Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMC3

Dnaja4, DnaJ homolog subfamily A member 4, mousemouse

Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnaja4Q9JMC3 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dnaja4Q9JMC3 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dnaja4Q9JMC3 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dnaja4Q9JMC3 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dnaja4Q9JMC3 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dnaja4Q9JMC3 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dnaja4Q9JMC3 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dnaja4Q9JMC3 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dnaja4Q9JMC3 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dnaja4Q9JMC3 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dnaja4Q9JMC3 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dnaja4Q9JMC3 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dnaja4Q9JMC3 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dnaja4Q9JMC3 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dnaja4Q9JMC3 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dnaja4Q9JMC3 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dnaja4Q9JMC3 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dnaja4Q9JMC3 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dnaja4Q9JMC3 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dnaja4Q9JMC3 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dnaja4Q9JMC3 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dnaja4Q9JMC3 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dnaja4Q9JMC3 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dnaja4Q9JMC3 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dnaja4Q9JMC3 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dnaja4Q9JMC3 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dnaja4Q9JMC3 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dnaja4Q9JMC3 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dnaja4Q9JMC3 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dnaja4Q9JMC3 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dnaja4Q9JMC3 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Dnaja4Q9JMC3 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dnaja4Q9JMC3 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dnaja4Q9JMC3 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Dnaja4Q9JMC3 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dnaja4Q9JMC3 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dnaja4Q9JMC3 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dnaja4Q9JMC3 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dnaja4Q9JMC3 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dnaja4Q9JMC3 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dnaja4Q9JMC3 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dnaja4Q9JMC3 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dnaja4Q9JMC3 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Dnaja4Q9JMC3 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Dnaja4Q9JMC3 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Dnaja4Q9JMC3 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Dnaja4Q9JMC3 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dnaja4Q9JMC3 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dnaja4Q9JMC3 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dnaja4Q9JMC3 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dnaja4Q9JMC3 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dnaja4Q9JMC3 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dnaja4Q9JMC3 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dnaja4Q9JMC3 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dnaja4Q9JMC3 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dnaja4Q9JMC3 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dnaja4Q9JMC3 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dnaja4Q9JMC3 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dnaja4Q9JMC3 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dnaja4Q9JMC3 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Dnaja4Q9JMC3 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dnaja4Q9JMC3 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dnaja4Q9JMC3 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dnaja4Q9JMC3 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dnaja4Q9JMC3 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dnaja4Q9JMC3 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dnaja4Q9JMC3 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dnaja4Q9JMC3 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dnaja4Q9JMC3 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dnaja4Q9JMC3 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dnaja4Q9JMC3 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dnaja4Q9JMC3 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dnaja4Q9JMC3 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dnaja4Q9JMC3 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dnaja4Q9JMC3 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dnaja4Q9JMC3 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dnaja4Q9JMC3 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dnaja4Q9JMC3 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dnaja4Q9JMC3 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dnaja4Q9JMC3 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dnaja4Q9JMC3 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dnaja4Q9JMC3 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dnaja4Q9JMC3 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dnaja4Q9JMC3 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dnaja4Q9JMC3 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dnaja4Q9JMC3 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dnaja4Q9JMC3 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dnaja4Q9JMC3 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Dnaja4Q9JMC3 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dnaja4Q9JMC3 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dnaja4Q9JMC3 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dnaja4Q9JMC3 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dnaja4Q9JMC3 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dnaja4Q9JMC3 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dnaja4Q9JMC3 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dnaja4Q9JMC3 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dnaja4Q9JMC3 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dnaja4Q9JMC3 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dnaja4Q9JMC3 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dnaja4Q9JMC3 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms