Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL56

Gde1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, mousemouse

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gde1Q9JL56 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gde1Q9JL56 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Gde1Q9JL56 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gde1Q9JL56 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gde1Q9JL56 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gde1Q9JL56 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gde1Q9JL56 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Gde1Q9JL56 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gde1Q9JL56 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gde1Q9JL56 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gde1Q9JL56 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gde1Q9JL56 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gde1Q9JL56 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gde1Q9JL56 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gde1Q9JL56 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gde1Q9JL56 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gde1Q9JL56 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gde1Q9JL56 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gde1Q9JL56 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gde1Q9JL56 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gde1Q9JL56 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Gde1Q9JL56 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Gde1Q9JL56 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Gde1Q9JL56 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Gde1Q9JL56 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gde1Q9JL56 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gde1Q9JL56 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gde1Q9JL56 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gde1Q9JL56 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gde1Q9JL56 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gde1Q9JL56 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gde1Q9JL56 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gde1Q9JL56 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gde1Q9JL56 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Gde1Q9JL56 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gde1Q9JL56 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Gde1Q9JL56 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Gde1Q9JL56 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gde1Q9JL56 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gde1Q9JL56 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gde1Q9JL56 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gde1Q9JL56 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gde1Q9JL56 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gde1Q9JL56 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gde1Q9JL56 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gde1Q9JL56 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gde1Q9JL56 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gde1Q9JL56 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gde1Q9JL56 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gde1Q9JL56 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gde1Q9JL56 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gde1Q9JL56 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gde1Q9JL56 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Gde1Q9JL56 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Gde1Q9JL56 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gde1Q9JL56 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Gde1Q9JL56 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gde1Q9JL56 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gde1Q9JL56 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gde1Q9JL56 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Gde1Q9JL56 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gde1Q9JL56 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gde1Q9JL56 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gde1Q9JL56 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gde1Q9JL56 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gde1Q9JL56 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gde1Q9JL56 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
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Gde1Q9JL56 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gde1Q9JL56 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gde1Q9JL56 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gde1Q9JL56 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gde1Q9JL56 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gde1Q9JL56 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Gde1Q9JL56 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gde1Q9JL56 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gde1Q9JL56 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gde1Q9JL56 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gde1Q9JL56 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gde1Q9JL56 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gde1Q9JL56 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gde1Q9JL56 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gde1Q9JL56 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gde1Q9JL56 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gde1Q9JL56 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gde1Q9JL56 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gde1Q9JL56 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gde1Q9JL56 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gde1Q9JL56 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gde1Q9JL56 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gde1Q9JL56 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gde1Q9JL56 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gde1Q9JL56 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gde1Q9JL56 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gde1Q9JL56 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gde1Q9JL56 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gde1Q9JL56 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gde1Q9JL56 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gde1Q9JL56 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Gde1Q9JL56 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms