Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKQ4

Irx5, Iroquois-class homeodomain protein IRX-5, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx5Q9JKQ4 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Irx5Q9JKQ4 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Irx5Q9JKQ4 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Irx5Q9JKQ4 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Irx5Q9JKQ4 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Irx5Q9JKQ4 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Irx5Q9JKQ4 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Irx5Q9JKQ4 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Irx5Q9JKQ4 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Irx5Q9JKQ4 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Irx5Q9JKQ4 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Irx5Q9JKQ4 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Irx5Q9JKQ4 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Irx5Q9JKQ4 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Irx5Q9JKQ4 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Irx5Q9JKQ4 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Irx5Q9JKQ4 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Irx5Q9JKQ4 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Irx5Q9JKQ4 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Irx5Q9JKQ4 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Irx5Q9JKQ4 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Irx5Q9JKQ4 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Irx5Q9JKQ4 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Irx5Q9JKQ4 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Irx5Q9JKQ4 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Irx5Q9JKQ4 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Irx5Q9JKQ4 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Irx5Q9JKQ4 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Irx5Q9JKQ4 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Irx5Q9JKQ4 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Irx5Q9JKQ4 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Irx5Q9JKQ4 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Irx5Q9JKQ4 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Irx5Q9JKQ4 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Irx5Q9JKQ4 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Irx5Q9JKQ4 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Irx5Q9JKQ4 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Irx5Q9JKQ4 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Irx5Q9JKQ4 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Irx5Q9JKQ4 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Irx5Q9JKQ4 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Irx5Q9JKQ4 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Irx5Q9JKQ4 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Irx5Q9JKQ4 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Irx5Q9JKQ4 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Irx5Q9JKQ4 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Irx5Q9JKQ4 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Irx5Q9JKQ4 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Irx5Q9JKQ4 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Irx5Q9JKQ4 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Irx5Q9JKQ4 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Irx5Q9JKQ4 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Irx5Q9JKQ4 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Irx5Q9JKQ4 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Irx5Q9JKQ4 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Irx5Q9JKQ4 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Irx5Q9JKQ4 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Irx5Q9JKQ4 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Irx5Q9JKQ4 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Irx5Q9JKQ4 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Irx5Q9JKQ4 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Irx5Q9JKQ4 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Irx5Q9JKQ4 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Irx5Q9JKQ4 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Irx5Q9JKQ4 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Irx5Q9JKQ4 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Irx5Q9JKQ4 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Irx5Q9JKQ4 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Irx5Q9JKQ4 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Irx5Q9JKQ4 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Irx5Q9JKQ4 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Irx5Q9JKQ4 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Irx5Q9JKQ4 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Irx5Q9JKQ4 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Irx5Q9JKQ4 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Irx5Q9JKQ4 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Irx5Q9JKQ4 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Irx5Q9JKQ4 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Irx5Q9JKQ4 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Irx5Q9JKQ4 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Irx5Q9JKQ4 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Irx5Q9JKQ4 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Irx5Q9JKQ4 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Irx5Q9JKQ4 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Irx5Q9JKQ4 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Irx5Q9JKQ4 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Irx5Q9JKQ4 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Irx5Q9JKQ4 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Irx5Q9JKQ4 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Irx5Q9JKQ4 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Irx5Q9JKQ4 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Irx5Q9JKQ4 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Irx5Q9JKQ4 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Irx5Q9JKQ4 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Irx5Q9JKQ4 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Irx5Q9JKQ4 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Irx5Q9JKQ4 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Irx5Q9JKQ4 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Irx5Q9JKQ4 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Irx5Q9JKQ4 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms