Protein–RNA interactions for Protein: Q9QX15

Clca3a1, Calcium-activated chloride channel regulator 3A-1, mousemouse

Predictions only

Length 902 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clca3a1Q9QX15 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Clca3a1Q9QX15 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Clca3a1Q9QX15 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Clca3a1Q9QX15 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Clca3a1Q9QX15 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Clca3a1Q9QX15 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Clca3a1Q9QX15 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Clca3a1Q9QX15 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Clca3a1Q9QX15 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Clca3a1Q9QX15 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Clca3a1Q9QX15 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Clca3a1Q9QX15 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Clca3a1Q9QX15 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Clca3a1Q9QX15 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Clca3a1Q9QX15 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Clca3a1Q9QX15 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Clca3a1Q9QX15 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Clca3a1Q9QX15 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Clca3a1Q9QX15 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Clca3a1Q9QX15 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Clca3a1Q9QX15 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Clca3a1Q9QX15 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Clca3a1Q9QX15 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Clca3a1Q9QX15 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Clca3a1Q9QX15 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Clca3a1Q9QX15 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Clca3a1Q9QX15 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Clca3a1Q9QX15 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Clca3a1Q9QX15 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Clca3a1Q9QX15 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Clca3a1Q9QX15 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Clca3a1Q9QX15 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Clca3a1Q9QX15 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Clca3a1Q9QX15 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Clca3a1Q9QX15 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Clca3a1Q9QX15 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Clca3a1Q9QX15 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Clca3a1Q9QX15 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Clca3a1Q9QX15 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Clca3a1Q9QX15 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Clca3a1Q9QX15 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Clca3a1Q9QX15 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Clca3a1Q9QX15 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Clca3a1Q9QX15 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Clca3a1Q9QX15 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Clca3a1Q9QX15 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Clca3a1Q9QX15 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Clca3a1Q9QX15 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Clca3a1Q9QX15 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Clca3a1Q9QX15 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Clca3a1Q9QX15 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Clca3a1Q9QX15 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Clca3a1Q9QX15 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Clca3a1Q9QX15 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Clca3a1Q9QX15 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Clca3a1Q9QX15 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Clca3a1Q9QX15 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Clca3a1Q9QX15 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Clca3a1Q9QX15 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Clca3a1Q9QX15 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Clca3a1Q9QX15 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Clca3a1Q9QX15 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Clca3a1Q9QX15 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Clca3a1Q9QX15 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Clca3a1Q9QX15 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Clca3a1Q9QX15 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Clca3a1Q9QX15 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Clca3a1Q9QX15 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Clca3a1Q9QX15 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Clca3a1Q9QX15 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Clca3a1Q9QX15 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Clca3a1Q9QX15 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Clca3a1Q9QX15 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Clca3a1Q9QX15 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Clca3a1Q9QX15 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Clca3a1Q9QX15 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Clca3a1Q9QX15 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Clca3a1Q9QX15 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Clca3a1Q9QX15 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Clca3a1Q9QX15 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Clca3a1Q9QX15 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Clca3a1Q9QX15 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Clca3a1Q9QX15 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Clca3a1Q9QX15 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Clca3a1Q9QX15 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Clca3a1Q9QX15 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Clca3a1Q9QX15 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Clca3a1Q9QX15 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Clca3a1Q9QX15 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Clca3a1Q9QX15 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Clca3a1Q9QX15 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Clca3a1Q9QX15 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Clca3a1Q9QX15 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Clca3a1Q9QX15 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Clca3a1Q9QX15 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Clca3a1Q9QX15 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Clca3a1Q9QX15 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Clca3a1Q9QX15 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Clca3a1Q9QX15 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Clca3a1Q9QX15 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms