Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUM7

Msh5, MutS protein homolog 5, mousemouse

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msh5Q9QUM7 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Msh5Q9QUM7 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Msh5Q9QUM7 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Msh5Q9QUM7 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Msh5Q9QUM7 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Msh5Q9QUM7 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Msh5Q9QUM7 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Msh5Q9QUM7 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Msh5Q9QUM7 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Msh5Q9QUM7 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Msh5Q9QUM7 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Msh5Q9QUM7 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Msh5Q9QUM7 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Msh5Q9QUM7 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Msh5Q9QUM7 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Msh5Q9QUM7 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Msh5Q9QUM7 Gm37319-201ENSMUST00000193500 636 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Msh5Q9QUM7 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Msh5Q9QUM7 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Msh5Q9QUM7 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Msh5Q9QUM7 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Msh5Q9QUM7 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Msh5Q9QUM7 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Msh5Q9QUM7 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Msh5Q9QUM7 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Msh5Q9QUM7 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Msh5Q9QUM7 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Msh5Q9QUM7 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Msh5Q9QUM7 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Msh5Q9QUM7 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Msh5Q9QUM7 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Msh5Q9QUM7 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Msh5Q9QUM7 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Msh5Q9QUM7 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Msh5Q9QUM7 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Msh5Q9QUM7 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Msh5Q9QUM7 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Msh5Q9QUM7 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Msh5Q9QUM7 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Msh5Q9QUM7 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Msh5Q9QUM7 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Msh5Q9QUM7 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Msh5Q9QUM7 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Msh5Q9QUM7 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Msh5Q9QUM7 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Msh5Q9QUM7 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Msh5Q9QUM7 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Msh5Q9QUM7 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Msh5Q9QUM7 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Msh5Q9QUM7 Gm45609-206ENSMUST00000210176 1023 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Msh5Q9QUM7 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Msh5Q9QUM7 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Msh5Q9QUM7 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Msh5Q9QUM7 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Msh5Q9QUM7 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Msh5Q9QUM7 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Msh5Q9QUM7 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Msh5Q9QUM7 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Msh5Q9QUM7 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Msh5Q9QUM7 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Msh5Q9QUM7 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Msh5Q9QUM7 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Msh5Q9QUM7 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Msh5Q9QUM7 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Msh5Q9QUM7 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Msh5Q9QUM7 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Msh5Q9QUM7 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Msh5Q9QUM7 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Msh5Q9QUM7 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Msh5Q9QUM7 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Msh5Q9QUM7 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Msh5Q9QUM7 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Msh5Q9QUM7 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Msh5Q9QUM7 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Msh5Q9QUM7 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Msh5Q9QUM7 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Msh5Q9QUM7 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Msh5Q9QUM7 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Msh5Q9QUM7 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Msh5Q9QUM7 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Msh5Q9QUM7 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Msh5Q9QUM7 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Msh5Q9QUM7 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Msh5Q9QUM7 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Msh5Q9QUM7 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Msh5Q9QUM7 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Msh5Q9QUM7 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Msh5Q9QUM7 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Msh5Q9QUM7 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Msh5Q9QUM7 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Msh5Q9QUM7 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Msh5Q9QUM7 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Msh5Q9QUM7 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Msh5Q9QUM7 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Msh5Q9QUM7 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Msh5Q9QUM7 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Msh5Q9QUM7 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Msh5Q9QUM7 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Msh5Q9QUM7 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Msh5Q9QUM7 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms