Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKN6

Nova1, RNA-binding protein Nova-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nova1Q9JKN6 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nova1Q9JKN6 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nova1Q9JKN6 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Nova1Q9JKN6 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Nova1Q9JKN6 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Nova1Q9JKN6 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Nova1Q9JKN6 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nova1Q9JKN6 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nova1Q9JKN6 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nova1Q9JKN6 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Nova1Q9JKN6 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nova1Q9JKN6 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nova1Q9JKN6 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nova1Q9JKN6 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nova1Q9JKN6 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nova1Q9JKN6 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nova1Q9JKN6 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nova1Q9JKN6 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nova1Q9JKN6 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nova1Q9JKN6 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nova1Q9JKN6 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nova1Q9JKN6 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Nova1Q9JKN6 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nova1Q9JKN6 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nova1Q9JKN6 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nova1Q9JKN6 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nova1Q9JKN6 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nova1Q9JKN6 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nova1Q9JKN6 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nova1Q9JKN6 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Nova1Q9JKN6 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nova1Q9JKN6 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nova1Q9JKN6 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nova1Q9JKN6 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nova1Q9JKN6 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nova1Q9JKN6 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nova1Q9JKN6 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nova1Q9JKN6 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nova1Q9JKN6 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nova1Q9JKN6 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nova1Q9JKN6 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nova1Q9JKN6 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nova1Q9JKN6 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nova1Q9JKN6 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nova1Q9JKN6 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nova1Q9JKN6 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nova1Q9JKN6 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nova1Q9JKN6 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nova1Q9JKN6 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nova1Q9JKN6 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nova1Q9JKN6 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nova1Q9JKN6 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nova1Q9JKN6 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nova1Q9JKN6 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nova1Q9JKN6 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nova1Q9JKN6 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nova1Q9JKN6 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nova1Q9JKN6 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nova1Q9JKN6 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nova1Q9JKN6 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nova1Q9JKN6 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nova1Q9JKN6 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nova1Q9JKN6 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nova1Q9JKN6 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nova1Q9JKN6 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nova1Q9JKN6 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nova1Q9JKN6 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nova1Q9JKN6 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nova1Q9JKN6 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nova1Q9JKN6 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nova1Q9JKN6 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nova1Q9JKN6 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nova1Q9JKN6 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Nova1Q9JKN6 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nova1Q9JKN6 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nova1Q9JKN6 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nova1Q9JKN6 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nova1Q9JKN6 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nova1Q9JKN6 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nova1Q9JKN6 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nova1Q9JKN6 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nova1Q9JKN6 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nova1Q9JKN6 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nova1Q9JKN6 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Nova1Q9JKN6 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nova1Q9JKN6 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nova1Q9JKN6 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nova1Q9JKN6 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Nova1Q9JKN6 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nova1Q9JKN6 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nova1Q9JKN6 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nova1Q9JKN6 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nova1Q9JKN6 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nova1Q9JKN6 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nova1Q9JKN6 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nova1Q9JKN6 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nova1Q9JKN6 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nova1Q9JKN6 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nova1Q9JKN6 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nova1Q9JKN6 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms