Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKS4

Ldb3, LIM domain-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb3Q9JKS4 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ldb3Q9JKS4 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ldb3Q9JKS4 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ldb3Q9JKS4 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ldb3Q9JKS4 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ldb3Q9JKS4 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ldb3Q9JKS4 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ldb3Q9JKS4 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ldb3Q9JKS4 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ldb3Q9JKS4 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ldb3Q9JKS4 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ldb3Q9JKS4 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ldb3Q9JKS4 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ldb3Q9JKS4 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ldb3Q9JKS4 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ldb3Q9JKS4 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ldb3Q9JKS4 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ldb3Q9JKS4 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ldb3Q9JKS4 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ldb3Q9JKS4 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ldb3Q9JKS4 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ldb3Q9JKS4 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ldb3Q9JKS4 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ldb3Q9JKS4 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ldb3Q9JKS4 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ldb3Q9JKS4 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ldb3Q9JKS4 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ldb3Q9JKS4 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ldb3Q9JKS4 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ldb3Q9JKS4 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ldb3Q9JKS4 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ldb3Q9JKS4 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ldb3Q9JKS4 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ldb3Q9JKS4 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ldb3Q9JKS4 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ldb3Q9JKS4 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ldb3Q9JKS4 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ldb3Q9JKS4 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ldb3Q9JKS4 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ldb3Q9JKS4 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ldb3Q9JKS4 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ldb3Q9JKS4 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ldb3Q9JKS4 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ldb3Q9JKS4 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ldb3Q9JKS4 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ldb3Q9JKS4 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ldb3Q9JKS4 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ldb3Q9JKS4 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ldb3Q9JKS4 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ldb3Q9JKS4 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ldb3Q9JKS4 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ldb3Q9JKS4 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ldb3Q9JKS4 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ldb3Q9JKS4 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ldb3Q9JKS4 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ldb3Q9JKS4 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ldb3Q9JKS4 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ldb3Q9JKS4 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ldb3Q9JKS4 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ldb3Q9JKS4 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ldb3Q9JKS4 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ldb3Q9JKS4 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ldb3Q9JKS4 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ldb3Q9JKS4 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ldb3Q9JKS4 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ldb3Q9JKS4 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ldb3Q9JKS4 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ldb3Q9JKS4 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ldb3Q9JKS4 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ldb3Q9JKS4 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ldb3Q9JKS4 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ldb3Q9JKS4 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ldb3Q9JKS4 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ldb3Q9JKS4 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ldb3Q9JKS4 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ldb3Q9JKS4 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Ldb3Q9JKS4 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ldb3Q9JKS4 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ldb3Q9JKS4 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ldb3Q9JKS4 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ldb3Q9JKS4 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ldb3Q9JKS4 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ldb3Q9JKS4 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ldb3Q9JKS4 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ldb3Q9JKS4 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ldb3Q9JKS4 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ldb3Q9JKS4 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ldb3Q9JKS4 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ldb3Q9JKS4 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ldb3Q9JKS4 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ldb3Q9JKS4 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ldb3Q9JKS4 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ldb3Q9JKS4 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ldb3Q9JKS4 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ldb3Q9JKS4 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ldb3Q9JKS4 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ldb3Q9JKS4 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ldb3Q9JKS4 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ldb3Q9JKS4 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ldb3Q9JKS4 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms