Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKY5

Hip1r, Huntingtin-interacting protein 1-related protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,068 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hip1rQ9JKY5 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Hip1rQ9JKY5 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Hip1rQ9JKY5 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Hip1rQ9JKY5 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Hip1rQ9JKY5 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Hip1rQ9JKY5 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Hip1rQ9JKY5 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Hip1rQ9JKY5 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Hip1rQ9JKY5 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Hip1rQ9JKY5 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Hip1rQ9JKY5 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Hip1rQ9JKY5 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Hip1rQ9JKY5 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Hip1rQ9JKY5 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Hip1rQ9JKY5 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Hip1rQ9JKY5 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Hip1rQ9JKY5 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Hip1rQ9JKY5 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Hip1rQ9JKY5 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Hip1rQ9JKY5 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Hip1rQ9JKY5 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Hip1rQ9JKY5 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Hip1rQ9JKY5 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Hip1rQ9JKY5 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Hip1rQ9JKY5 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Hip1rQ9JKY5 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Hip1rQ9JKY5 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Hip1rQ9JKY5 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Hip1rQ9JKY5 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Hip1rQ9JKY5 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Hip1rQ9JKY5 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Hip1rQ9JKY5 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Hip1rQ9JKY5 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Hip1rQ9JKY5 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Hip1rQ9JKY5 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Hip1rQ9JKY5 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Hip1rQ9JKY5 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Hip1rQ9JKY5 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Hip1rQ9JKY5 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Hip1rQ9JKY5 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Hip1rQ9JKY5 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Hip1rQ9JKY5 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Hip1rQ9JKY5 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Hip1rQ9JKY5 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Hip1rQ9JKY5 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Hip1rQ9JKY5 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Hip1rQ9JKY5 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Hip1rQ9JKY5 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Hip1rQ9JKY5 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Hip1rQ9JKY5 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Hip1rQ9JKY5 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Hip1rQ9JKY5 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Hip1rQ9JKY5 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Hip1rQ9JKY5 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Hip1rQ9JKY5 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Hip1rQ9JKY5 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Hip1rQ9JKY5 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Hip1rQ9JKY5 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Hip1rQ9JKY5 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Hip1rQ9JKY5 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Hip1rQ9JKY5 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Hip1rQ9JKY5 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Hip1rQ9JKY5 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Hip1rQ9JKY5 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Hip1rQ9JKY5 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Hip1rQ9JKY5 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Hip1rQ9JKY5 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Hip1rQ9JKY5 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Hip1rQ9JKY5 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Hip1rQ9JKY5 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hip1rQ9JKY5 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hip1rQ9JKY5 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Hip1rQ9JKY5 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hip1rQ9JKY5 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Hip1rQ9JKY5 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hip1rQ9JKY5 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hip1rQ9JKY5 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hip1rQ9JKY5 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hip1rQ9JKY5 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hip1rQ9JKY5 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Hip1rQ9JKY5 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Hip1rQ9JKY5 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Hip1rQ9JKY5 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Hip1rQ9JKY5 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Hip1rQ9JKY5 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Hip1rQ9JKY5 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Hip1rQ9JKY5 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Hip1rQ9JKY5 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Hip1rQ9JKY5 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Hip1rQ9JKY5 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Hip1rQ9JKY5 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Hip1rQ9JKY5 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Hip1rQ9JKY5 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Hip1rQ9JKY5 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Hip1rQ9JKY5 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Hip1rQ9JKY5 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hip1rQ9JKY5 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hip1rQ9JKY5 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hip1rQ9JKY5 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hip1rQ9JKY5 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms