Protein–RNA interactions for Protein: Q9JME9

Vstm2b, V-set and transmembrane domain-containing protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vstm2bQ9JME9 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vstm2bQ9JME9 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Vstm2bQ9JME9 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vstm2bQ9JME9 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Vstm2bQ9JME9 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vstm2bQ9JME9 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vstm2bQ9JME9 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vstm2bQ9JME9 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vstm2bQ9JME9 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vstm2bQ9JME9 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Vstm2bQ9JME9 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Vstm2bQ9JME9 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vstm2bQ9JME9 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vstm2bQ9JME9 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vstm2bQ9JME9 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vstm2bQ9JME9 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vstm2bQ9JME9 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vstm2bQ9JME9 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vstm2bQ9JME9 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vstm2bQ9JME9 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vstm2bQ9JME9 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vstm2bQ9JME9 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vstm2bQ9JME9 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vstm2bQ9JME9 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vstm2bQ9JME9 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vstm2bQ9JME9 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vstm2bQ9JME9 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vstm2bQ9JME9 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vstm2bQ9JME9 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vstm2bQ9JME9 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Vstm2bQ9JME9 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vstm2bQ9JME9 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vstm2bQ9JME9 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vstm2bQ9JME9 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vstm2bQ9JME9 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vstm2bQ9JME9 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vstm2bQ9JME9 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vstm2bQ9JME9 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vstm2bQ9JME9 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vstm2bQ9JME9 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vstm2bQ9JME9 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vstm2bQ9JME9 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vstm2bQ9JME9 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Vstm2bQ9JME9 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vstm2bQ9JME9 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vstm2bQ9JME9 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vstm2bQ9JME9 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Vstm2bQ9JME9 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vstm2bQ9JME9 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vstm2bQ9JME9 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vstm2bQ9JME9 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vstm2bQ9JME9 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vstm2bQ9JME9 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vstm2bQ9JME9 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vstm2bQ9JME9 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vstm2bQ9JME9 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vstm2bQ9JME9 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vstm2bQ9JME9 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vstm2bQ9JME9 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vstm2bQ9JME9 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vstm2bQ9JME9 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vstm2bQ9JME9 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vstm2bQ9JME9 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vstm2bQ9JME9 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vstm2bQ9JME9 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vstm2bQ9JME9 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vstm2bQ9JME9 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vstm2bQ9JME9 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vstm2bQ9JME9 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vstm2bQ9JME9 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vstm2bQ9JME9 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vstm2bQ9JME9 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vstm2bQ9JME9 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vstm2bQ9JME9 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vstm2bQ9JME9 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vstm2bQ9JME9 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vstm2bQ9JME9 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vstm2bQ9JME9 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vstm2bQ9JME9 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vstm2bQ9JME9 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vstm2bQ9JME9 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vstm2bQ9JME9 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vstm2bQ9JME9 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vstm2bQ9JME9 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vstm2bQ9JME9 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Vstm2bQ9JME9 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vstm2bQ9JME9 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vstm2bQ9JME9 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vstm2bQ9JME9 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vstm2bQ9JME9 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vstm2bQ9JME9 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vstm2bQ9JME9 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vstm2bQ9JME9 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vstm2bQ9JME9 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Vstm2bQ9JME9 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vstm2bQ9JME9 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vstm2bQ9JME9 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Vstm2bQ9JME9 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vstm2bQ9JME9 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vstm2bQ9JME9 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms