Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUS6

Mid2, Probable E3 ubiquitin-protein ligase MID2, mousemouse

Predictions only

Length 705 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mid2Q9QUS6 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mid2Q9QUS6 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mid2Q9QUS6 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mid2Q9QUS6 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mid2Q9QUS6 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mid2Q9QUS6 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mid2Q9QUS6 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mid2Q9QUS6 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mid2Q9QUS6 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mid2Q9QUS6 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Mid2Q9QUS6 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mid2Q9QUS6 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Mid2Q9QUS6 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mid2Q9QUS6 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mid2Q9QUS6 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Mid2Q9QUS6 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mid2Q9QUS6 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mid2Q9QUS6 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mid2Q9QUS6 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mid2Q9QUS6 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mid2Q9QUS6 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mid2Q9QUS6 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mid2Q9QUS6 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mid2Q9QUS6 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mid2Q9QUS6 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mid2Q9QUS6 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Mid2Q9QUS6 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mid2Q9QUS6 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mid2Q9QUS6 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mid2Q9QUS6 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Mid2Q9QUS6 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mid2Q9QUS6 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mid2Q9QUS6 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mid2Q9QUS6 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mid2Q9QUS6 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mid2Q9QUS6 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mid2Q9QUS6 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mid2Q9QUS6 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mid2Q9QUS6 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mid2Q9QUS6 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mid2Q9QUS6 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mid2Q9QUS6 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Mid2Q9QUS6 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Mid2Q9QUS6 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Mid2Q9QUS6 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Mid2Q9QUS6 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Mid2Q9QUS6 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Mid2Q9QUS6 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Mid2Q9QUS6 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Mid2Q9QUS6 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Mid2Q9QUS6 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Mid2Q9QUS6 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Mid2Q9QUS6 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Mid2Q9QUS6 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Mid2Q9QUS6 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Mid2Q9QUS6 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Mid2Q9QUS6 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Mid2Q9QUS6 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Mid2Q9QUS6 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Mid2Q9QUS6 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Mid2Q9QUS6 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Mid2Q9QUS6 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Mid2Q9QUS6 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Mid2Q9QUS6 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Mid2Q9QUS6 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Mid2Q9QUS6 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Mid2Q9QUS6 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Mid2Q9QUS6 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Mid2Q9QUS6 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.26
Mid2Q9QUS6 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
Mid2Q9QUS6 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Mid2Q9QUS6 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Mid2Q9QUS6 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Mid2Q9QUS6 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Mid2Q9QUS6 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Mid2Q9QUS6 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Mid2Q9QUS6 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Mid2Q9QUS6 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Mid2Q9QUS6 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Mid2Q9QUS6 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Mid2Q9QUS6 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Mid2Q9QUS6 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Mid2Q9QUS6 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Mid2Q9QUS6 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Mid2Q9QUS6 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Mid2Q9QUS6 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Mid2Q9QUS6 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Mid2Q9QUS6 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Mid2Q9QUS6 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Mid2Q9QUS6 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Mid2Q9QUS6 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Mid2Q9QUS6 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Mid2Q9QUS6 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Mid2Q9QUS6 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mid2Q9QUS6 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mid2Q9QUS6 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mid2Q9QUS6 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mid2Q9QUS6 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mid2Q9QUS6 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mid2Q9QUS6 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms