Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUK0

Cdkl2, Cyclin-dependent kinase-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkl2Q9QUK0 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cdkl2Q9QUK0 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cdkl2Q9QUK0 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cdkl2Q9QUK0 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cdkl2Q9QUK0 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cdkl2Q9QUK0 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cdkl2Q9QUK0 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cdkl2Q9QUK0 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cdkl2Q9QUK0 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cdkl2Q9QUK0 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cdkl2Q9QUK0 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cdkl2Q9QUK0 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cdkl2Q9QUK0 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cdkl2Q9QUK0 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cdkl2Q9QUK0 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cdkl2Q9QUK0 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cdkl2Q9QUK0 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cdkl2Q9QUK0 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cdkl2Q9QUK0 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cdkl2Q9QUK0 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cdkl2Q9QUK0 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cdkl2Q9QUK0 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cdkl2Q9QUK0 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cdkl2Q9QUK0 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cdkl2Q9QUK0 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cdkl2Q9QUK0 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cdkl2Q9QUK0 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cdkl2Q9QUK0 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cdkl2Q9QUK0 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cdkl2Q9QUK0 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cdkl2Q9QUK0 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cdkl2Q9QUK0 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cdkl2Q9QUK0 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Cdkl2Q9QUK0 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cdkl2Q9QUK0 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cdkl2Q9QUK0 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cdkl2Q9QUK0 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cdkl2Q9QUK0 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cdkl2Q9QUK0 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cdkl2Q9QUK0 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cdkl2Q9QUK0 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cdkl2Q9QUK0 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cdkl2Q9QUK0 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Cdkl2Q9QUK0 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cdkl2Q9QUK0 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cdkl2Q9QUK0 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cdkl2Q9QUK0 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cdkl2Q9QUK0 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cdkl2Q9QUK0 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cdkl2Q9QUK0 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cdkl2Q9QUK0 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cdkl2Q9QUK0 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cdkl2Q9QUK0 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cdkl2Q9QUK0 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cdkl2Q9QUK0 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cdkl2Q9QUK0 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cdkl2Q9QUK0 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cdkl2Q9QUK0 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Cdkl2Q9QUK0 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cdkl2Q9QUK0 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cdkl2Q9QUK0 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cdkl2Q9QUK0 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Cdkl2Q9QUK0 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cdkl2Q9QUK0 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cdkl2Q9QUK0 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cdkl2Q9QUK0 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cdkl2Q9QUK0 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cdkl2Q9QUK0 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cdkl2Q9QUK0 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cdkl2Q9QUK0 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cdkl2Q9QUK0 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cdkl2Q9QUK0 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cdkl2Q9QUK0 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cdkl2Q9QUK0 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cdkl2Q9QUK0 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cdkl2Q9QUK0 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cdkl2Q9QUK0 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cdkl2Q9QUK0 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cdkl2Q9QUK0 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cdkl2Q9QUK0 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cdkl2Q9QUK0 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cdkl2Q9QUK0 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cdkl2Q9QUK0 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cdkl2Q9QUK0 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cdkl2Q9QUK0 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cdkl2Q9QUK0 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cdkl2Q9QUK0 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cdkl2Q9QUK0 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cdkl2Q9QUK0 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cdkl2Q9QUK0 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cdkl2Q9QUK0 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cdkl2Q9QUK0 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cdkl2Q9QUK0 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cdkl2Q9QUK0 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cdkl2Q9QUK0 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cdkl2Q9QUK0 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cdkl2Q9QUK0 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cdkl2Q9QUK0 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cdkl2Q9QUK0 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cdkl2Q9QUK0 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms