Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXN3

Trip4, Activating signal cointegrator 1, mousemouse

Predictions only

Length 581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip4Q9QXN3 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trip4Q9QXN3 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trip4Q9QXN3 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trip4Q9QXN3 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trip4Q9QXN3 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trip4Q9QXN3 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trip4Q9QXN3 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trip4Q9QXN3 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trip4Q9QXN3 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trip4Q9QXN3 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trip4Q9QXN3 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trip4Q9QXN3 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trip4Q9QXN3 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trip4Q9QXN3 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trip4Q9QXN3 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trip4Q9QXN3 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trip4Q9QXN3 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trip4Q9QXN3 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trip4Q9QXN3 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trip4Q9QXN3 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trip4Q9QXN3 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trip4Q9QXN3 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trip4Q9QXN3 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trip4Q9QXN3 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trip4Q9QXN3 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Trip4Q9QXN3 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trip4Q9QXN3 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trip4Q9QXN3 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trip4Q9QXN3 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trip4Q9QXN3 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trip4Q9QXN3 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Trip4Q9QXN3 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trip4Q9QXN3 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trip4Q9QXN3 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trip4Q9QXN3 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trip4Q9QXN3 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Trip4Q9QXN3 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trip4Q9QXN3 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trip4Q9QXN3 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trip4Q9QXN3 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trip4Q9QXN3 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trip4Q9QXN3 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trip4Q9QXN3 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trip4Q9QXN3 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trip4Q9QXN3 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trip4Q9QXN3 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trip4Q9QXN3 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trip4Q9QXN3 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trip4Q9QXN3 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trip4Q9QXN3 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trip4Q9QXN3 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Trip4Q9QXN3 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trip4Q9QXN3 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trip4Q9QXN3 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trip4Q9QXN3 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trip4Q9QXN3 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trip4Q9QXN3 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trip4Q9QXN3 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trip4Q9QXN3 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trip4Q9QXN3 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trip4Q9QXN3 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trip4Q9QXN3 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trip4Q9QXN3 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trip4Q9QXN3 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trip4Q9QXN3 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trip4Q9QXN3 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trip4Q9QXN3 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trip4Q9QXN3 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trip4Q9QXN3 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trip4Q9QXN3 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trip4Q9QXN3 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trip4Q9QXN3 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trip4Q9QXN3 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trip4Q9QXN3 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trip4Q9QXN3 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trip4Q9QXN3 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Trip4Q9QXN3 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trip4Q9QXN3 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trip4Q9QXN3 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trip4Q9QXN3 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trip4Q9QXN3 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trip4Q9QXN3 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trip4Q9QXN3 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trip4Q9QXN3 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Trip4Q9QXN3 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trip4Q9QXN3 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trip4Q9QXN3 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trip4Q9QXN3 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trip4Q9QXN3 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Trip4Q9QXN3 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trip4Q9QXN3 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trip4Q9QXN3 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trip4Q9QXN3 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trip4Q9QXN3 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trip4Q9QXN3 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trip4Q9QXN3 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Trip4Q9QXN3 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Trip4Q9QXN3 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Trip4Q9QXN3 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trip4Q9QXN3 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms