Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMG7

Hdgfl3, Hepatoma-derived growth factor-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdgfl3Q9JMG7 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Hdgfl3Q9JMG7 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Hdgfl3Q9JMG7 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Hdgfl3Q9JMG7 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Hdgfl3Q9JMG7 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Hdgfl3Q9JMG7 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Hdgfl3Q9JMG7 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Hdgfl3Q9JMG7 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Hdgfl3Q9JMG7 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Hdgfl3Q9JMG7 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Hdgfl3Q9JMG7 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Hdgfl3Q9JMG7 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Hdgfl3Q9JMG7 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Hdgfl3Q9JMG7 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Hdgfl3Q9JMG7 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Hdgfl3Q9JMG7 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Hdgfl3Q9JMG7 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Hdgfl3Q9JMG7 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Hdgfl3Q9JMG7 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Hdgfl3Q9JMG7 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Hdgfl3Q9JMG7 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Hdgfl3Q9JMG7 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Hdgfl3Q9JMG7 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Hdgfl3Q9JMG7 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Hdgfl3Q9JMG7 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Hdgfl3Q9JMG7 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Hdgfl3Q9JMG7 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Hdgfl3Q9JMG7 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Hdgfl3Q9JMG7 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Hdgfl3Q9JMG7 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Hdgfl3Q9JMG7 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Hdgfl3Q9JMG7 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Hdgfl3Q9JMG7 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Hdgfl3Q9JMG7 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Hdgfl3Q9JMG7 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Hdgfl3Q9JMG7 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Hdgfl3Q9JMG7 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Hdgfl3Q9JMG7 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Hdgfl3Q9JMG7 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Hdgfl3Q9JMG7 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Hdgfl3Q9JMG7 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Hdgfl3Q9JMG7 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Hdgfl3Q9JMG7 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Hdgfl3Q9JMG7 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Hdgfl3Q9JMG7 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Hdgfl3Q9JMG7 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Hdgfl3Q9JMG7 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Hdgfl3Q9JMG7 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Hdgfl3Q9JMG7 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Hdgfl3Q9JMG7 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Hdgfl3Q9JMG7 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Hdgfl3Q9JMG7 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Hdgfl3Q9JMG7 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Hdgfl3Q9JMG7 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Hdgfl3Q9JMG7 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Hdgfl3Q9JMG7 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Hdgfl3Q9JMG7 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Hdgfl3Q9JMG7 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Hdgfl3Q9JMG7 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Hdgfl3Q9JMG7 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Hdgfl3Q9JMG7 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Hdgfl3Q9JMG7 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Hdgfl3Q9JMG7 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Hdgfl3Q9JMG7 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Hdgfl3Q9JMG7 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Hdgfl3Q9JMG7 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Hdgfl3Q9JMG7 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Hdgfl3Q9JMG7 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Hdgfl3Q9JMG7 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Hdgfl3Q9JMG7 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Hdgfl3Q9JMG7 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Hdgfl3Q9JMG7 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Hdgfl3Q9JMG7 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Hdgfl3Q9JMG7 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Hdgfl3Q9JMG7 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Hdgfl3Q9JMG7 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Hdgfl3Q9JMG7 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Hdgfl3Q9JMG7 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Hdgfl3Q9JMG7 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Hdgfl3Q9JMG7 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Hdgfl3Q9JMG7 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Hdgfl3Q9JMG7 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Hdgfl3Q9JMG7 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Hdgfl3Q9JMG7 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Hdgfl3Q9JMG7 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Hdgfl3Q9JMG7 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Hdgfl3Q9JMG7 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Hdgfl3Q9JMG7 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Hdgfl3Q9JMG7 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Hdgfl3Q9JMG7 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Hdgfl3Q9JMG7 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Hdgfl3Q9JMG7 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Hdgfl3Q9JMG7 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Hdgfl3Q9JMG7 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Hdgfl3Q9JMG7 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Hdgfl3Q9JMG7 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Hdgfl3Q9JMG7 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Hdgfl3Q9JMG7 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Hdgfl3Q9JMG7 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Hdgfl3Q9JMG7 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms