdh11Q9QYF1 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rdh11Q9QYF1 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Rdh11Q9QYF1 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rdh11Q9QYF1 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rdh11Q9QYF1 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rdh11Q9QYF1 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rdh11Q9QYF1 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Rdh11Q9QYF1 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rdh11Q9QYF1 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rdh11Q9QYF1 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Rdh11Q9QYF1 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rdh11Q9QYF1 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rdh11Q9QYF1 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rdh11Q9QYF1 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Rdh11Q9QYF1 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rdh11Q9QYF1 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rdh11Q9QYF1 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rdh11Q9QYF1 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rdh11Q9QYF1 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rdh11Q9QYF1 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rdh11Q9QYF1 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rdh11Q9QYF1 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rdh11Q9QYF1 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rdh11Q9QYF1 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rdh11Q9QYF1 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rdh11Q9QYF1 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
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